【摘要】：南海是位于中國南部的陸緣海,西太平洋的一部分,屬于印度—西太平洋海洋生物地理區(qū)系,是世界上海洋生物種質資源最為豐富的區(qū)域之一。南海蘊藏著豐富的魚類資源,是生產供應優(yōu)質動物蛋白,建設藍色糧倉的重要區(qū)域。已有的研究調查統(tǒng)計顯示南海魚類有3000多種,其隸屬于3個綱、35個目、236個科和822屬[1-3]。魚類的種類鑒別需要豐富的專業(yè)知識和經驗,特別是形態(tài)相似的近緣種,更是從形態(tài)上難以區(qū)分。近年來發(fā)展起來的DNA條形碼技術為魚類物種鑒別提供了一種快速有效的方法,而建立完善的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫是利用DNA條形碼技術進行魚類、魚卵和仔稚魚鑒定的基礎。因此,在國家基礎性工作專項的支持下,本研究開展了南海魚類憑證標本的收集保存和DNA條形碼數(shù)據(jù)庫構建工作,并利用建立的DNA條形碼技術開展了魚卵種類鑒別研究,取得的主要結果如下:1.南海魚類憑證標本收集保存和DNA條形碼數(shù)據(jù)庫構建。采集和保存了 518個樣品,通過形態(tài)鑒定隸屬于26目,91科,152屬,219種。將518個樣品分別提取基因組DNA,利用魚類線粒體COI基因通用引物,擴增樣品的線粒體COI基因,并進行測序分析,其中419個樣品獲得了有效的COI序列信息,經與BOLD數(shù)據(jù)庫比對分析,其中407個樣品COI條形碼信息在在BOLD數(shù)據(jù)庫中有相應條形碼序列,分別屬于19目,73科,123屬,164種,每個魚類物種包含1～8個個體數(shù),平均每個物種有2.48個個體,包含2個及2個以上個體的有93種;其余12個樣品隸屬于5個種,在BOLD數(shù)據(jù)庫中沒有相應的條形碼序列。利用419個樣品COI序列進行聚類分析,結果表明未出現(xiàn)堿基的插入和缺失,419條序列的平均堿基組成分別為T:29.7%,C:28.3%,A:23.3%和G:18.3%,其中A+T平均含量(53.0%)明顯高于G+C平均含量(46.6%),表現(xiàn)出AT堿基偏倚性。密碼子第三位點GC含量最高(48.5%),第一位點次之(46.5%),第二位點最低(43.8%)。三個密碼子A+T含量的差異不大,第一密碼子位點的A+T平均含量最大為53.4%。利用MEGA5.0軟件的K2P模型計算遺傳距離,種內遺傳距離與種間遺傳距離的變化范圍分別為0.0000-0.0208 (平均值 0.0027)和 0.0012-0.4812 (平均值 0.2298),種間遺傳距離為種內距離的85倍,土佐灣楔花洦，

本文編號：2310116