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刺參生殖相關(guān)神經(jīng)肽挖掘及特征研究

發(fā)布時(shí)間:2020-12-19 19:19
  本論文以刺參生殖發(fā)育相關(guān)神經(jīng)肽的功能基因篩選及活性研究為核心,通過(guò)生物信息學(xué)分析、分子克隆、細(xì)胞水平的活性驗(yàn)證及生理功能評(píng)價(jià),開(kāi)展較為系統(tǒng)的研究探索,以期為刺參生殖發(fā)育的神經(jīng)內(nèi)分泌調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)。具體基于刺參基因組、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)篩選到4條刺參生殖發(fā)育相關(guān)神經(jīng)肽編碼基因,并重點(diǎn)圍繞刺參Kisspeptin神經(jīng)肽,初步闡明了分子結(jié)構(gòu)、活性特征及生理功能。主要研究成果如下:1、篩選獲得4條刺參生殖調(diào)控相關(guān)的神經(jīng)肽樣蛋白編碼基因序列(AjKisspeptin、NPS/CCAP型肽(NG)、F-likeSALMF(FS)、L-likeSALMF(LS))。其中刺參kisspepetin前體肽ORF區(qū)長(zhǎng)543bp,預(yù)測(cè)編碼180個(gè)氨基酸長(zhǎng)度的前體肽,包含長(zhǎng)23aa信號(hào)肽、兩段長(zhǎng)度分別為32aa(AjKiss1a(AGSLDcEDVERRGRQPNRNAHYRTLPF-NH2))和18aa(AjKiss1b(SAVKNKNKSRARPPLLPF-NH2))的成熟肽。預(yù)測(cè)其前體肽的等電點(diǎn)(pI)為4.90,分子量(Mw)為20.283 kD。通過(guò)熒光定量基因... 

【文章來(lái)源】:浙江海洋大學(xué)浙江省

【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

刺參生殖相關(guān)神經(jīng)肽挖掘及特征研究


以HPG軸為核心的生殖調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型

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技術(shù)路線

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刺參生殖相關(guān)神經(jīng)肽發(fā)掘及功能研究16圖2.1AjKisspeptin前體肽編碼基因的編碼區(qū)及預(yù)測(cè)的氨基酸序列。藍(lán)色表示信號(hào)肽,方框表示起始密碼子,星號(hào)表示終止密碼子,綠色方框表示預(yù)測(cè)到的切割位點(diǎn),紅色方框表示成熟肽,黃色方框表示切割后殘留的C端甘氨酸殘基Fig2.1TheCDSandpredictedaminoacidsequenceoftheAjKisspeptinprecursorgene.Blueindicatessignalpeptide,boxindicatesstartcodon,asteriskindicatesstopcodon,greenboxindicatespredictedcleavagesite,redboxindicatesmaturepeptide,yellowboxindicatesC-terminalglycineremainingaftercleavageResidues2.3.1.2氨基酸同源性和系統(tǒng)發(fā)育分析為了探究新發(fā)的AjKisspeptin與其它物種Kisspeptin的近緣關(guān)系,從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選到8條不同物種的Kisspeptin氨基酸序列(負(fù)鼠(Monodelphisdomestic)、智人(Homosapines)、非洲爪蟾(Xenopuslaevis)、石斑魚(yú)(Epinehelusbruneus)、金魚(yú)(Carassiusauratus)、斑馬魚(yú)(Daniorerio)、海星(Ophionotunvictorae))用MEGA5.0軟件,以最大似然法(ML),重復(fù)1000次,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖2.2)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),Kisspeptin在進(jìn)化中明顯的分為兩支,一支是脊椎動(dòng)物分支,另一支為無(wú)脊椎動(dòng)物分支,恰好與這些動(dòng)物類群的分類階元和進(jìn)化地位相一致。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):2926435

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