青海省辣椒疫霉菌的SSR遺傳多樣性分析
[Abstract]:In this study, a total of 357 strains of Phytophthora capsici were isolated and purified from 6 main pepper producing areas (Xining, Haidong, Huangnan, Haixi, Haibei and Hainan) in Qinghai Province. 80 of them were selected for analysis. The mating type of Phytophthora capsici in Qinghai Province was identified, the resistance to Metalaxyl and the division of dominant species were determined. The genetic diversity of Phytophthora capsici in Qinghai Province was analyzed by SSR molecular marker technique. The main results were as follows: 1. Three mating types were detected in 80 strains of Phytophthora infestans. Among them, 33 were A1 mating type, accounting for 41.25A 2 mating type 46 strains, accounting for 57.5% of the total mating type. A0 mating type was 1 strain, accounting for 1. 25% of the total. No mating strain of A1A2 and A _ 1 / A _ 2 was detected. In the tested strains, 38 strains (47.5%) were sensitive to (MS), 26 strains were intermediate strains (32.5%), 16 strains (20.5%) were resistant strains. From the point of view of the distribution of producing areas, the identification of perennial chili growing areas such as Xining City, Haidong City and so on found that most of them were MS and MI, pepper growing history, such as Haixi Prefecture, Haibei Prefecture and so on. All the strains found in Haibei state were MI and MR, without MS;. Three strains were identified in some areas. The results showed that: (1) two physiological races were identified by in vitro leaf method, respectively, and Race1. was not detected by Race2,Race3,. The physiological races of Race2 and Race3 accounted for 32.6% and 67.4% of the total number of plants tested. (2) two types of physiological races of Race2 and Race3 were identified by root irrigation, and no Race1. was detected. The physiological races of Race2 and Race3 accounted for 37.5% and 62.5% of the total number of plants tested. The results of two methods showed that the frequency of Race3 was higher than that of Race2, Race3 was the dominant physiological species of Phytophthora capsici in Qinghai Province. The four factors (DNA, primer) were analyzed by orthogonal optimization design (L16 (44) in 4.SSR-PCR reaction system. D NTPs,Taq enzyme was optimized at 4 levels. The results showed that the optimal concentration level of the four factors was: DNA1.0ng, primer 0.8 渭 mol/L,d NTPs0.5 渭 mol/L,Taq 1.0 U. Among them, the DNA, primer had the greatest influence on the amplification reaction, followed by the Taq enzyme, and the d NTP concentration was the least affected on the amplification reaction. The genetic diversity of 84 strains of Phytophthora capsici was analyzed by SSR-PCR technique. The amplified bands of 30 SSR primers were mainly between 100-2000 bp. The number of bands varies from 11 to 19. The total number of bands amplified was 127 and the number of polymorphic bands was 114. The genetic distance of 84 samples of Phytophthora capsici was analyzed by UPGMA clustering method. The genetic distance was between 0.42-0.94, with an average of 0.62.When the threshold value was 0.71, 84 samples of Phytophthora capsici could be divided into 9 groups. The tested strains showed abundant genetic diversity, and the first cluster consisted of 20 strains from 6 regions as dominant populations.
【學(xué)位授予單位】:青海大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S436.418
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,本文編號:2420381
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