本文關(guān)鍵詞：基于454高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)內(nèi)蒙古賀蘭山青海云杉外生菌根真菌的研究　出處：《內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

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【摘要】：本文在內(nèi)蒙古阿拉善賀蘭山國家自然保護(hù)區(qū)所采集的青海云杉21個(gè)土壤樣品中所有類型外生菌根在顯微鏡下挑出,提取總DNA。并用特定引物擴(kuò)增對(duì)外生菌根真菌rDNA的ITS1和ITS4區(qū)段進(jìn)行PCR擴(kuò)增并對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行純化及割膠回收。經(jīng)純化后的DNA樣品采用新一代高通量454測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行上機(jī)測(cè)序。然后,通過一系列包括序列質(zhì)量控制、序列比對(duì)、操作分類單元?jiǎng)澐�、多樣性分析、分類地位鑒定和系統(tǒng)進(jìn)化分析等步驟的分析流程對(duì)所獲得的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,基于此對(duì)青海云杉外生菌根真菌進(jìn)行研究分析。結(jié)果表明:賀蘭山地區(qū)青海云杉外生菌根真菌非常豐富,隸屬于3個(gè)門6個(gè)綱10個(gè)目19個(gè)科24個(gè)屬,外生菌根OTU序列數(shù)量達(dá)到了 255條,其序列長度平均為241bp。87.1%的OTU可以鑒定到科屬水平,其中鑒定到科水平的OTU共96條,火絲菌科、革菌科、蠟殼耳科絕對(duì)豐度排序中,位于前三;鑒定到屬水平的OTU共127條,豐度排在前三的優(yōu)勢(shì)菌屬依次為蠟殼耳屬、棉革菌屬和偶線菌屬。從Venn圖看,所采集的賀蘭山哈拉烏和亂柴溝兩地有70.1%的OTU重合,說明兩地的外生菌根真菌群落結(jié)構(gòu)相似。和外生菌根的傳統(tǒng)研究方式對(duì)比來看,454高通量測(cè)序法可以更為全面且準(zhǔn)確地反映出外生菌根真菌群落結(jié)構(gòu)。
[Abstract]:The total DNA was extracted from 21 soil samples collected from 21 soil samples collected from the National Nature Reserve of Alashan Helan Mountain in Inner Mongolia . The total DNA was extracted by PCR .

【學(xué)位授予單位】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S791.18;S714.3

【參考文獻(xiàn)】

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