本文關(guān)鍵詞：非洲新稻（NERICA-L）群體遺傳構(gòu)成解析

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【摘要】：非洲新稻群體由陸稻與水稻組成,本研究選用了 60份非洲新稻水稻群體(NERICA_L)為目標(biāo)研究樣本,分別以73份亞洲栽培稻的群體以及110份非洲栽培稻品種為參照樣本,基于SNP基因分型芯片與簡化基因組測序技術(shù),對(duì)NERICA_L種群的遺傳構(gòu)成進(jìn)行剖析,同時(shí)對(duì)幾個(gè)關(guān)鍵農(nóng)藝性狀的遺傳基礎(chǔ)進(jìn)行遺傳分析。應(yīng)用illumina Golden Gate SNP基因芯片分析了全部60份非洲新稻樣本768個(gè)栽培稻核心收集SNP位點(diǎn)(W-core),研究結(jié)果顯示非洲新稻群體的多樣性指數(shù)達(dá)到了 0.230,高于非洲栽培稻和溫帶粳稻的遺傳多樣性水平,這表明非洲新稻群體具有豐富的遺傳多樣性。非洲新稻群體與非洲栽培稻材料的遺傳分化系數(shù)較高為0.475,但與亞洲栽培稻秈稻遺傳關(guān)系較近,非洲栽培稻、非洲新稻都與粳稻亞種有較高的遺傳分化系數(shù)�；诤喕蚪M測序技術(shù)(SLAF-SNP)獲得的25707個(gè)SNP標(biāo)記對(duì)非洲新稻的種群進(jìn)行深入剖析,系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示非洲新稻的群體與其非洲栽培稻親本TOG5681的遺傳分歧最大,而另一個(gè)秈型親本IR64完全融入在非洲新稻組群的聚類中。非洲新稻群體的基因組大部分片段來源于輪回親本秈稻IR64,僅有小部分基因片段來源于非洲栽培稻TOG5681的基因片段,并且不規(guī)則的分布在60份非洲新稻的12條染色體上。同時(shí)對(duì)于非洲新稻各品種間遺傳分化以及血緣模式進(jìn)行分析,這有助于選擇合適的親本組合開展進(jìn)一步的育種工作�；赪-core SNP對(duì)非洲栽新稻幾個(gè)重要農(nóng)藝性狀進(jìn)行單標(biāo)記遺傳分析,結(jié)果表明,主效應(yīng)直鏈淀粉含量響應(yīng)位點(diǎn)的LOD值與遺傳貢獻(xiàn)率分別為14.26和83.2%,直鏈淀粉含量的單標(biāo)記顯著連鎖位點(diǎn)與已報(bào)道的Waxy位置重疊,并且與基于SLAF-seq的單標(biāo)記分析定位到的位點(diǎn)相同。對(duì)非洲栽培稻耐低氧的特性進(jìn)行遺傳解析,基于W-coreSNP我們?cè)诘谝蝗旧w上找到1個(gè)關(guān)于耐低氧萌發(fā)的響應(yīng)位點(diǎn),LOD值為4.85貢獻(xiàn)率達(dá)到27.2%。在基于SLAF-seq的單標(biāo)記分析中,我們?cè)诘?染色體上也定位到了該位點(diǎn),同時(shí)在第7號(hào)染色體上也發(fā)現(xiàn)了一個(gè)顯著的耐低氧萌發(fā)響應(yīng)信號(hào)。通過SLAF-seq的單標(biāo)記分析,也發(fā)現(xiàn)了第4染色體、第8染色體和第10染色體上3個(gè)響應(yīng)耐低氧萌發(fā)性的位點(diǎn)。這為發(fā)掘源于非洲新稻優(yōu)良的基因資源同時(shí)為進(jìn)一步的遺傳改良打下了良好的基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】：沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S511

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1 雒鳴峰;;群體遺傳慣性理論與選擇極限(續(xù))[J];黃牛雜志;1993年02期

2 杜立新;遺傳資源保存的群體遺傳理論[J];寧夏農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào);1992年02期

3 雒鳴峰;;群體遺傳慣性理論與選擇極限[J];黃牛雜志;1993年01期

4 薛付忠,王潔貞,胡平,李國榮;人類群體遺傳空間結(jié)構(gòu)的“克立格”模型(英文)[J];遺傳學(xué)報(bào);2005年03期

5 P.Jonsson;許振英;;西歐國家豬的育種改良方法[J];國外畜牧學(xué)(豬與禽);1981年00期

6 黃海根;;豬的血型群體遺傳及其親緣關(guān)系(綜述)[J];江西畜牧獸醫(yī)雜志;1989年02期

7 晏勇;張興忠;;線粒體DNA分析技術(shù)在魚類群體遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用[J];淡水漁業(yè);1993年03期

8 宋曉;李思發(fā);王成輝;徐嘉偉;楊琴玲;;草魚中國土著群體與歐美日移居群體遺傳差異的線粒體序列分析[J];水生生物學(xué)報(bào);2009年04期

9 余仲東,張剛龍,曹支敏;病原真菌種內(nèi)群體遺傳分化研究現(xiàn)狀與技術(shù)[J];西北林學(xué)院學(xué)報(bào);2002年04期

10 孫國文;一個(gè)具選擇、突變、遷移的群體的遺傳差分模型[J];遺傳學(xué)報(bào);1988年04期

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1 許時(shí)倫;井金學(xué);楊曉明;;普通群體的遺傳機(jī)制——2對(duì)連鎖基因的遺傳[A];北方遺傳資源的保護(hù)與利用研討會(huì)論文匯編[C];2010年

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1 本報(bào)記者　吳s，

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