本文關(guān)鍵詞： 鴨圓環(huán)病毒 短喙-侏儒綜合征 PCR檢測(cè) 全基因組序列　出處：《山東農(nóng)業(yè)大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：自2014年下半年以來(lái),山東、安徽、江蘇等地的櫻桃谷鴨流行一種以大舌、短喙、生長(zhǎng)障礙為主要特征的新發(fā)疾病,該病主要引起雛鴨上下喙萎縮變短,舌頭外伸、腫脹,感染后期脛骨和翅骨易發(fā)生骨折,體重明顯低于健康鴨只,導(dǎo)致出欄合格率下降,造成較大的經(jīng)濟(jì)損失,經(jīng)陳少鶯等人的分離鑒定,確定該病病原為一種新型小鵝瘟病毒(NGPV)或GPV變異株。在用NGPV陽(yáng)性樣品感染鴨只時(shí),僅有少數(shù)鴨只可以復(fù)制出與自然病例類似的短喙癥狀,實(shí)驗(yàn)室造病率較低,因此該病的發(fā)生絕不僅僅是NGPV單獨(dú)造成的,還有其他致病因素參與其中,因本病有著與家禽圓環(huán)病毒相似的臨床癥狀,如鸚鵡喙羽病病毒常常導(dǎo)致患病的鸚鵡出現(xiàn)鳥喙變形、嚴(yán)重脫毛及體重減輕,鵝的圓環(huán)病毒引起機(jī)體的矮小綜合征,并且Du CV的免疫抑制使其與其他疾病具有較高的混合感染率,因此我們懷疑短喙-侏儒綜合征病鴨體內(nèi)協(xié)同感染了鴨圓環(huán)病毒。為了解鴨圓環(huán)病毒在短喙侏儒綜合征發(fā)病鴨群中的流行變異情況以及危害程度,明確發(fā)病鴨群的的鴨圓環(huán)基因型及序列,為疾病的防治提供依據(jù),本實(shí)驗(yàn)將完成以下研究?jī)?nèi)容。1.短喙侏儒綜合征發(fā)病鴨群中鴨圓環(huán)病毒的檢測(cè)本試驗(yàn)從山東、江蘇、安徽等地的24個(gè)鴨群的147只病死鴨中采取了心、肝、脾、肺、腎等8個(gè)組織器官,采用常規(guī)PCR方法對(duì)其進(jìn)行圓環(huán)病毒的檢測(cè),結(jié)果顯示,Du CV陽(yáng)性個(gè)體感染率達(dá)53.06%(78/147),群體感染率為83.3%(20/24),對(duì)79只具有典型大舌短喙特征的鴨子進(jìn)行了Du CV和NGPV的共感染檢測(cè),Du CV與NGPV的混合感染率為53.16%(42/79)。2.鴨圓環(huán)病毒的全基因測(cè)序及序列分析篩選部分陽(yáng)性樣品進(jìn)行全基因組擴(kuò)增共獲得4個(gè)全基因組序列,其中兩株基因組大小為1993nt,另兩株為1995nt,與已報(bào)道的其他毒株基因組大小一致。基因組內(nèi)包含3個(gè)主要的閱讀框,V1/rep、C1/cap和C2/ORF3,所得到4個(gè)毒株在上述編碼區(qū)均沒(méi)有插入或缺失現(xiàn)象存在。根據(jù)全基因序列以及兩個(gè)主要病毒蛋白核苷酸序列繪制的進(jìn)化樹也一致顯示所得的4株序列為基因1型。
[Abstract]:Since the second half of 2014, Cherry Valley Ducks in Shandong, Anhui and Jiangsu provinces have developed a new disease characterized by large tongue, short beak and growth disorder. Tongue extension, swelling, tibia and wing bones are prone to fracture at the later stage of infection, weight is significantly lower than the healthy duck, resulting in a decline in the qualification rate, resulting in greater economic losses, identified by Chen Shaoying and others. When infected with NGPV positive samples, only a few ducks could replicate short-beak symptoms similar to those of natural cases. Laboratory disease rate is low, so the occurrence of the disease is not only caused by NGPV alone, there are other pathogenic factors involved, because this disease has similar clinical symptoms as poultry circovirus. Such as parrot beak feather virus often lead to sick parrot beak deformation, severe hair loss and weight loss, goose circovirus caused the body's dwarf syndrome. And the immunosuppression of du CV makes it have a high mixed infection rate with other diseases. Therefore, we suspect that the duck circovirus was co-infected with the short-beaked dwarf syndrome duck. In order to understand the prevalence of duck circovirus in the short-beaked dwarf syndrome infected ducks and the degree of harm. In order to provide basis for prevention and treatment of the disease, the genotype and sequence of duck ring were identified. Detection of Duck circovirus in Ducks with short beak dwarf syndrome. 147 dead ducks from 24 ducks in Shandong, Jiangsu and Anhui provinces were selected in this experiment. Liver, spleen, lung, kidney and other eight tissues and organs were detected by conventional PCR method. The results showed that the infection rate of DuCV positive individuals was 53.0678 / 147). The coinfection rate of du CV and NGPV was detected in 79 ducks with typical large tongue and short beak. The mixed infection rate of du CV and NGPV was 53.16% and 42 / 79). 2. The whole gene sequencing and sequence analysis of duck circovirus were used to amplify the whole genome of duck circovirus. The genome size of two strains was 1993ntand the other two were 1995nt, which were the same as those of other virulent strains reported. The genome contained three main reading frames V1 / rep. C1 / cap and C2 / ORF3. None of the 4 strains were inserted or deleted in the coding region. The phylogenetic tree drawn from the whole gene sequence and the nucleotide sequences of the two main viral proteins also showed that the 4 strains were gene 1. Type.
【學(xué)位授予單位】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S858.32

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 武世珍;靖吉強(qiáng);李舫;王光鋒;;鴨短喙長(zhǎng)舌綜合征的血液生化指標(biāo)測(cè)定與分析[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2016年18期

2 崔元;王建昌;李玉保;經(jīng)美;張姍;陳萍;孫繼國(guó);袁萬(wàn)哲;;鴨短喙-侏儒綜合征及其病原的初步研究[J];中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào);2016年05期

3 韋友兵;宋廣君;劉思當(dāng);;鴨短喙長(zhǎng)舌綜合征診斷防治[J];水禽世界;2016年02期

4 李傳峰;李琦;陳宗艷;唐井玉;劉光清;;鴨短喙-侏儒綜合征病原的初步鑒定[J];中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào);2015年06期

5 郝菊秋;;鴨圓環(huán)病毒病的診治[J];中國(guó)畜禽種業(yè);2015年10期

6 呂英超;王艷君;孫瑛;;一起小鵝瘟的診治[J];中國(guó)畜禽種業(yè);2015年10期

7 陳浩;刁有祥;竇硯國(guó);鄭肖強(qiáng);牛曉宇;楊晶;于相龍;;“鴨短喙長(zhǎng)舌綜合征”初步研究[J];山東農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2015年04期

8 陳少鶯;程曉霞;陳仕龍;王劭;林鋒強(qiáng);吳南洋;俞伏松;莊曉東;朱小麗;王錦祥;程由銓;;半番鴨新型小鵝瘟病毒病研究簡(jiǎn)報(bào)[J];福建農(nóng)業(yè)科技;2015年07期

9 黃瑜;萬(wàn)春和;傅秋玲;陳紅梅;傅光華;陳翠騰;程龍飛;程小兵;施少華;林建生;;新型番鴨細(xì)小病毒的發(fā)現(xiàn)及其感染的臨床表現(xiàn)[J];福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2015年05期

10 趙光遠(yuǎn);謝芝勛;謝麗基;龐耀珊;鄧顯文;劉加波;范晴;;鴨圓環(huán)病毒實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J];畜牧與獸醫(yī);2013年01期

相關(guān)會(huì)議論文 前1條

1 寧康;王丹;王府民;劉寧;張大丙;;櫻桃谷北京鴨短喙和侏儒綜合征的初步研究[A];第四屆全國(guó)禽病分子生物技術(shù)青年工作者會(huì)議論文集[C];2015年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條

1 王鑫;鴨圓環(huán)病毒Rep和ORF3蛋白部分生物學(xué)活性的研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 張興曉;鴨圓環(huán)病毒的分子流行病學(xué)調(diào)查及診斷方法的建立[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前6條

1 李志國(guó);檢測(cè)兩型鴨圓環(huán)病毒雙重PCR方法的建立和分子流行病學(xué)調(diào)查[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 相琪旺;鴨圓環(huán)病毒ORF2和ORF3基因部分生物學(xué)特性的研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

3 魏宗;鴨圓環(huán)病毒ORF3基因的序列分析及基因表達(dá)[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

4 鄒金峰;鴨圓環(huán)病毒核酸探針檢測(cè)方法的建立及Cap蛋白核定位信號(hào)的研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

5 張超;鴨圓環(huán)病毒cap基因的表達(dá)與檢測(cè)CAP抗體的間接ELISA方法建立[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

6 劉少寧;鴨圓環(huán)病毒的流行病學(xué)調(diào)查[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

，

本文編號(hào)：1482746