枯草芽胞桿菌MEP代謝路徑基因簇分析及重組菌株構(gòu)建
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更多相關(guān)文章: 枯草芽胞桿菌 MEP代謝路徑 轉(zhuǎn)錄單元 重組菌株
【摘要】:枯草芽胞桿菌(Bacillus subtilis)是一種理想的被廣泛地應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)研究的對(duì)植物病原真菌具有拮抗作用的生防細(xì)菌。目前已明確,枯草芽胞桿菌中存在參與MEP代謝途徑的相關(guān)基因及其編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能,但參與MEP代謝途徑的各個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄單元卻鮮有研究,同時(shí)有關(guān)枯草芽胞桿菌是否可以通過(guò)轉(zhuǎn)基因技術(shù)構(gòu)建具備影響害蟲(chóng)天敵行為重組菌株的相關(guān)報(bào)道較少。本研究以枯草芽胞桿菌(B.subtilis)916菌株為研究對(duì)象,旨在闡述參與MEP代謝途徑相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄概況,并構(gòu)建重組生防菌株,以影響害蟲(chóng)天敵的行為。利用生物信息學(xué),以枯草芽胞桿菌Bs168為參考對(duì)象,結(jié)合KEGG和NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)分析Bs916菌株中參與MEP代謝途徑和FPP合成的dxs,dxr,isp D,isp F,ip K,isp G,isp H,idi和isp A 9個(gè)基因在基因組中的分布情況,同時(shí)通過(guò)BLAST進(jìn)行氨基酸相似性比對(duì)。結(jié)果表明這9個(gè)基因散布于Bs916菌株基因組中,其所編碼的氨基酸與Bs168相應(yīng)基因所編碼氨基酸相似性均高于73%。通過(guò)測(cè)定Bs916在LB中的生長(zhǎng)曲線,結(jié)合反轉(zhuǎn)錄PCR明確參與MEP代謝途徑和FPP合成的9個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄時(shí)期。結(jié)果表明:上述9個(gè)基因在菌株生長(zhǎng)的指數(shù)期和穩(wěn)定期都進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。以T4時(shí)期菌株為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,利用RT-PCR確定9個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄單元,同時(shí)通過(guò)5′RACE技術(shù)確定1-脫氧-5-磷酸-D-木酮糖合成酶(Dxs)的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)。結(jié)果發(fā)現(xiàn):dxs與isp A共轉(zhuǎn)錄,與其它5個(gè)基因共同形成大小為6352 bp的多順?lè)醋?dxr與其它19個(gè)基因共同形成大小為19355 bp的轉(zhuǎn)錄單元;isp D與isp F緊鄰,中間間隔8 bp的核苷酸與其它20個(gè)基因共同形成大小為18580 bp的轉(zhuǎn)錄單元;idi與其下游的1個(gè)基因形成大小為3413 bp的轉(zhuǎn)錄單元;ip K與其它4個(gè)基因形成大小為2535 bp的轉(zhuǎn)錄單元;isp G與其上游的2個(gè)基因形成大小為2954 bp的轉(zhuǎn)錄單元;isp H與其下游的1個(gè)基因形成大小為819 bp的轉(zhuǎn)錄單元。Dxs的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)C位于編號(hào)為KO64_RS11240基因翻譯起始密碼子上游157 bp處。通過(guò)基因工程技術(shù),構(gòu)建具有影響害蟲(chóng)天敵行為的枯草芽胞桿菌菌株。結(jié)果表明:具有優(yōu)化后編碼橙花叔醇和香葉基芳樟醇合成酶的PITPS4基因在枯草芽胞桿菌916菌株具有轉(zhuǎn)錄活性。本研究明確了枯草芽胞桿菌916菌株MEP代謝途徑相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄情況,為枯草芽胞桿菌MEP代謝路徑相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄分析提供依據(jù);同時(shí)初步完成含有PITPS4基因的重組菌株構(gòu)建,為今后研制高效具有影響害蟲(chóng)天敵行為的枯草芽胞桿菌菌株奠定基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S476.1
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,本文編號(hào):1296009
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