本文關(guān)鍵詞：五種吸蟲核糖體全序列的擴(kuò)增與特征分析

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【摘要】：吸蟲是一種呈世界性分布的,主要寄生于宿主肝膽管及小腸等部位的寄生蟲,造成畜牧業(yè)巨大經(jīng)濟(jì)損失的同時(shí),人獸共患寄生蟲還對人類的健康造成嚴(yán)重的威脅,甚至危及生命。核糖體在細(xì)胞中廣泛存在,在生命活動(dòng)中起著重要的作用,也是蛋白質(zhì)合成的重要場所,核糖體DNA為編碼核糖體RNA的基因,由可轉(zhuǎn)錄的核糖體RNA和不可轉(zhuǎn)錄的間隔區(qū)組成,通過對核糖體序列的測定可以對物種進(jìn)行鑒定,確定物種的分類地位,明確物種的多樣性等。因此,本研究采用PCR等方法對人畜危害嚴(yán)重的土耳其斯坦裂體吸蟲雌蟲和雄蟲、東方次睪吸蟲、華支睪吸蟲、曲領(lǐng)棘緣吸蟲和圓圃棘口吸蟲的核糖體全序列進(jìn)行擴(kuò)增,對5種吸蟲核糖體全序列的結(jié)構(gòu)特征及同源性進(jìn)行分析,并以不同的標(biāo)記基因構(gòu)建吸蟲的系統(tǒng)發(fā)生樹。結(jié)果表明,5種吸蟲核糖體全序列長度為8209~8917 bp,每種吸蟲核糖體全序列的6段基因在長度上幾乎無變化,僅有土耳其斯坦裂體吸蟲雌蟲、雄蟲的IGS長度有輕微變化。通過比較發(fā)現(xiàn)5種蟲體間5.8S同源性高達(dá)92.4~100%,進(jìn)化速率較慢的18S和28S的同源性也分別高達(dá)89.7~99.8%和80.3~96.8%,而ITS1、ITS2和IGS同源性分別為56.4~94.8%、49.5~96.2%和34.2~94.1%。由此可見,在各段核糖體序列中,種內(nèi)差異小,種間差異大。同時(shí),我們還能得到6段核糖體序列的保守性排序?yàn)?5.8S18S28SITS1ITS2IGS。以不同標(biāo)記基因構(gòu)建的進(jìn)化樹,每個(gè)進(jìn)化樹并非完全與傳統(tǒng)分類學(xué)相符,基于18S、28S構(gòu)建的進(jìn)化樹,在科、目之間的進(jìn)化關(guān)系與傳統(tǒng)分類學(xué)不符;基于ITS1、IGS構(gòu)建的進(jìn)化樹,在屬之間的進(jìn)化關(guān)系與傳統(tǒng)分類學(xué)不符;基于ITS2構(gòu)建的進(jìn)化樹,與傳統(tǒng)分類學(xué)相符。可見18S、ITS1、ITS2、28S、IGS分別適合用于目及以上、科間、屬間、目及以上、科之間的進(jìn)化關(guān)系。同時(shí),根據(jù)現(xiàn)有較少的IGS序列,我們能夠推斷IGS能夠作為基因標(biāo)記,對吸蟲的進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行探討。本研究首次獲得了5種吸蟲30條蟲體的核糖體全序列,并對其結(jié)構(gòu)特征、同源性進(jìn)行了分析,豐富了復(fù)殖吸蟲的核糖體全序列的數(shù)據(jù),確定了各段基因的保守性排序,采取不同核糖體基因構(gòu)建吸蟲的系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果表明,不同標(biāo)記基因適合于不同的分類階元。
【學(xué)位授予單位】：黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：S852.7

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本文編號：1304874