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基于遺傳算法的獼猴桃組培苗變異監(jiān)測(cè)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-08-05 17:20
【摘要】:農(nóng)業(yè)種植科學(xué)研究中通常以組培的方法來擴(kuò)繁優(yōu)良品種。組培是使植物能夠生長、發(fā)育、分化與增殖的技術(shù),具有繁殖系數(shù)高、快速高效、周年化生產(chǎn)等特點(diǎn)。但在組培過程中,由于離體條件本身、植物生長調(diào)節(jié)劑、培養(yǎng)基滲透壓等諸多原因可能會(huì)使組培苗發(fā)生變異。一旦發(fā)生變異,變異苗就會(huì)隨繼代數(shù)的增多而增多。如未及時(shí)采取必要的措施,變異苗數(shù)量將成幾何級(jí)數(shù)增長。有些遺傳變異(主要是隱匿變異體)在組培過程中不易發(fā)現(xiàn)到大田后期才被發(fā)現(xiàn),其經(jīng)濟(jì)損失更大。本文選用獼猴桃作為研究對(duì)象,先對(duì)獼猴桃引物對(duì)進(jìn)行了篩選,提出了一種基于支持向量機(jī)的引物對(duì)選擇方法,首先通過實(shí)驗(yàn)獲得的組培苗的部分引物對(duì),利用歐氏距離計(jì)算樣本基因序列與引物對(duì)的相似性,將引物對(duì)及與引物對(duì)相似度低的基因序列分別作為兩個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行訓(xùn)練,再以此為基礎(chǔ)對(duì)樣本基因進(jìn)行學(xué)習(xí),選擇出的基因序列即為引物對(duì)序列基因。將該方法用于獼猴桃組培苗引物對(duì)的篩選中,在已有8個(gè)引物對(duì)的基礎(chǔ)上可獲得40個(gè)新引物對(duì)基因序列。再利用自適應(yīng)遺傳算法對(duì)獼猴桃組培苗的培養(yǎng)進(jìn)行動(dòng)態(tài)監(jiān)控,以減少獼猴桃組培過程中因出現(xiàn)變異苗而造成的損失。文中選用Rastrigin函數(shù)作為適應(yīng)度函數(shù),對(duì)支持向量機(jī)篩選出的引物對(duì)進(jìn)行編碼、交叉和變異。模擬出獼猴桃組織培養(yǎng)的過程,用自適應(yīng)遺傳算法構(gòu)建模型來監(jiān)測(cè)各代獼猴桃的適應(yīng)度。結(jié)果表明,動(dòng)態(tài)培育的獼猴桃植株在第一代至第九代保持自己基因的遺傳穩(wěn)定性,但到第十代,組培苗發(fā)生了較多變異。最后選用Schaffer函數(shù)和Rosenbrock函數(shù)為適應(yīng)度函數(shù)以及運(yùn)用POPGENE軟件處理引物篩選電泳圖兩種方法驗(yàn)證了實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。發(fā)現(xiàn)隨著繼代培養(yǎng)時(shí)間的增長,獼猴桃組培苗越容易出現(xiàn)變異,得到了繼代次數(shù)不宜超過九代的結(jié)論。該實(shí)驗(yàn)方案通過仿真目標(biāo)進(jìn)化過程中適應(yīng)度的變化來判定繼代苗的變異狀況,有其內(nèi)在的合理性,為解決組培監(jiān)測(cè)過程中周期長,操作復(fù)雜等問題提供了解決思路。
【學(xué)位授予單位】:昆明理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S663.4;TP18
【圖文】:

流程圖,標(biāo)準(zhǔn)遺傳算法,流程圖,遺傳算法


工大學(xué)碩士學(xué)位論文逡逑遺傳算法解決問題的步驟如下:逡逑計(jì)編碼和解碼的方式。逡逑定決策變量和各種約束條件。逡逑取合適的適應(yīng)度函數(shù)F邋(X)。逡逑定遺傳算法中交叉概率、變異概率等相關(guān)參數(shù)。逡逑行選擇、交叉、變異操作。逡逑滿足該算法收斂條件后輸出搜索結(jié)果。逡逑2.邋4基本遺傳算法的運(yùn)算流程逡逑遺傳算法的流程圖如圖2.1所示。逡逑

昆明理工大學(xué),碩士學(xué)位論文


昆明理工大學(xué)碩士學(xué)位論文邐逡逑Fir邋Edfl邋Source-邋Re?ctor邋Navigate邋^reject邋MyCcfipse;邋Mobi.?-邋S??rc*>邋Rur.邋Wir-aow邋Help逡逑:-,**邋 ̄--?..邋?-邋cs邋-:*■-s?邋-邋i-.邋-邋rp邋<;-邋?.邋:,?邋-

電泳圖,引物篩選,電泳圖,生物實(shí)驗(yàn)


]邋|逡逑圖3.1邋SVM學(xué)習(xí)結(jié)果圖逡逑其中包含有原引物對(duì)AGGCAT。也就是說,通過刪除原引物對(duì)的基因序列,逡逑可以用本方法將其識(shí)別出來。逡逑本研宄用歐式距離和SVM方法識(shí)別出組培過程中的引物對(duì),對(duì)獼猴桃基因逡逑序列進(jìn)行了仿真結(jié)果與生物實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致。本論文的生物實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)是由西南林業(yè)逡逑大學(xué)大學(xué)西南地區(qū)生物多樣性保育國家林業(yè)局重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行實(shí)驗(yàn)真實(shí)測(cè)得。實(shí)逡逑驗(yàn)采用CTAB法對(duì)獼猴桃葉片進(jìn)行DNA的提取,得到的對(duì)應(yīng)電泳圖如圖生物實(shí)逡逑驗(yàn)的結(jié)果如圖3.2所示

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2781795

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