第一部分肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)lncRNAs標(biāo)志物的篩選及預(yù)后評估模型的構(gòu)建目的:局部復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移是肺癌患者死亡的主要原因,腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)長鏈非編碼RNA（long non-coding RNAs,lncRNAs）分子與肺癌患者的復(fù)發(fā)預(yù)后密切相關(guān)。本研究旨在通過分析癌癥基因組圖譜（The Cancer Genome Atlas,TCGA）數(shù)據(jù)庫,篩選與肺腺癌轉(zhuǎn)移和無復(fù)發(fā)生存時間（relapse-free survival,RFS）密切相關(guān)的lncRNAs分子標(biāo)志物,繼而構(gòu)建患者復(fù)發(fā)預(yù)后評估模型,同時結(jié)合體外實驗,初步驗證模型分子在腫瘤細(xì)胞侵襲遷移中的作用。方法:1.肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)lncRNAs分子標(biāo)志物的初步篩選。分析TCGA數(shù)據(jù)庫（https://cancergenome.nih.gov/）中347例肺腺癌患者的lncRNAs表達(dá)數(shù)據(jù)和相關(guān)臨床數(shù)據(jù),使用R語言edgeR包對腫瘤轉(zhuǎn)移組（n=158）和非轉(zhuǎn)移組（n=189）的lncRNAs進行差異表達(dá)分析,按照篩選標(biāo)準(zhǔn)（adjusted p value,FDR<0.05;|logFC|>1）,初步篩選出與肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的lncRNAs分... 

【文章來源】：山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：151 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖１．實驗流程圖??Ｆｉｇｕｒｅ?１．?Ｓｔｕｄｙ?ｆｌｏｗｃｈａｒｔ．??

?山東大學(xué)博士學(xué)位論文???１５??．?？?？?：??？?＊??＃?？?？??Ｑ．?？?？??２?？??〇＞?？?？?？??？?？?？?？??？？？？？？？？：?？？??？?？?？?：ｒ＇?？？？?？??５?？?．．．?■■？？：：．十：：＇：沒■??－ＺＳ?０．０?２．６?５．０??ｌｏｇ２?Ｆｏｌｄ?Ｃｈａｎｇｅ??圖２．火山圖顯示ＴＣＧＡ數(shù)據(jù)集中有轉(zhuǎn)移和無轉(zhuǎn)移的肺腺癌患者中差異表達(dá)的??ＩｎｃＲＮＡｓ有７３５個。綠色點表示差異ＩｎｃＲＮＡｓ，紅色點表示無差異ＩｎｃＲＮＡｓ。??Ｆｉｇｕｒｅ?２．?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?ｓｈｏｗｉｎｇ?７３５?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ＩｎｃＲＮＡｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ??ＬＵＡＤ?ｐａｔｉｅｎｔｓ?ｗｉｔｈ?ａｎｄ?ｗｉｔｈｏｕｔ?ｍｅｔａｓｔａｓｉｓ?ｆｒｏｍ?ｔｈｅ?ＴＣＧＡ?ｃｏｈｏｒｔ．?Ｇｒｅｅｎ?ｃｏｌｏｒ??ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ?ＩｎｃＲＮＡｓ，?ａｎｄ?ｒｅｄ?ｃｏｌｏｒ?ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ?ｕｎｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｅｄ?ＩｎｃＲＮＡｓ．??５２??

?山東大學(xué)博士學(xué)位論文???ｒｎｉＴｊｉ＾Ｓｌ－，：??ｒ＊（ＰＱ—＿—，｜〇??■??—ｌｉｎｃｏｚ３２３??ｉ?Ｉ?—?！?．?Ｔ?｜?ｉ??謹(jǐn)Ｉ?ｆ震！獲??圖３．預(yù)測模型中六個ＩｎｃＲＮＡｓ分子的相關(guān)性分析。??Ｆｉｇｕｒｅ?３．Ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ?ｍａｔｒｉｘ?ｏｆ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｌｅｖｅｌｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｓｉｘ?ＩｎｃＲＮＡｓ．??５３??


本文編號：2994421