【摘要】：近年的研究通過(guò)遺傳學(xué)手段揭示了狗、嚙齒動(dòng)物以及人類沿地理梯度的生理適應(yīng)性變化,然而在兩棲動(dòng)物這個(gè)類群中很少涉及相關(guān)研究。本論文利用限制性酶切位點(diǎn)關(guān)聯(lián)DNA測(cè)序(RAD-seq)技術(shù)對(duì)不同緯度的10個(gè)飾紋姬蛙(Microhyla fissipes)種群混合樣本的遺傳結(jié)構(gòu)及其適應(yīng)性進(jìn)行了研究。研究的10個(gè)種群分別位于中國(guó)的海南省、廣西壯族自治區(qū)、四川省,緯度跨度1398千米,海拔跨度486米。本研究使用Illumina HiSeq X Ten平臺(tái)測(cè)序,共獲得了275,328,964 Reads,Reads數(shù)的范圍從19,139,414 Reads(廣漢種群)到41,898,570 Reads(新都種群)。通過(guò)比對(duì)后共產(chǎn)生了258,127,856 Map reads,Reads數(shù)范圍從17,765,222 Reads(廣漢種群)到39,621,566 Reads(新都種群)。在10個(gè)種群中共確定了20,572個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)。每個(gè)種群的期望雜合度非常相似,約等于0.39�；蚪M平均核苷酸多樣性從0.410(昌江種群)到0.431(廣漢種群)�；蚪M平均種群突變率范圍從0.226(新都種群)到0.245(北海種群)。在所有的研究地點(diǎn)中,我們發(fā)現(xiàn)飾紋姬蛙(M.fissipes)種群產(chǎn)生了明顯的地理分化,通過(guò)對(duì)所有的SNPs計(jì)算得出平均群體遺傳差異系數(shù)為0.090(F_(ST)=0.090)。除了明顯的地理隔離模式,我們還發(fā)現(xiàn)了大量的離群?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性與緯度(5個(gè)SNPs),海拔高度(28個(gè)SNPs),年平均溫度(69個(gè)SNPs),年平均降雨量(248個(gè)SNPs)顯著相關(guān)。此外,還獲得了636個(gè)候選基因,并顯著富集在代謝過(guò)程和結(jié)合過(guò)程。在所有的采樣點(diǎn)中,總體的基因組遺傳分化呈中等水平(平均值等于0.219),大多數(shù)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)與年平均降雨量和(或者)年平均溫度變化有關(guān)。從單核苷酸多態(tài)性遺傳分化的水平和模式來(lái)看,降雨量和溫度促使飾紋姬蛙(M.fissipes)各種群遺傳分化。Outlier SNPs顯著富集在代謝過(guò)程和結(jié)合過(guò)程,并確定了與熱應(yīng)激反應(yīng)(HSPA12B和HSPA1B)相關(guān)的部分少量基因,然而大多數(shù)基因仍然是未知的�？傊�,我們的研究結(jié)果從基因組層面對(duì)兩棲動(dòng)物沿緯度和海拔梯度的適應(yīng)性分化提供了強(qiáng)有力的支持。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：西華師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S917.4

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2481411