基于本體的三類上市疫苗相關(guān)不良反應(yīng)數(shù)據(jù)挖掘與分析
本文選題:疫苗不良反應(yīng) + 疫苗不良反應(yīng)報(bào)告系統(tǒng)VAERS; 參考:《重慶大學(xué)》2016年博士論文
【摘要】:疫苗作為當(dāng)代醫(yī)學(xué)最偉大的發(fā)明之一,在過去的兩個(gè)多世紀(jì)里對(duì)于減輕傳染病給人類帶來的苦難、延長(zhǎng)人類平均壽命起到了不可替代的重要作用。然而,疫苗接種經(jīng)常伴隨著一些不良反應(yīng)(adverse event,AE)的發(fā)生,其中一些不良反應(yīng)是嚴(yán)重的甚至致命的。理解掌握特定疫苗不良反應(yīng)發(fā)生譜系對(duì)于預(yù)測(cè)潛在的嚴(yán)重不良反應(yīng)(serious adverse event,SAE)、改善疫苗安全性至關(guān)重要。鑒于此,疫苗安全警戒(vaccine pharmacovigilance)作為一門新興的醫(yī)藥科學(xué),旨在收集、檢測(cè)、評(píng)估、監(jiān)控和預(yù)防疫苗相關(guān)的不良反應(yīng);诖苏撐淖髡邊⑴c開發(fā)的不良反應(yīng)本體(Ontology of Adverse Events,OAE)方法,本文重點(diǎn)研究了三類具有代表性的上市疫苗不良反應(yīng)發(fā)生譜系。首先,對(duì)預(yù)防甲肝和乙肝的單價(jià)疫苗(Havrix和Engerix-B)及聯(lián)合疫苗(Twinrix)相關(guān)的不良反應(yīng)進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析并做了基于本體的分類研究。在此基礎(chǔ)上,設(shè)計(jì)了一種整合MCMC抽樣的邏輯回歸模型用于預(yù)測(cè)疫苗間的相互作用對(duì)不良反應(yīng)結(jié)果的影響;其次,基于不良反應(yīng)報(bào)告系統(tǒng)(Vaccine Adverse Event Report System,VAERS)數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)和PubMed文獻(xiàn)薈萃分析數(shù)據(jù),對(duì)卡介苗(BCG)作為結(jié)核病預(yù)防性疫苗和膀胱癌治療性疫苗相關(guān)的不良反應(yīng)進(jìn)行了本體化的統(tǒng)計(jì)分析研究;最后,對(duì)上市布魯氏菌病疫苗(S19、Rev1和RB51)在動(dòng)物和人群中引發(fā)的不良反應(yīng)進(jìn)行了基于本體方法的薈萃分析研究。本文的研究結(jié)果不僅有利于上市疫苗安全性的監(jiān)督管理,而且有助于設(shè)計(jì)更為安全有效的新疫苗。與此同時(shí),本文研究方法同樣適用于其他上市疫苗相關(guān)的不良反應(yīng)數(shù)據(jù)挖掘與分析。本文主要研究結(jié)果如下:(1)自2001年5月至2015年7月,對(duì)于年齡不小于18歲的接種者,VAERS累計(jì)報(bào)道了941、3885和1624例不良反應(yīng)案例分別與Havrix、Engerix-B和Twinrix有關(guān)。經(jīng)過一系列生物醫(yī)學(xué)信息統(tǒng)計(jì)篩選,我們共計(jì)得到了46、69和82個(gè)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的AEs分別與Havrix、Engerix-B和Twinrix有關(guān);贠AE的分類分析表明:這些有統(tǒng)計(jì)意義的AEs主要涉及到接種者的行為和神經(jīng)學(xué)病變、免疫系統(tǒng)、視覺系統(tǒng)和肝膽系統(tǒng)。其中29個(gè)AEs被歸集為SAEs,且黃疸是唯一一個(gè)與三種疫苗都相關(guān)的SAE。為了識(shí)別兩種單價(jià)苗同時(shí)使用而潛在發(fā)生的疫苗-疫苗相互作用信號(hào),我們?cè)O(shè)計(jì)了一個(gè)整合MCMC抽樣的邏輯回歸模型;谠撃P,13個(gè)AEs的發(fā)生被識(shí)別出受到疫苗與疫苗之間的協(xié)同相互作用影響。此外,同時(shí)采用OAE和Med DRA對(duì)這13個(gè)AEs進(jìn)行了等級(jí)分類,針對(duì)分類結(jié)果所做的比較分析清晰地表明了OAE在AE等級(jí)分類分析上的諸多優(yōu)勢(shì)。(2)從397例VAERS報(bào)道的BCG疫苗接種不良反應(yīng)案例中,我們共計(jì)得到了64個(gè)有重要統(tǒng)計(jì)意義的AEs與BCG作為結(jié)核病預(yù)防性疫苗接種有關(guān);14個(gè)有統(tǒng)計(jì)意義的AEs與BCG作為膀胱癌治療性疫苗有關(guān)。從PubMed文獻(xiàn)庫中獲得的41篇同行評(píng)議論文薈萃分析挖掘出了48個(gè)AEs與結(jié)核病預(yù)防性BCG疫苗有關(guān);43個(gè)AEs與膀胱癌治療性BCG疫苗有關(guān);贠AE的本體等級(jí)分類研究指出:BCG作為結(jié)核病預(yù)防性疫苗相關(guān)的不良反應(yīng)主要集中在免疫系統(tǒng)、皮膚和呼吸系統(tǒng);相比之下,BCG作為膀胱癌治療性疫苗相關(guān)的不良反應(yīng)主要發(fā)生在泌尿系統(tǒng)。盡管BCG兩種用途引發(fā)的不良反應(yīng)譜系截然不同,我們依然發(fā)現(xiàn)三種AEs同時(shí)與BCG的這兩種用途有關(guān),即寒栗、肺炎和C反應(yīng)蛋白水平升高。此外,針對(duì)VAERS數(shù)據(jù)庫中24例BCG疫苗接種相關(guān)的死亡案例報(bào)告的薈萃分析表明疫苗接種者的實(shí)際年齡、同時(shí)接種的其他疫苗和接種者自身免疫狀態(tài)對(duì)死亡結(jié)果的發(fā)生有重要影響。(3)基于PubMed文獻(xiàn)庫檢索到的27篇同行評(píng)議論文,我們的薈萃分析識(shí)別出20種AEs發(fā)生在動(dòng)物的布魯氏菌病疫苗接種過程中;46種AEs發(fā)生在由于非主觀原因而意外接種動(dòng)物布魯氏菌病疫苗的人群中。OAE等級(jí)分類研究表明:這些動(dòng)物相關(guān)的不良反應(yīng)主要集中在動(dòng)物的免疫和生殖系統(tǒng),并最終導(dǎo)致流產(chǎn)或不孕不育的發(fā)生;而人相關(guān)的不良反應(yīng)主要涉及到行為和神經(jīng)學(xué)方面的病變,并表現(xiàn)出類似流感發(fā)生的癥狀,這與人類直接感染布魯氏菌出現(xiàn)的臨床癥狀是基本一致的。另一方面,基于方差分析的線性匹配模型用于檢測(cè)動(dòng)物在疫苗接種過程中的哪些變量對(duì)流產(chǎn)不良反應(yīng)的發(fā)生有重要影響。模型結(jié)果指出接種動(dòng)物種屬類型、接種疫苗劑量和疫苗接種途徑三個(gè)變量對(duì)流產(chǎn)發(fā)生有重要影響;其他兩種變量(接種動(dòng)物年齡和接種疫苗類型)對(duì)流產(chǎn)的發(fā)生無顯著性影響?偟膩碚f,本研究的結(jié)果有利于我們更好的理解布魯氏菌病疫苗引發(fā)的人畜不良反應(yīng),同時(shí)有助于未來設(shè)計(jì)更安全有效的布魯氏菌病疫苗。
[Abstract]:The results of this paper are as follows : ( 1 ) The results are as follows : ( 1 ) The results are as follows : ( 1 ) The results are as follows : ( 1 ) The results are as follows : ( 1 ) The results are as follows : ( 1 ) The results are as follows : ( 1 ) The results are as follows : ( 1 ) The results are as follows : ( 1 ) The results are as follows : ( 1 ) To predict the potential serious adverse event ( SAE ) and improve the safety of the vaccine . ( 2 ) In the case of BCG vaccination reported by 397 VAERS , there were 64 statistically significant AEs related to BCG as a prophylactic vaccine for tuberculosis ; 14 statistically significant AEs were associated with BCG as a therapeutic vaccine for bladder cancer . The results of the meta - analysis indicated that the adverse reactions associated with BCG as a prophylactic vaccine for tuberculosis were mainly in the immune system , the skin and the respiratory system .
【學(xué)位授予單位】:重慶大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:TP311.13
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,本文編號(hào):1796875
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