本文關(guān)鍵詞：轉(zhuǎn)反義ACO基因甜瓜品系果實發(fā)育過程的轉(zhuǎn)錄組分析　出處：《內(nèi)蒙古大學》2017年碩士論文　論文類型：學位論文

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【摘要】：甜瓜是一種在世界廣泛種植的經(jīng)濟作物,研究甜瓜果實發(fā)育過程的生物學機制與相關(guān)基因,對于人們加強對甜瓜以及其他作物果實發(fā)育的理解具有重要意義,進一步為果實的貯藏保鮮、品質(zhì)改良等提供了思路與理論依據(jù)。本研究利用轉(zhuǎn)錄組測序與生物信息學技術(shù),針對果實發(fā)育前后的兩個時期,對轉(zhuǎn)反義ACO基因的M9品系河套蜜瓜(Cucumis melo L.cv Hetao)與原種河套蜜瓜進行了轉(zhuǎn)錄組測序和較全面的比較,以找出轉(zhuǎn)反義ACO基因與乙烯對甜瓜果實發(fā)育的影響。本研究對甜瓜乙烯合成轉(zhuǎn)錄調(diào)控與信號通路中的5個關(guān)鍵基因家族CmCTR、CmEIN2、CmHB、CmETR、CmRIN進行了全基因組范圍的生物信息學鑒定,分別鑒定出了 20、6、17、3、21個家族成員。分析其與CmEIN3/EILs共6個基因家族在M9與原種河套蜜瓜轉(zhuǎn)錄組中的表達情況,結(jié)果顯示多數(shù)基因家族在此過程中的表達情況復(fù)雜,CmEIN3/EILs家族在兩個品系的樣本中整體受到上調(diào),CmETR則相反。本研究統(tǒng)計了 M9與原種河套蜜瓜轉(zhuǎn)錄組的GO富集情況,繪制了相應(yīng)的GO有向無循環(huán)圖,使用AmiG01.8對以上GO富集信息進行分析,發(fā)現(xiàn)M9品系在有機酸及羧酸代謝、細胞器及組分的組織與合成代謝、光合系統(tǒng)、與其他有機體的互作、脫羧反應(yīng)的氧化還原酶活性、核苷酸三磷酸酶活性方面的GO富集比例明顯大于原種,而原種在蛋白質(zhì)位置信息相關(guān)GO的富集比例和絕對數(shù)量都明顯大于M9品系。最后基于轉(zhuǎn)錄組Log2Foldchange值,利用R語言等工具篩選基因,進一步選取了9個基因,為后續(xù)的研究提供了資料與依據(jù)。
【學位授予單位】：內(nèi)蒙古大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：S652

【參考文獻】

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本文編號：1318607