發(fā)布時(shí)間：2017-04-01 20:06

  本文關(guān)鍵詞：中國(guó)沿海真帽貝分類(lèi)及美女蛤隱存種研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：1.中國(guó)沿海真帽貝形態(tài)學(xué)研究真帽貝,即Patellogastropoda目的帽貝,隸屬于軟體動(dòng)物門(mén)(Mollusca)、腹足綱(Gastropoda),廣泛分布于世界各地的海洋沿岸的巖石潮間帶,深海中亦有分布。本研究對(duì)采自中國(guó)沿海的真帽貝樣品進(jìn)行了基于貝殼的形態(tài)學(xué)鑒定,描述了每個(gè)種的貝殼特征,主要包括貝殼的基本參數(shù)、形狀、顏色、殼表的紋理等,并記錄了每一種真帽貝的拉丁學(xué)名、采集地。最終,所有樣品被鑒定到2個(gè)科(笠貝科、花帽貝科),4個(gè)屬(Lottia、Patelloida、Nipponacmea、Cellana),其中鑒定到種水平的共有11個(gè)種,只鑒定到屬水平的有2個(gè)種。2.基于COI基因的中國(guó)沿海真帽貝DNA條形碼研究目前,根據(jù)形態(tài)特征鑒定真帽貝種存在著不確定性和復(fù)雜性。采用更加有效和準(zhǔn)確的物種鑒定方法來(lái)鑒定真帽貝這種普遍的,小型的,殼多變的海洋軟體動(dòng)物就顯得非常的必要。DNA條形碼技術(shù)是一門(mén)高效的,非常有用的物種鑒定工具。這種技術(shù)將能夠?yàn)檎婷必惖淖R(shí)別和鑒定效率帶來(lái)顯著的提高。本研究中,我們利用線(xiàn)粒體細(xì)胞色素c氧化酶亞單位I(COI)基因序列上的一個(gè)片段作為DNA條形碼來(lái)評(píng)估DNA條形碼技術(shù)用于鑒定和區(qū)分真帽貝物種的可行性。135條COI序列來(lái)源于中國(guó)沿海的花帽貝科和笠貝科的13個(gè)種。這些序列經(jīng)過(guò)拼接比對(duì)之后的分析結(jié)果表明真帽貝的線(xiàn)粒體COl基因序列中存在堿基插入現(xiàn)象。13個(gè)種種內(nèi)的以及4個(gè)屬屬內(nèi)不同種間的基于Kimura雙參數(shù)模型計(jì)算的遺傳距離的平均值分別為0.03%-0.21%(最大值1.01%),18.96%-31.30%(最大值37.80%),它們之間存在一條明顯的條形碼間隙。所有的種都能夠在每種系統(tǒng)樹(shù)中以較高的支持度被明顯的區(qū)分出來(lái)。基于特征的條形碼分析法能夠?qū)⑺械恼婷必惙N成功鑒定出,在屬水平的鑒別上也發(fā)揮了很好的作用。本研究的結(jié)果證明了基于COI基因的DNA條形碼技術(shù)能夠快速而準(zhǔn)確的鑒定真帽貝的物種。3.基于COI基因的南中國(guó)海美女蛤隱存多樣性研究該研究以南中國(guó)海的海南陵水、海南臨高、海南三亞、廣東陽(yáng)江、廣西北海5個(gè)海域共89個(gè)美女蛤樣品作為研究對(duì)象,通過(guò)對(duì)線(xiàn)粒體DNA(Mitochondrial DNA)的COI基因序列的分析對(duì)美女蛤進(jìn)行了隱存種的探究。經(jīng)過(guò)PCR擴(kuò)增與測(cè)序,以及對(duì)所得序列進(jìn)行比對(duì)校正后,獲得COI基因片段序列長(zhǎng)590bp,檢測(cè)到87個(gè)變異位點(diǎn),其中有46個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn),核苷酸多樣性為0.02729。89條序列共定義25個(gè)單倍型,單倍型多樣性為0.843。單倍型Hap7可能是由雜交引起的,排除此單倍型,遺傳距離和系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)都顯示美女蛤分為3個(gè)進(jìn)化支,其中進(jìn)化支3僅有一個(gè)單倍型Hap25,進(jìn)化支間遺傳距離為3.67%-8.55%,遠(yuǎn)大于進(jìn)化支內(nèi)最大遺傳距離0.85%。并且,運(yùn)用特征法分析的結(jié)果顯示進(jìn)化支1、2、3的特征堿基數(shù)分別為17,16,24個(gè),也與距離法和單系法的分析結(jié)果一致。本研究表明,基于COI的DNA條形碼技術(shù)能夠運(yùn)用于美女蛤隱存種的探究,三種分析方法都提示中國(guó)沿海分布的美女蛤可能至少具有2個(gè)隱存種,即中國(guó)沿海的美女蛤至少為3個(gè)不同種組成的復(fù)合種。
【關(guān)鍵詞】：物種鑒定 隱存種 形態(tài)學(xué) DNA條形碼 COI 真帽貝 美女蛤
【學(xué)位授予單位】：中國(guó)海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：S917.4
【目錄】：

• 摘要5-7
• Abstract7-13
• 第一章 文獻(xiàn)綜述13-26
• 1. 真帽貝(Patellogastropod)的概況13-17
• 1.1 真帽貝的形態(tài)特征14
• 1.2 真帽貝的生態(tài)習(xí)性14-15
• 1.3 真帽貝的分類(lèi)學(xué)研究進(jìn)展15-17
• 2. 美女蛤(Circe scripta)的概況17-20
• 2.1 外部形態(tài)特征17
• 2.2 地理分布17
• 2.3 生態(tài)習(xí)性17-18
• 2.4 傳統(tǒng)形態(tài)分類(lèi)所存在的爭(zhēng)議18-20
• 3. DNA條形碼20-26
• 3.1 DNA條形碼技術(shù)的研究步驟20-22
• 3.2 DNA條形碼位點(diǎn)(locus)的選擇22-23
• 3.3 DNA條形碼技術(shù)的成果23-24
• 3.4 DNA條形碼技術(shù)的現(xiàn)狀和展望24-26
• 第二章 真帽貝形態(tài)學(xué)分類(lèi)研究26-41
• 0 引言26-27
• 1 材料與方法27
• 1.1 實(shí)驗(yàn)樣品的采集27
• 1.2 主要形態(tài)特征的觀察27
• 2 結(jié)果27-41
• 第三章 基于COI基因的中國(guó)沿海真帽貝DNA條形碼分析41-63
• 0 引言41-42
• 1 材料與方法42-47
• 1.1 實(shí)驗(yàn)樣品的采集42
• 1.2 分子數(shù)據(jù)的采集42-46
• 1.2.1 DNA提取42
• 1.2.2 PCR擴(kuò)增與測(cè)序42-46
• 1.3 DNA條形碼分析46-47
• 2 結(jié)果47-60
• 2.1 形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果47-48
• 2.2 條形碼測(cè)序結(jié)果48
• 2.3 序列特征分析結(jié)果48
• 2.4 遺傳距離分析結(jié)果48-49
• 2.5 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果49-50
• 2.6 特征法分析結(jié)果50-60
• 3 討論60-62
• 3.1 COI引物在本研究中的表現(xiàn)60
• 3.2 基于COI的DNA條形碼技術(shù)的效率60-61
• 3.3 Patellogastropoda帽貝COI基因中的插入現(xiàn)象61-62
• 4 結(jié)論62-63
• 第四章 基于DNA條形碼的南中國(guó)海美女蛤(Circe scripta)隱存多樣性研究63-80
• 0 引言63-64
• 1 材料與方法64-72
• 1.1 實(shí)驗(yàn)樣品64-69
• 1.2 DNA提取及PCR擴(kuò)增69
• 1.3 序列下載69-70
• 1.4 數(shù)據(jù)分析70-72
• 2 結(jié)果72-78
• 2.1 美女蛤類(lèi)COI基因序列特征72
• 2.2 遺傳距離分析及支系間分化時(shí)間72-77
• 2.3 系統(tǒng)發(fā)生分析及單倍型網(wǎng)絡(luò)圖77
• 2.4 特征法分析77-78
• 3 討論78-80
• 參考文獻(xiàn)80-90
• 致謝90-91
• 個(gè)人簡(jiǎn)歷91-92
• 碩士期間學(xué)術(shù)成果92

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 張麗娜;榮昌鶴;何遠(yuǎn);關(guān)瓊;何彬;朱興文;劉佳妮;陳紅菊;;常用系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建算法和軟件鳥(niǎo)瞰[J];動(dòng)物學(xué)研究;2013年06期

2 陳軍;李琪;孔令鋒;鄭小東;于瑞海;;基于COI序列的DNA條形碼在中國(guó)沿海綴錦蛤亞科貝類(lèi)中的應(yīng)用分析[J];動(dòng)物學(xué)研究;2010年04期

3 孫寶超;楊建敏;孫國(guó)華;劉相全;劉麗娟;王衛(wèi)軍;鄭小東;;中國(guó)沿海長(zhǎng)蛸(Octopus variabilis)自然群體線(xiàn)粒體COI基因遺傳多樣性研究[J];海洋與湖沼;2010年02期

4 王志錚,吳常文,劉祖毅;浙江北部沿海嫁Cellana toreuma(Reeve)生態(tài)習(xí)性的初步研究[J];浙江海洋學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2001年01期

  本文關(guān)鍵詞：中國(guó)沿海真帽貝分類(lèi)及美女蛤隱存種研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：281201