本文關(guān)鍵詞：COI基因在魚類物種鑒定與分類中的應(yīng)用

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【摘要】：我國(guó)魚類資源豐富,種類多達(dá)3000左右。為了有效地對(duì)魚類資源進(jìn)行開發(fā)利用、最大程度地發(fā)揮魚類的經(jīng)濟(jì)價(jià)值以及加大對(duì)瀕危魚類資源的保護(hù),因此,正確地對(duì)魚類進(jìn)行鑒定、分類顯得尤為重要。傳統(tǒng)鑒定魚類的方法是以形態(tài)結(jié)構(gòu)為主,結(jié)合行為、生理、遺傳性狀、地理、生態(tài)等特征對(duì)魚類進(jìn)行鑒定和分類。但是,由于魚類表型特征的可變性,以及有些相同物種的外部特征在不同的生長(zhǎng)發(fā)育階段和不同的性別之間存在差異,單單根據(jù)魚類外部形態(tài)特征對(duì)魚類進(jìn)行鑒定和分類的準(zhǔn)確性不高。尤其是對(duì)于形態(tài)差異比較小、親緣關(guān)系比較近的的不同物種之間的鑒定存在困難。另外,由于傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定方法存在的缺陷,要求鑒定者要有豐富的鑒定經(jīng)驗(yàn)以及對(duì)物種分類鑒定的知識(shí)儲(chǔ)備。DNA條形碼(DNA Barcoding)技術(shù)是指利用一段能夠代表物種的、短的、相對(duì)保守、容易擴(kuò)增的標(biāo)準(zhǔn)目的基因片段實(shí)現(xiàn)物種快速、準(zhǔn)確的鑒定的技術(shù)。目前,線粒體細(xì)胞色素C氧化酶亞基(COI)基因被廣泛用作DNA條形碼的目的基因,從分子學(xué)角度為魚類的鑒定分類和系統(tǒng)進(jìn)化提供了可靠的依據(jù)。研究?jī)?nèi)容如下:1.線粒體COI基因在觀賞魚中物種鑒定與分類應(yīng)用觀賞魚種類繁多,形態(tài)各異,市場(chǎng)上多是以商品名命名,在物種鑒定分類上存在一定的難度。本研究基于線粒體COI基因,探討其在觀賞魚中物種鑒定與分類應(yīng)用的可行性。通過PCR擴(kuò)增,獲取18種觀賞魚249個(gè)個(gè)體的COI基因序列。基于Kimura雙參數(shù)模型,利用MEGA軟件計(jì)算18種觀賞魚種間和種內(nèi)遺傳距離,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果顯示,觀賞魚類的種間遺傳距離明顯大于種內(nèi)遺傳距離,線粒體COI基因序列可以用于物種鑒定。在系統(tǒng)進(jìn)化樹中,系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系跟傳統(tǒng)分類方法所得數(shù)據(jù)一致性高。研究表明,觀賞魚線粒體COI基因序列,在物種鑒定與進(jìn)化分類上具有一定的應(yīng)用價(jià)值。2.COI基因DNA條形碼在云南瀾滄江魚類物種中的鑒定與分類的應(yīng)用云南瀾滄江魚類資源豐富,有許多特有種類,在幼魚階段、或形體不全的情況下以及一些相近種形態(tài)相似的情況下,僅僅依據(jù)傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定方法,很難完全滿足物種鑒定和分類的需求。本文從分子學(xué)角度,探討了線粒體COI基因在瀾滄江云南段魚類中物種鑒定與分類應(yīng)用的適用性。采用PCR技術(shù),對(duì)采自瀾滄江云南段的18種魚共162個(gè)個(gè)體的COI基因片段進(jìn)行了擴(kuò)增和測(cè)序。利用MEGA軟件,基于K2P模型計(jì)算18種魚類的種間和種內(nèi)遺傳距離,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果表明,種間遺傳距離顯著大于種內(nèi)遺傳距離,符合Hebert等人提出的COI基因能有效進(jìn)行鑒定的前提;由系統(tǒng)進(jìn)化樹得知,COI基因在種屬水平方面的鑒定與傳統(tǒng)的分類學(xué)鑒定方法一致。因此,線粒體COI基因?yàn)闉憸娼颇隙昔~類鑒定和分類提供了分子學(xué)依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】：浙江海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S917.4

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