水稻OsABCB11基因功能研究
發(fā)布時間:2021-01-16 06:42
植物ABCB轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白是生長素三大轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白之一,在植物的生長發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用。目前單子葉植物水稻中ABCB家族基因的功能報道很少,而ABCB蛋白功能的探究對進(jìn)一步認(rèn)識生長素信號通路及其在生長發(fā)育中的作用至關(guān)重要。OsABCB11是水稻ABCB家族的成員之一,功能完全未知。啟動子序列分析發(fā)現(xiàn)其中存在多個激素響應(yīng)元件及脅迫響應(yīng)元件,通過瞬時處理進(jìn)一步證明OsABCB11基因的表達(dá)受到IAA、PEG及NaCl的誘導(dǎo),表明OsABCB11可能在生長素及脅迫響應(yīng)通路中發(fā)揮作用。本研究構(gòu)建了OsABCB11-eGFP融合蛋白的表達(dá)載體,通過煙草瞬時侵染及水稻原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),證明OsABCB11蛋白定位于細(xì)胞質(zhì)膜。通過對OsABCB11的時空表達(dá)模式進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)OsABCB11在水稻生長發(fā)育的各個時期均有表達(dá),在莖、根莖結(jié)合部、幼穗及節(jié)中的表達(dá)量較高。為進(jìn)一步探究OsABCB11在水稻生長發(fā)育中的作用,本研究構(gòu)建了2個超表達(dá)株系(11OE-01和11OE-02)以及2個基因敲除株系(11-cr-12,11-cr-34),農(nóng)藝性狀觀察發(fā)現(xiàn)OsABCB11超表達(dá)株系表現(xiàn)出分蘗角增大、總分蘗及有效...
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
ABCB轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白結(jié)構(gòu)模型(A)ABCB全分子轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白結(jié)構(gòu)模型;(B)ABCB半分子轉(zhuǎn)
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章OsABCB11基因表達(dá)模式及功能研究26通過TMHMM在線分析工具對OsABCB11轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行跨膜結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),預(yù)測結(jié)果顯示該蛋白包含11個跨膜結(jié)構(gòu)域(圖2.1)。圖2.1OsABCB11蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測。圖中紅色部分表示預(yù)測的跨膜區(qū)域。Figure2.1PredictionofthetransmembranedomainofOsABCB11protein.Theredpartinthefigureindicatesthepredictedtransmembranearea.2.2.2瞬時處理對OsABCB11基因表達(dá)量的影響啟動子分析顯示OsABCB11啟動子序列中包含多個生長素響應(yīng)元件,另外還包含赤霉素、茉莉酸甲酯等其他激素響應(yīng)元件以及脅迫響應(yīng)元件。因此推測OsABCB11基因可能參與生長素信號通路,并且可能在多種激素通路的信號交叉中發(fā)揮作用;另外,OsABCB11基因也可能在水稻的逆境脅迫在發(fā)揮作用。因此研究中對野生型水稻(NIP)進(jìn)行瞬時處理,通過檢測OsABCB11基因的表達(dá)量驗(yàn)證其功能。2.2.2.1IAA誘導(dǎo)OsABCB11基因表達(dá)將野生型水稻(NIP)在正常的水稻營養(yǎng)液中培養(yǎng)7d,用終濃度為10μM的IAA瞬時處理野生型水稻,并在處理時間為0h、2h、6h、12h、24h時取樣,將樣品用液氮速凍,提取樣品RNA并反轉(zhuǎn)錄為cDNA,進(jìn)行實(shí)時熒光定量PCR檢測。分析結(jié)果顯示,OsABCB11基因受到IAA的誘導(dǎo),在處理12h后表達(dá)量達(dá)最高值,從趨勢上看OsABCB11表達(dá)水平呈現(xiàn)先緩慢上升達(dá)到最高值后下降的趨勢(圖2.2)。這表明OsABCB11能夠參與生長素信號通路,其響應(yīng)最高峰在處理后12h左右,表明其可能是生長素響應(yīng)后期基因。
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章OsABCB11基因表達(dá)模式及功能研究27圖2.210μMIAA的處理不同時間對OsABCB11基因表達(dá)的影響。選取苗齡為7d的野生型水稻進(jìn)行處理,在處理后0h、2h、6h、12h、24h取樣,取整株水稻檢測基因的相對表達(dá)量。數(shù)據(jù)為均值±SD(n=3),不同字母表示在p<0.05時數(shù)據(jù)間有顯著差異。Figure2.2ExpressionofOsABCB11in10μMIAAatindicatedtimeintervals.Thewild-typericewithaseedlingageof7dayswasselectedfortreatment.Samplesweretakenat0h,2h,6h,12h,and24haftertreatment,andtherelativeexpressionlevelsofthedetectedgenesinthewholeplantweretaken.Thedataaremean±SD(n=3),anddifferentlettersindicateasignificantdifferenceamongthesedataatp<0.05.2.2.2.2鹽脅迫及干旱脅迫誘導(dǎo)OsABCB11基因表達(dá)研究中對水稻也進(jìn)行了瞬時的脅迫處理,將野生型水稻在正常的水稻營養(yǎng)液中培養(yǎng)7d,再分別用終濃度為30%的PEG6000及150mMNaCl瞬時處理,在處理時間為0h、2h、6h、12h時取樣,取樣后迅速放入液氮中速凍,將取好的樣品提取RNA,反轉(zhuǎn)獲得cDNA,進(jìn)行實(shí)時熒光定量檢測。數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示,OsABCB11基因的表達(dá)受到模擬干旱脅迫及鹽脅迫的誘導(dǎo)(圖2.3),推測該基因可能參與到脅迫響應(yīng)的通路中。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]生長素介導(dǎo)環(huán)境信號調(diào)控植物的生長發(fā)育[J]. 劉廣超,丁兆軍. 植物學(xué)報. 2018(01)
[2]水稻ABCB轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因的分子進(jìn)化和表達(dá)分析[J]. 徐杏,邱杰,徐揚(yáng),徐辰武. 中國水稻科學(xué). 2012(02)
[3]光周期和有效積溫對水稻分蘗角度動態(tài)變化的影響[J]. 歐陽由男,李春生,章善慶,王會民,朱練峰,禹盛苗,金千瑜,張國平. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2009(05)
[4]LAZY1 controls rice shoot gravitropism through regulating polar auxin transport[J]. Peijin Li1;Yonghong Wang1;Qian Qian2;Zhiming Fu1;Mei Wang1;Dali Zeng1,2;Baohua Li1;Xiujie Wang1;Jiayang Li11 State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China2 State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310006, China. Cell Research. 2007(05)
[5]不同栽培條件下水稻分蘗角度動態(tài)變化分析[J]. 于亞輝,徐正進(jìn). 中國農(nóng)學(xué)通報. 2006(03)
碩士論文
[1]水稻分蘗形成的內(nèi)外調(diào)控機(jī)制研究[D]. 張玉磊.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]分蘗角度動態(tài)型水稻的形態(tài)特征與生理生態(tài)效應(yīng)研究[D]. 康文啟.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2007
本文編號:2980345
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
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【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
ABCB轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白結(jié)構(gòu)模型(A)ABCB全分子轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白結(jié)構(gòu)模型;(B)ABCB半分子轉(zhuǎn)
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章OsABCB11基因表達(dá)模式及功能研究26通過TMHMM在線分析工具對OsABCB11轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行跨膜結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),預(yù)測結(jié)果顯示該蛋白包含11個跨膜結(jié)構(gòu)域(圖2.1)。圖2.1OsABCB11蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測。圖中紅色部分表示預(yù)測的跨膜區(qū)域。Figure2.1PredictionofthetransmembranedomainofOsABCB11protein.Theredpartinthefigureindicatesthepredictedtransmembranearea.2.2.2瞬時處理對OsABCB11基因表達(dá)量的影響啟動子分析顯示OsABCB11啟動子序列中包含多個生長素響應(yīng)元件,另外還包含赤霉素、茉莉酸甲酯等其他激素響應(yīng)元件以及脅迫響應(yīng)元件。因此推測OsABCB11基因可能參與生長素信號通路,并且可能在多種激素通路的信號交叉中發(fā)揮作用;另外,OsABCB11基因也可能在水稻的逆境脅迫在發(fā)揮作用。因此研究中對野生型水稻(NIP)進(jìn)行瞬時處理,通過檢測OsABCB11基因的表達(dá)量驗(yàn)證其功能。2.2.2.1IAA誘導(dǎo)OsABCB11基因表達(dá)將野生型水稻(NIP)在正常的水稻營養(yǎng)液中培養(yǎng)7d,用終濃度為10μM的IAA瞬時處理野生型水稻,并在處理時間為0h、2h、6h、12h、24h時取樣,將樣品用液氮速凍,提取樣品RNA并反轉(zhuǎn)錄為cDNA,進(jìn)行實(shí)時熒光定量PCR檢測。分析結(jié)果顯示,OsABCB11基因受到IAA的誘導(dǎo),在處理12h后表達(dá)量達(dá)最高值,從趨勢上看OsABCB11表達(dá)水平呈現(xiàn)先緩慢上升達(dá)到最高值后下降的趨勢(圖2.2)。這表明OsABCB11能夠參與生長素信號通路,其響應(yīng)最高峰在處理后12h左右,表明其可能是生長素響應(yīng)后期基因。
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章OsABCB11基因表達(dá)模式及功能研究27圖2.210μMIAA的處理不同時間對OsABCB11基因表達(dá)的影響。選取苗齡為7d的野生型水稻進(jìn)行處理,在處理后0h、2h、6h、12h、24h取樣,取整株水稻檢測基因的相對表達(dá)量。數(shù)據(jù)為均值±SD(n=3),不同字母表示在p<0.05時數(shù)據(jù)間有顯著差異。Figure2.2ExpressionofOsABCB11in10μMIAAatindicatedtimeintervals.Thewild-typericewithaseedlingageof7dayswasselectedfortreatment.Samplesweretakenat0h,2h,6h,12h,and24haftertreatment,andtherelativeexpressionlevelsofthedetectedgenesinthewholeplantweretaken.Thedataaremean±SD(n=3),anddifferentlettersindicateasignificantdifferenceamongthesedataatp<0.05.2.2.2.2鹽脅迫及干旱脅迫誘導(dǎo)OsABCB11基因表達(dá)研究中對水稻也進(jìn)行了瞬時的脅迫處理,將野生型水稻在正常的水稻營養(yǎng)液中培養(yǎng)7d,再分別用終濃度為30%的PEG6000及150mMNaCl瞬時處理,在處理時間為0h、2h、6h、12h時取樣,取樣后迅速放入液氮中速凍,將取好的樣品提取RNA,反轉(zhuǎn)獲得cDNA,進(jìn)行實(shí)時熒光定量檢測。數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示,OsABCB11基因的表達(dá)受到模擬干旱脅迫及鹽脅迫的誘導(dǎo)(圖2.3),推測該基因可能參與到脅迫響應(yīng)的通路中。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]生長素介導(dǎo)環(huán)境信號調(diào)控植物的生長發(fā)育[J]. 劉廣超,丁兆軍. 植物學(xué)報. 2018(01)
[2]水稻ABCB轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因的分子進(jìn)化和表達(dá)分析[J]. 徐杏,邱杰,徐揚(yáng),徐辰武. 中國水稻科學(xué). 2012(02)
[3]光周期和有效積溫對水稻分蘗角度動態(tài)變化的影響[J]. 歐陽由男,李春生,章善慶,王會民,朱練峰,禹盛苗,金千瑜,張國平. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2009(05)
[4]LAZY1 controls rice shoot gravitropism through regulating polar auxin transport[J]. Peijin Li1;Yonghong Wang1;Qian Qian2;Zhiming Fu1;Mei Wang1;Dali Zeng1,2;Baohua Li1;Xiujie Wang1;Jiayang Li11 State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China2 State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310006, China. Cell Research. 2007(05)
[5]不同栽培條件下水稻分蘗角度動態(tài)變化分析[J]. 于亞輝,徐正進(jìn). 中國農(nóng)學(xué)通報. 2006(03)
碩士論文
[1]水稻分蘗形成的內(nèi)外調(diào)控機(jī)制研究[D]. 張玉磊.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]分蘗角度動態(tài)型水稻的形態(tài)特征與生理生態(tài)效應(yīng)研究[D]. 康文啟.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2007
本文編號:2980345
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