【摘要】：為探究腹瀉川金絲猴與健康川金絲猴腸道菌群差異,進(jìn)而更好保護(hù)川金絲猴,于2014年3-5月在成都動(dòng)物園采集健康成年川金絲猴糞樣15份、腹瀉糞樣15份(其中3月采集健康糞樣7份、腹瀉糞樣7份,進(jìn)行PCR-DGGE初步比較分析)。對(duì)30份樣本應(yīng)用Illumina平臺(tái)進(jìn)行16s rRNA高通量測(cè)序,以及Real-time PCR技術(shù)對(duì)細(xì)菌總數(shù),梭菌cluster Ⅳ、梭菌cluster ⅪⅤa、普雷沃氏菌、乳桿菌、腸桿菌科進(jìn)行定量測(cè)定。結(jié)果如下：1. PCR-DGGE指紋圖譜顯示,腹瀉組與健康組相比,微生物多樣性指數(shù)(健康組3.87±0.02、腹瀉組3.87±0.01)、豐富度(健康組48±2.16、腹瀉組48±2.45)無顯著性差異；健康組與腹瀉組在聚類圖譜上明顯分為兩簇,相似性為0.78,健康樣本間相似性在0.81至0.86之間,腹瀉樣本間相似性在0.83至0.92之間。2.16s rRNA高通量測(cè)序結(jié)果：所有樣品平均每份樣品檢測(cè)到18912±6527 tags數(shù),其中健康組19172±6806和腹瀉組18652±6463差異不顯著。利用Mothur計(jì)算在97%的相似水平上樣品的OTU數(shù)量,健康組OTU數(shù)量為2598±971個(gè),與腹瀉組(2367±825個(gè))差異不顯著。健康成年川金絲猴糞樣菌群在門分類水平以Firmicutes、 Bacteroidetes為主。腹瀉組與健康組相比共有5種菌門、7種菌綱、8種菌目、19種菌科、28種菌屬有顯著性變化。Flexispira在屬分類水平平均占3.43×10-04,總檢出率90%(健康組13/15、腹瀉組14/15)。3. Real-time PCR結(jié)果：健康川金絲猴糞便菌群中細(xì)菌總數(shù)達(dá)5.14×1011cfu/g,梭菌cluster ⅪⅤa、梭菌cluster Ⅳ合計(jì)數(shù)量達(dá)2.11×10 11cfu/g,占細(xì)菌總數(shù)41%。腹瀉組與健康組相比,細(xì)菌總數(shù)、梭菌cluster Ⅳ、梭菌cluster ⅪⅤa無差異；普氏菌屬有所降低,但差異不顯著；腸桿菌科顯著性升高,而乳桿菌屬顯著性降低。結(jié)論：健康成年川金絲猴糞樣菌群數(shù)量較多,種類豐富,以厚壁菌門和擬桿菌門為主,梭桿菌屬較為豐富。腹瀉組與健康組相比,糞樣菌群總數(shù)及多樣性上沒有顯著性變化,但在部分菌群組成上有顯著性差異,腹瀉組相比于健康組相比,有益菌(乳桿菌屬)顯著性降低,而一些病原菌費(fèi)克藍(lán)姆菌屬、丹毒絲菌屬、不動(dòng)桿菌屬等定植量顯著性升高,危害川金絲猴胃腸道健康。
【學(xué)位授予單位】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S865.31;S858.93

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本文編號(hào)：2747924