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無網(wǎng)格激發(fā)熒光斷層成像方法研究

發(fā)布時(shí)間:2018-03-02 03:28

  本文關(guān)鍵詞: 分子影像 激發(fā)熒光斷層成像 三維重建算法 無網(wǎng)格方法 分段常數(shù)水平集方法 出處:《北京交通大學(xué)》2017年博士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:分子影像(Molecular Imaging)是一門近年來不斷發(fā)展的新穎的影像學(xué)科,結(jié)合了生物化學(xué)、多模態(tài)成像技術(shù)、生物數(shù)學(xué)、生物信息學(xué)、細(xì)胞分子生理學(xué)、生物物理學(xué)、藥理學(xué)等多種影像學(xué)和生物相關(guān)學(xué)科技術(shù)。它為疾病的早期診斷和量化分析、治療監(jiān)測和評估以及綜合生理學(xué)的發(fā)展提供了新的技術(shù)平臺(tái)。激發(fā)熒光斷層成像(Fluorescence Molecular Tomography,FMT)是MI中光學(xué)影像模態(tài)的一種,它通過靶向生物組織內(nèi)部特定分子的熒光物質(zhì)產(chǎn)生的熒光來獲取熒光在生物組織內(nèi)分布的三維成像,從而獲取靶向的生理或病理組織的三維量化信息。相比于其他光學(xué)分子影像方式,激發(fā)熒光斷層成像具有靈敏度高、成本低和安全可靠等特點(diǎn)。近年來發(fā)展迅速,成為光學(xué)分子影像技術(shù)的研究前沿和研究熱點(diǎn)。本文針對如何提高激發(fā)熒光斷層成像(FMT)的成像精度、速度和魯棒性進(jìn)行了研究,提出了基于無網(wǎng)格方法的FMT前向問題和逆向問題的求解方法,并提出了基于分段常數(shù)水平集的FMT重建方法,主要研究內(nèi)容包含以下幾點(diǎn):1.提出了無網(wǎng)格FMT前向問題求解方法。該方法基于緊支徑向基函數(shù)(Compactly Supported Radius Basis Function,CSRBF),首先采用一系列彼此獨(dú)立的離散節(jié)點(diǎn)及形狀函數(shù)來精確表征離散成像區(qū)域,然后采用CSRBF求解FMT光子傳輸模型。由于成像空間離散節(jié)點(diǎn)彼此獨(dú)立,無需進(jìn)行網(wǎng)格剖分等人工操作,且CSRBF具有彼此獨(dú)立、非線性表征離散區(qū)域的特性,重建效率和精確度顯著提高。數(shù)值仿真及生物模型實(shí)驗(yàn)結(jié)果均說明了無網(wǎng)格方法可有效提高FMT的成像精度和效率。2.提出了無網(wǎng)格FMT逆向問題求解方法。我們將CSRBF引入FMT逆向問題求解當(dāng)中,將經(jīng)典的有限元網(wǎng)格求解問題轉(zhuǎn)化為無網(wǎng)格求解問題,并結(jié)合多種最優(yōu)化算法,如Tikhonov正則化、L1范數(shù)迭代收縮法以及稀疏自適應(yīng)匹配追蹤法等方法來求解FMT逆向問題。數(shù)值仿真以及在體實(shí)驗(yàn)表明無網(wǎng)格FMT逆向問題求解較經(jīng)典有限元法可以有效提高FMT逆向問題求解精度和計(jì)算效率。3.提出了 FMT逆向問題區(qū)域求解方法。該方法基于分段常數(shù)水平集理論(Piece Wise Constant Level Set,PCLS),結(jié)合光源稀疏性和高對比度的先驗(yàn)知識(shí),在傳統(tǒng)的L1范數(shù)正則化方法的基礎(chǔ)上建立了分段常數(shù)水平集重建框架。在具體求解過程中,采用增益拉格朗日交替迭代法求解FMT逆向問題,并結(jié)合共軛梯度法和其他加速算法來快速精確求解PCLS水平集函數(shù)及成像區(qū)域光強(qiáng)分布。數(shù)值仿真和生物模型實(shí)驗(yàn)證明該方法較傳統(tǒng)Tikhonov正則化方法和L1-IS方法能夠更快速精確的刻畫出成像區(qū)域內(nèi)部熒光光源區(qū)域。
[Abstract]:Molecular Imaging is a novel imaging subject that has been developed in recent years. It combines biochemistry, multimodal imaging technology, biomathematics, bioinformatics, cellular and molecular physiology, biophysics. Pharmacology and many other imaging and biorelated disciplines. It provides early diagnosis and quantitative analysis of diseases. Therapeutic monitoring and evaluation, as well as the development of comprehensive physiology, provide a new technical platform. Excitation fluorescence Molecular Tomography (FMTT) is a kind of optical imaging mode in MI. It gets three dimensional imaging of the distribution of fluorescence in biological tissues by targeting fluorescence produced by specific molecules within biological tissues. Compared with other optical molecular imaging methods, excitation fluorescence tomography has the characteristics of high sensitivity, low cost, safety and reliability, and has developed rapidly in recent years. This paper focuses on how to improve the imaging accuracy, speed and robustness of the excited fluorescence tomography (FMTT). In this paper, a method for solving FMT forward problem and reverse problem based on meshless method is proposed, and a FMT reconstruction method based on piecewise constant level set is proposed. The main contents of this paper are as follows: 1. A meshless FMT forward problem solution method is proposed. This method is based on compact Supported Radius Basis function. Firstly, a series of independent discrete nodes and shape functions are used to accurately solve the problem. Characterization of discrete imaging regions, Then CSRBF is used to solve the FMT photon transmission model. Because the discrete nodes in the imaging space are independent of each other, there is no need for manual operations such as mesh generation, and the CSRBF is independent of each other, and nonlinear characterizes the discrete region. The results of numerical simulation and biological model experiments show that the meshless method can effectively improve the imaging accuracy and efficiency of FMT. 2. A meshless FMT inverse problem solution method is proposed. We use CSRBF to solve the inverse problem. In the process of solving FMT reverse problem, The classical finite element mesh solving problem is transformed into a meshless solution problem and combined with various optimization algorithms. For example, Tikhonov regularized L 1 norm iterative contraction method and sparse adaptive matching tracing method are used to solve FMT inverse problem. Numerical simulation and in vivo experiments show that meshless FMT inverse problem solution is more effective than classical finite element method. To improve the accuracy and computational efficiency of FMT reverse problem, a method for solving FMT reverse problem region is proposed, which is based on piecewise constant level set theory, and combines the priori knowledge of light source sparsity and high contrast, based on piecewise constant level set theory. Based on the traditional L1 norm regularization method, a piecewise constant level set reconstruction framework is established. In the concrete solution, the gain Lagrangian alternating iteration method is used to solve the FMT inverse problem. The conjugate gradient method and other accelerated algorithms are used to solve the PCLS level set function and the intensity distribution of the imaging region quickly and accurately. Numerical simulation and biological model experiments show that the proposed method is more effective than the traditional Tikhonov regularization method and L1-IS method. Fast and accurate characterization of the imaging region of the internal fluorescent light source region.
【學(xué)位授予單位】:北京交通大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:TP391.41

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本文編號(hào):1554841

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