本文選題：尖孢鐮刀菌胡麻�；�　切入點：轉(zhuǎn)錄組　出處：《內(nèi)蒙古大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：胡麻枯萎病是一種由尖孢鐮刀菌胡麻�；鸵鸬膰�(yán)重危害胡麻產(chǎn)量的土傳真菌性維管束病害。本研究組在患病胡麻植株的根圍土壤中分離得到了一株對尖孢鐮刀菌胡麻�；途哂忻黠@抑制效果的萎縮芽孢桿菌SF1。本論文運用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),分別以尖孢鐮刀菌胡麻�；途旰团c生防菌SF1共培養(yǎng)的尖孢鐮刀菌胡麻�；途隇檠芯繉ο�,對尖孢鐮刀菌胡麻�；途甑霓D(zhuǎn)錄組學(xué)進行了測定并對測序數(shù)據(jù)進行分析,得到以下結(jié)果:1、首先對SF1發(fā)酵液及其無細胞濾液對G56的抑菌效果進行了比較,之后繪制了不同發(fā)酵時間SF1發(fā)酵液對G56的抑菌率變化曲線,從而確定了本次實驗中實驗組的處理方法。2、以G56作為對照組,與SF1發(fā)酵液進行共培養(yǎng)后的G56作為實驗組,對G56進行轉(zhuǎn)錄組測序,發(fā)現(xiàn):(1)可變剪切事件中屬于SE類型的AS事件數(shù)量最多;A5SS、A3SS、RI三類AS事件數(shù)量相當(dāng),明顯少于SE類型AS事件;同時,并無MXE類型AS事件發(fā)生。(2)G56 組、SF1_24h 組、SF1_48h 組分別有 42.20%、41.25%、41.51%的基因不表達,對于表達的基因FPKM值處于16～60范圍內(nèi)的基因數(shù)量最多,之后依次是FPKM值處于3～15、60、1～3范圍內(nèi)的基因。(3)SF1_24hvsG56發(fā)現(xiàn)690個上調(diào)基因,581個基因下調(diào)。SF1_48hvs G56發(fā)現(xiàn)584個上調(diào)基因,595個下調(diào)基因;其中882個在SF1_24hvsG56與SF1_48h vs G56均有差異表達。(4)SF1_24hvsG56的全部1271個差異表達基因被注釋到30個GOTerm和55個涉及下調(diào)基因的KEGG通路,以及66個涉及上調(diào)基因的KEGG通路。(5)SF1_48h vs G56的全部1179個差異表達基因被注釋到25個GO Term和52個涉及下調(diào)基因的KEGG通路,以及65個涉及上調(diào)基因的KEGG通路。
[Abstract]:Flax wilt is an soil-borne fungal vascular bundle disease caused by Fusarium oxysporum flax specific type, which seriously endangers the yield of flax. Atrophy Bacillus sp. SF _ (1), which has obvious inhibitory effect on the specific type of flax, was used in this paper, which was sequenced by transcriptome technique. Using Fusarium oxysporum flax specific strain and Fusarium flax specific strain co-cultured with biocontrol bacteria SF1 as the research objects, the transcriptome of Fusarium oxalium specific strain was determined and the sequencing data were analyzed. The results are as follows: 1. The bacteriostatic effect of SF1 fermentation broth and its acellular filtrate on G56 was compared, and then the change curve of bacteriostasis rate of SF1 fermentation broth on G56 at different fermentation time was plotted. Therefore, the treatment method of the experimental group was determined. G56 was used as control group and G56 co-cultured with SF1 fermentation broth as experimental group. G56 was sequenced. It was found that the maximum number of as events belonging to SE type in the variable shear events was the same as that of SE type as events, which were significantly less than those of SE type as events, and no MXE type as events occurred. At the same time, there were 42.201.25% of the 41.51% genes not expressed in the MXE type as events. The number of genes whose FPKM value was in the range of 16 ~ 60 was the highest, followed by the gene whose FPKM value was in the range of 3 ~ (15) 560 / 1 ~ (-1). 690 upregulated genes were found to be down-regulated, 581 genes were down-regulated, and 584 genes were down-regulated by SF1 48h vs G56, followed by 595 down-regulated genes. Among them, 882 differentially expressed genes in SF1_24hvsG56 and SF1_48h vsG56. All 1271 differentially expressed genes in the GOTerm 24hvsG56 were annotated to 30 GOTerm and 55 KEGG pathways involving down-regulated genes. All 1179 differentially expressed genes related to up-regulated gene, KEGG pathway and up-regulated gene, were annotated to 25 go Term and 52 down-regulated KEGG pathways, and 65 KEGG pathways related to up-regulated genes.
【學(xué)位授予單位】：內(nèi)蒙古大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：S435.659;Q943.2

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