基于C-di-GMP操縱的光響應系統(tǒng)及重復序列刪除的定量研究
發(fā)布時間:2021-04-17 03:12
環(huán)鳥苷二磷酸(c-di-GMP)是廣泛存在于細菌中一種重要的第二信使分子,在銅綠假單胞菌中,主要參與細菌的運動粘附行為及生物被膜形成的調節(jié)。隨著合成生物學特別是光響應系統(tǒng)的發(fā)展,以環(huán)鳥苷二磷酸為對象的相關應用型研究也越來越多。本文的第一部分主要以環(huán)鳥苷二磷酸為對象,通過設計構造了單色光響應和雙色光響應兩套系統(tǒng),在利用單色光響應系統(tǒng)實現對單細菌的追蹤操縱后,通過進一步的優(yōu)化并建立雙色光響應系統(tǒng),利用靜態(tài)圖案化投影技術,經過對實驗體系、實驗條件的不斷優(yōu)化測試,最終實現了活細菌生物被膜的定向生物打印,并成功地實現了可逆的生物打印。由于工程菌種具有很強的可改造性,光響應系統(tǒng)的建立為研究新型抗菌表面、新型活細菌生物材料及其他應用領域提供了新的方法和思路。而本文的第二部分主要基于三色熒光報告系統(tǒng)設計了一套精準定量細胞內重復片段刪除率的新方法,即三色熒光成像重復片段刪除事件計數器(Three-color Fluorescent based Deletion Events Counter,TFDEC),經過聚合酶鏈式反應(PCR)以及進一步測序的方法驗證了該系統(tǒng)的準確性。利用該系統(tǒng)建立的新方法,可以快...
【文章來源】:華中科技大學湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:125 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
C-di-GMP單體和二聚體的化學結構和三維結構
C-di-GMP的合成與分解
華中科技大學博士學位論文5圖1.3C-di-GMP的結合效應蛋白[26]。Figure1.3Effectorofc-di-GMPbinding.1.1.3環(huán)鳥苷二磷酸對生物被膜的調控C-di-GMP廣泛地調控細菌的浮游與生物被膜生活方式的轉變[27]。當c-di-GMP水平低時,細菌趨向于個體的運動,而當c-di-GMP水平升高時,細菌的胞外多糖分泌增加,運動受限,能夠最終促進細菌黏附于表面,形成生物被膜。C-di-GMP參與調控細菌的菌毛、鞭毛的自組裝及活性,包括調控鞭毛基因的表達[16,23]、運動馬達的自組裝[28,29]和功能[17,30]。例如在大腸桿菌(Escherichiacoli)和沙門氏菌(Salmonellaenterica)中,上調的c-di-GMP分子通過YcgR蛋白來影響鞭毛轉子和定子的相互作用,而同時表達的PDE蛋白PdeH和鞭毛基因來阻斷YcgR的活性從而促進細菌的運動[17,31,32]。當細菌接觸表面后,將快速地改變自身的行為:分泌黏附蛋白,激活胞外聚合物(EPS)的分泌,從而促進微菌落的形成。C-di-GMP通過轉錄調節(jié)[33]、翻譯調節(jié)[34]和翻譯后調節(jié)[35]全程參與黏附行為的調控。例如,銅綠假單胞菌胞外聚合物如PSL、PEL,黏附蛋白CdrA、CdrB以及海藻酸鹽等的分泌激活都是受到c-di-
本文編號:3142697
【文章來源】:華中科技大學湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:125 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
C-di-GMP單體和二聚體的化學結構和三維結構
C-di-GMP的合成與分解
華中科技大學博士學位論文5圖1.3C-di-GMP的結合效應蛋白[26]。Figure1.3Effectorofc-di-GMPbinding.1.1.3環(huán)鳥苷二磷酸對生物被膜的調控C-di-GMP廣泛地調控細菌的浮游與生物被膜生活方式的轉變[27]。當c-di-GMP水平低時,細菌趨向于個體的運動,而當c-di-GMP水平升高時,細菌的胞外多糖分泌增加,運動受限,能夠最終促進細菌黏附于表面,形成生物被膜。C-di-GMP參與調控細菌的菌毛、鞭毛的自組裝及活性,包括調控鞭毛基因的表達[16,23]、運動馬達的自組裝[28,29]和功能[17,30]。例如在大腸桿菌(Escherichiacoli)和沙門氏菌(Salmonellaenterica)中,上調的c-di-GMP分子通過YcgR蛋白來影響鞭毛轉子和定子的相互作用,而同時表達的PDE蛋白PdeH和鞭毛基因來阻斷YcgR的活性從而促進細菌的運動[17,31,32]。當細菌接觸表面后,將快速地改變自身的行為:分泌黏附蛋白,激活胞外聚合物(EPS)的分泌,從而促進微菌落的形成。C-di-GMP通過轉錄調節(jié)[33]、翻譯調節(jié)[34]和翻譯后調節(jié)[35]全程參與黏附行為的調控。例如,銅綠假單胞菌胞外聚合物如PSL、PEL,黏附蛋白CdrA、CdrB以及海藻酸鹽等的分泌激活都是受到c-di-
本文編號:3142697
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