甜瓜CmbHLH93和CmbHLH130基因在果實(shí)發(fā)育中的作用
發(fā)布時間：2020-12-17 05:51
甜瓜是一種在全世界范圍內(nèi)被廣泛栽培的經(jīng)濟(jì)價值極高的園藝作物。同時也是研究植物性別分化和果實(shí)成熟過程的葫蘆科模式植物之一。本研究選用種植于內(nèi)蒙古自治區(qū)巴彥淖爾市河套地區(qū)的甜瓜品種河套蜜瓜（Cucumis melo L.cv Hetao melon）作為研究材料。對甜瓜轉(zhuǎn)錄因子bHLH家族進(jìn)行系統(tǒng)分析,并通過實(shí)驗(yàn)室已獲得的甜瓜果實(shí)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挑選了兩個在果實(shí)不同發(fā)育時期高效表達(dá)的基因CmbHLH93和CmbHLH130進(jìn)行研究。主要結(jié)果如下:（1）通過生物信息學(xué)方法,在甜瓜全基因組中共鑒定到bHLH基因家族成員160個,編碼213個蛋白質(zhì)。根據(jù)甜瓜bHLH基因結(jié)構(gòu)將內(nèi)含子分布模式分為13種。染色體定位表明CmbHLH93和CmbHLH130基因分別位于甜瓜3號和1號染色體。利用氨基酸序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹將bHLH家族分為18個亞族,其中CmbHLH93和CmbHLH130蛋白分別屬于第18和8亞族;序列分析表明7-18亞族保守性較高。甜瓜bHLH蛋白具有HLH或bHLH-MYC-N結(jié)構(gòu)域,10個成員還具有ACT結(jié)構(gòu)域。氨基酸保守基序分析表明,甜瓜bHLH蛋白具有motif1或motif2基...
【文章來源】：內(nèi)蒙古大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】：116 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
植物轉(zhuǎn)錄因子家族[4]
?槌桑?庥兄?赽HLH蛋白形成同二聚體或異二聚體復(fù)合物[42,43]。在bHLH蛋白結(jié)構(gòu)域中，有19個(其中5個位于堿性區(qū)，5個位于第一螺旋，1個位于環(huán)區(qū)，8個位于第二螺旋)氨基酸是保守的，這對DNA結(jié)合或二聚體形成起重要作用。一個高度保守的HER基序(His5-Glu9-Arg13)被認(rèn)為對結(jié)合特定的DNA序列很重要，但是一些非典型的bHLH缺乏N-端結(jié)合區(qū)[44]。bHLH蛋白二聚化和對不同E-box的識別為其調(diào)節(jié)不同的轉(zhuǎn)錄程序提供了多樣性，HLH蛋白還可以通過與DNA結(jié)合的bHLH蛋白形成非DNA結(jié)合的異源二聚體而發(fā)揮bHLH蛋白的負(fù)調(diào)控作用(圖1.2)[39,45]。圖1.2bHLH蛋白的結(jié)構(gòu)模型[39,45]Figure1.2ThestructuralmodelofbHLHproteins[39,45]1.2.3bHLH蛋白的功能在過去的幾十年里，在幾個物種上對bHLH蛋白的特性和功能進(jìn)行了深刻而廣泛的研究。作為最大的TF家族之一，bHLH基因參與調(diào)控植物的生長發(fā)育、非生物/生物脅迫、激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、鐵的動態(tài)平衡、次生代謝等[46-50]。酵母bHLH蛋白在增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄和調(diào)控細(xì)胞周期中的
?槌桑?庥兄?赽HLH蛋白形成同二聚體或異二聚體復(fù)合物[42,43]。在bHLH蛋白結(jié)構(gòu)域中，有19個(其中5個位于堿性區(qū)，5個位于第一螺旋，1個位于環(huán)區(qū)，8個位于第二螺旋)氨基酸是保守的，這對DNA結(jié)合或二聚體形成起重要作用。一個高度保守的HER基序(His5-Glu9-Arg13)被認(rèn)為對結(jié)合特定的DNA序列很重要，但是一些非典型的bHLH缺乏N-端結(jié)合區(qū)[44]。bHLH蛋白二聚化和對不同E-box的識別為其調(diào)節(jié)不同的轉(zhuǎn)錄程序提供了多樣性，HLH蛋白還可以通過與DNA結(jié)合的bHLH蛋白形成非DNA結(jié)合的異源二聚體而發(fā)揮bHLH蛋白的負(fù)調(diào)控作用(圖1.2)[39,45]。圖1.2bHLH蛋白的結(jié)構(gòu)模型[39,45]Figure1.2ThestructuralmodelofbHLHproteins[39,45]1.2.3bHLH蛋白的功能在過去的幾十年里，在幾個物種上對bHLH蛋白的特性和功能進(jìn)行了深刻而廣泛的研究。作為最大的TF家族之一，bHLH基因參與調(diào)控植物的生長發(fā)育、非生物/生物脅迫、激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、鐵的動態(tài)平衡、次生代謝等[46-50]。酵母bHLH蛋白在增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄和調(diào)控細(xì)胞周期中的
本文編號：2921515
【文章來源】：內(nèi)蒙古大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】：116 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
植物轉(zhuǎn)錄因子家族[4]
?槌桑?庥兄?赽HLH蛋白形成同二聚體或異二聚體復(fù)合物[42,43]。在bHLH蛋白結(jié)構(gòu)域中，有19個(其中5個位于堿性區(qū)，5個位于第一螺旋，1個位于環(huán)區(qū)，8個位于第二螺旋)氨基酸是保守的，這對DNA結(jié)合或二聚體形成起重要作用。一個高度保守的HER基序(His5-Glu9-Arg13)被認(rèn)為對結(jié)合特定的DNA序列很重要，但是一些非典型的bHLH缺乏N-端結(jié)合區(qū)[44]。bHLH蛋白二聚化和對不同E-box的識別為其調(diào)節(jié)不同的轉(zhuǎn)錄程序提供了多樣性，HLH蛋白還可以通過與DNA結(jié)合的bHLH蛋白形成非DNA結(jié)合的異源二聚體而發(fā)揮bHLH蛋白的負(fù)調(diào)控作用(圖1.2)[39,45]。圖1.2bHLH蛋白的結(jié)構(gòu)模型[39,45]Figure1.2ThestructuralmodelofbHLHproteins[39,45]1.2.3bHLH蛋白的功能在過去的幾十年里，在幾個物種上對bHLH蛋白的特性和功能進(jìn)行了深刻而廣泛的研究。作為最大的TF家族之一，bHLH基因參與調(diào)控植物的生長發(fā)育、非生物/生物脅迫、激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、鐵的動態(tài)平衡、次生代謝等[46-50]。酵母bHLH蛋白在增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄和調(diào)控細(xì)胞周期中的
?槌桑?庥兄?赽HLH蛋白形成同二聚體或異二聚體復(fù)合物[42,43]。在bHLH蛋白結(jié)構(gòu)域中，有19個(其中5個位于堿性區(qū)，5個位于第一螺旋，1個位于環(huán)區(qū)，8個位于第二螺旋)氨基酸是保守的，這對DNA結(jié)合或二聚體形成起重要作用。一個高度保守的HER基序(His5-Glu9-Arg13)被認(rèn)為對結(jié)合特定的DNA序列很重要，但是一些非典型的bHLH缺乏N-端結(jié)合區(qū)[44]。bHLH蛋白二聚化和對不同E-box的識別為其調(diào)節(jié)不同的轉(zhuǎn)錄程序提供了多樣性，HLH蛋白還可以通過與DNA結(jié)合的bHLH蛋白形成非DNA結(jié)合的異源二聚體而發(fā)揮bHLH蛋白的負(fù)調(diào)控作用(圖1.2)[39,45]。圖1.2bHLH蛋白的結(jié)構(gòu)模型[39,45]Figure1.2ThestructuralmodelofbHLHproteins[39,45]1.2.3bHLH蛋白的功能在過去的幾十年里，在幾個物種上對bHLH蛋白的特性和功能進(jìn)行了深刻而廣泛的研究。作為最大的TF家族之一，bHLH基因參與調(diào)控植物的生長發(fā)育、非生物/生物脅迫、激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、鐵的動態(tài)平衡、次生代謝等[46-50]。酵母bHLH蛋白在增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄和調(diào)控細(xì)胞周期中的
本文編號：2921515
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