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鮸魚(yú)DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究

發(fā)布時(shí)間:2020-12-13 10:22
  TLR-IL-1R(Toll-like receptor-interleukin 1 receptor signaling,TIR)超家族成員在介導(dǎo)的先天性免疫反應(yīng)中起著重要作用,其家族成員胞內(nèi)都含有一個(gè)保守的TIR結(jié)構(gòu)域。DIGIRR(Double-Ig-IL-1R Related Molecule)是TIL-IL-1R受體超家族成員之一,作為IL-1信號(hào)通路的負(fù)調(diào)控因子,在免疫系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用。在本研究中,我們鑒定并表征了鮸魚(yú)(Miichthys miiuy)DIGIRR(mmi-DIGIRR)基因的cDNA序列。mmi-DIGIRR cDNA全長(zhǎng)1837bp,包括211bp的5’UTR、1575bp的開(kāi)放閱讀框(ORF),編碼524個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)和51bp的3’UTR。mmi-DIGIRR的分子量為59.43 KDa,理論等電點(diǎn)為6.16。mmi-DIGIRR具有IL-IR受體家族共同的特征,其蛋白結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的兩個(gè)免疫蛋白(immunoglobulin,Ig)結(jié)構(gòu)域兩個(gè)部分組成。除此之外,mmi-DIGIRR在胞外區(qū)還有長(zhǎng)16個(gè)氨基酸的信號(hào)肽序列... 

【文章來(lái)源】:浙江海洋大學(xué)浙江省

【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

鮸魚(yú)DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究


mmi-DIGIRR的基因序列

魚(yú)類(lèi),基因,結(jié)構(gòu)域


鮸魚(yú)DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究26圖3-2魚(yú)類(lèi)DIGIRR的基因結(jié)構(gòu)Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.對(duì)于哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚(yú)類(lèi)DIGIRR基因的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域進(jìn)行比較,如圖3-3,結(jié)果表明,DIGIRR/SIGIRR不僅有TIR家族的特征,也有作為Ig結(jié)構(gòu)域受體亞家族成員的特征。哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚(yú)類(lèi)DIGIRR基因蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的Ig結(jié)構(gòu)域組成,但I(xiàn)g結(jié)構(gòu)域的數(shù)量不同,哺乳動(dòng)物SIGIRR基因只含有一個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域,魚(yú)類(lèi)DIGIRR基因含有兩個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域,此外,魚(yú)類(lèi)DIGIRR基因在N-端還有信號(hào)肽區(qū)域。圖3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白結(jié)構(gòu)域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸魚(yú)DIGIRR基因的線(xiàn)性分析和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建我們利用魚(yú)類(lèi)基因組數(shù)據(jù)對(duì)鮸魚(yú)DIGIRR、其他魚(yú)類(lèi)SIGIRR/DIGIRR與哺乳動(dòng)物和鳥(niǎo)類(lèi)的SIGIRR進(jìn)行線(xiàn)性分析,結(jié)果見(jiàn)圖3-4。DIGIRR基因在不同物種中的線(xiàn)性分析進(jìn)一步證實(shí)了DIGIRR基因的位置。從結(jié)果可以看出,DIGIRR/SIGIRR基因線(xiàn)性關(guān)

結(jié)構(gòu)域,蛋白,基因,魚(yú)類(lèi)


鮸魚(yú)DIGIRR基因特征、功能及調(diào)控研究26圖3-2魚(yú)類(lèi)DIGIRR的基因結(jié)構(gòu)Fig3.2GenomicstructureofDIGIRRinmiiuycroakerandotherfishwhiteboxesrepresentUTR,blackboxesrepresentCDS,intronsarerepresentedbylines.對(duì)于哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚(yú)類(lèi)DIGIRR基因的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域進(jìn)行比較,如圖3-3,結(jié)果表明,DIGIRR/SIGIRR不僅有TIR家族的特征,也有作為Ig結(jié)構(gòu)域受體亞家族成員的特征。哺乳動(dòng)物SIGIRR基因和魚(yú)類(lèi)DIGIRR基因蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域主要由胞內(nèi)保守的TIR結(jié)構(gòu)域和胞外的Ig結(jié)構(gòu)域組成,但I(xiàn)g結(jié)構(gòu)域的數(shù)量不同,哺乳動(dòng)物SIGIRR基因只含有一個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域,魚(yú)類(lèi)DIGIRR基因含有兩個(gè)Ig結(jié)構(gòu)域,此外,魚(yú)類(lèi)DIGIRR基因在N-端還有信號(hào)肽區(qū)域。圖3-3DIGIRR/SIGIRR蛋白結(jié)構(gòu)域Fig3.3ProteindomainofSIGIRR/DIGIRR3.2鮸魚(yú)DIGIRR基因的線(xiàn)性分析和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建我們利用魚(yú)類(lèi)基因組數(shù)據(jù)對(duì)鮸魚(yú)DIGIRR、其他魚(yú)類(lèi)SIGIRR/DIGIRR與哺乳動(dòng)物和鳥(niǎo)類(lèi)的SIGIRR進(jìn)行線(xiàn)性分析,結(jié)果見(jiàn)圖3-4。DIGIRR基因在不同物種中的線(xiàn)性分析進(jìn)一步證實(shí)了DIGIRR基因的位置。從結(jié)果可以看出,DIGIRR/SIGIRR基因線(xiàn)性關(guān)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]魚(yú)類(lèi)TLR1和DIGIRR基因的克隆和表達(dá)研究[D]. 武小媛.浙江大學(xué) 2007
[2]IL-1RI、IL-1RII、IL-1RAcP在骨性關(guān)節(jié)炎滑膜中的表達(dá)及其生物學(xué)意義[D]. 張青松.華中科技大學(xué) 2006



本文編號(hào):2914392

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