長牡蠣不同選育群體雜交子代的雜種優(yōu)勢及微衛(wèi)星分析
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【摘要】:長牡蠣(Crassostrea gigas)是一種在我國乃至全世界范圍內(nèi)被廣泛養(yǎng)殖的重要經(jīng)濟貝類,因為營養(yǎng)豐富,味道鮮美,素有“海中牛奶”的美稱。我國的牡蠣養(yǎng)殖規(guī)模較大,市場需求居高不下,而長期的人工養(yǎng)殖容易導致牡蠣的種質(zhì)衰退,造成長牡蠣的品質(zhì)下降。因此,為了推動我國牡蠣養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)快速發(fā)展,滿足市場的需求,培育抗逆性好、生長快、繁殖力高等優(yōu)良特性的品種已是勢在必行。本研究結(jié)合選擇育種,利用分別已連續(xù)選育5代和6代的長牡蠣中國群體和日本群體進行完全雙列雜交,研究了長牡蠣不同種群雜交的雜種優(yōu)勢并進行了微衛(wèi)星分析,旨在為長牡蠣的雜交育種提供理論依據(jù),主要結(jié)果如下:1.長牡蠣中國群體和日本群體雜交子代的雜種優(yōu)勢和配合力分析以長牡蠣中國群體(C)連續(xù)選育5代和日本群體(J)連續(xù)選育6代的個體作為親本進行完全雙列雜交,比較分析了幼蟲期、稚貝期和養(yǎng)成期3個階段各實驗組生長與存活情況,研究了長牡蠣不同種群雜交的雜種優(yōu)勢,并進行了配合力分析。結(jié)果表明,幼蟲期,雜交組生長與存活性狀表現(xiàn)出微弱的雜種優(yōu)勢,而日本群體一般配合力(GCA)較高。自交組JJ(J♀×J(?))和反交組JC(J♀×C(?))表現(xiàn)出明顯的生長優(yōu)勢,而自交組CC(C♀×C(?))和正交組CJ(C♀×(?))存活率較高,表明幼蟲期存在顯著的母性效應(yīng)。其中正交組CJ存活率最高,雜種優(yōu)勢率為4.67%~40.30%。稚貝及養(yǎng)成期,雜交組各生長性狀(殼高、殼長、殼寬和總重)表現(xiàn)出顯著的雜種優(yōu)勢,總重的雜種優(yōu)勢率最高,為13.61%~21.71%。其中正交組CJ各生長性狀的雜種優(yōu)勢率均表現(xiàn)為正值。從整個生長階段來看,長牡蠣中國群體的母本一般配合力和日本群體的父本一般配合力在生長后期較高,而雜交組特殊配合力(SCA)總體表現(xiàn)為正效應(yīng),表明正交組CJ是最適的雜交組合,具有很大的生產(chǎn)潛力。2.長牡蠣微衛(wèi)星標記的分離及特性從長牡蠣的EST序列和全基因組序列中總共開發(fā)了480個微衛(wèi)星標記。這些標記位點等位基因數(shù)量為2-33個,觀測雜合度和期望雜合度分別為0-1.0000和0.0655~0.9690。經(jīng)過Bonferroni校正,共196個位點顯著偏離哈迪-溫伯格平衡,23對位點呈現(xiàn)連鎖不平衡。這些位點為長牡蠣QTL定位以及遺傳多樣性評價提供了有用工具。3.長牡蠣群體微衛(wèi)星遺傳多樣性及其與生長性狀的相關(guān)性分析應(yīng)用30個微衛(wèi)星標記對長牡蠣中國群體(C)和日本群體(J)的完全雙列雜交子代進行遺傳多樣性分析,并且分析了長牡蠣微衛(wèi)星標記與生長性狀的相關(guān)性。結(jié)果表明,4個群體中平均等位基因數(shù)量為7.4-10.8,平均觀測雜合度和期望雜合度分別為0.5247-0.5742和0.7042-0.7520,平均多態(tài)信息含量為0.6572-0.7139,雜交后代與親本自繁后代的遺傳多樣性并沒有顯著的差異性(P0.05)。基于遺傳距離構(gòu)建的UPGMA系統(tǒng)樹顯示,反交群體(J♀×C(?),JC)與日本群體的親緣關(guān)系較近,而正交群體(C♀×J(?), CJ)介于兩親本群體之間。采用最小二乘法分析微衛(wèi)星位點與生長性狀的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)6個位點在長牡蠣不同群體中與生長性狀呈現(xiàn)相關(guān)性。不同基因型間的多重比較表明,CgGJ152位點BD基因型與殼長、殼寬性狀呈正相關(guān),而且等位基因C可能比等位基因D更有優(yōu)勢;CgEJ493位點的AC基因型、CgGJ222位點的DD基因型、CgGJ246位點的等位基因E與長牡蠣的生長性狀呈正相關(guān);而CgEJ041位點的CC基因型、CgEJ538位點的AB基因型、CgGJ222位點的BE基因型與長牡蠣的生長性狀呈負相關(guān),這些標記可望應(yīng)用于長牡蠣的分子標記輔助選擇育種。4.基于微衛(wèi)星標記的長牡蠣雜合度與適合度相關(guān)性分析雜合度與適合度相關(guān)性(Heterozygosity-fitness correlation, HFC)的研究常被用來檢測個體的遺傳多樣性與適合度間的關(guān)聯(lián)性。本研究以長牡蠣完全雙列雜交群體為實驗對象,在1齡的4個長牡蠣雜交群體中應(yīng)用30個微衛(wèi)星位點分析個體的多位點雜合度(Multilocus heterozygosity, MLH)、單位點雜合度(Single-locus heterozygosity, SLH)與生長性狀的相關(guān)性。研究結(jié)果表明,長牡蠣個體的MLH與殼寬、體重具有正相關(guān)性;而SLH與殼高、殼長呈正相關(guān)。由于群體分層以及多個群體的混合數(shù)據(jù)會影響HFC的檢測,因此,采用群體生長性狀值的離差再次分析HFC,結(jié)果沒有發(fā)現(xiàn)雜合度與適合度有任何相關(guān)性。這說明在進行HFC研究時應(yīng)該慎重對不同的群體進行混合。而長牡蠣樣本個體的年齡、樣本大小和使用的微衛(wèi)星標記的數(shù)量等都可能會影響HFC的檢測。
【學位授予單位】:中國海洋大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:S917.4
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,本文編號:1272321
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