發(fā)布時(shí)間：2024-02-29 03:07

　　本研究的目的是探討隨母哺乳和人工飼喂兩種不同飼喂方式對(duì)新生羔羊腸道微生物菌群結(jié)構(gòu)的影響,并研究在這兩種飼喂方式下早期腸道菌群的母體和環(huán)境來(lái)源以及相應(yīng)比例。試驗(yàn)選取6只妊娠母羊和它們的雙胞胎羔羊?yàn)檠芯繉?duì)象,雙胞胎羔羊出生后隨機(jī)分為隨母哺乳組和人工飼喂組,每組6只羔羊,采集母羊身體部位、羊舍環(huán)境和第3日齡時(shí)羔羊的腸道食糜樣品,檢測(cè)這些樣品的微生物組成。結(jié)果如下:不同飼喂方式對(duì)新生羔羊腸道微生物菌群結(jié)構(gòu)的影響采用16SrDNA基因測(cè)序和qPCR方法,研究隨母哺乳組和人工飼喂組兩組羔羊腸道微生物組成。結(jié)果發(fā)現(xiàn)新生羔羊腸道微生物在門(mén)水平上以擬桿菌門(mén)、厚壁菌門(mén)和變形菌門(mén)為主,在屬水平上以擬桿菌屬為主。不同飼喂方式顯著影響羔羊早期腸道微生物的組成,人工飼喂組羔羊腸道微生物的物種豐富度顯著高于隨母哺乳組羔羊,人工飼喂顯著增加了羔羊腸道中大腸桿菌/志賀氏菌,丁酸弧菌和梭菌XlVa的豐度,顯著降低了羔羊腸道中梭菌XI的豐度。新生羔羊腸道微生物菌群的來(lái)源和比例分析采用16S rDNA基因測(cè)序方法研究母羊身體部位—母體口腔、生殖道、糞便、母乳、腹部皮膚、乳房皮膚、乳頭皮膚,和羊舍環(huán)境—羊舍墻壁、羊舍地板、羊舍...

【文章頁(yè)數(shù)】：61 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖２－１信息分析流程圖??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ｆｌｏｗ?ｃｈａｒｔ?ｏｆ?ｄａｔａ?ａｎａｌｙｓｉｓ??（２）測(cè)序數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)??

基于聚類(lèi)結(jié)果，可以進(jìn)行物種注釋、ａｌｐｈａ多樣性分析和ｂｅｔａ多樣性分析；??基于注釋結(jié)果，可以得到各水平的分類(lèi)信息，從而進(jìn)行樣本組成及樣本間群落結(jié)??構(gòu)差異相關(guān)分析。整個(gè)分析流程如圖２－１所示：??８??

圖２－２樣品稀釋曲線(xiàn)

物種累積曲線(xiàn)用于描述隨著樣本量的加大物種增加的狀況，是調(diào)查樣本的物??種組成和預(yù)測(cè)樣本中物種豐富度的有效工具，被廣泛用于樣本量是否充分性的判??斷以及物種豐富度的估計(jì)。本試驗(yàn)中，我們共采集了?８３個(gè)樣品，從圖２－３可以??看出，當(dāng)樣本量為８３時(shí)，物種累積曲線(xiàn)趨于平坦，再增加樣本量....

圖２－３物種累積曲線(xiàn)??Ｆｉｇｕｒｅ?２－３?Ｓｐｅｃｉｅｓ?Ａｃｃｕｍｕｌａｔｉｏｎ?Ｃｕｒｖｅｓ??

２．２．２腸道微生物ａｌｐｈａ多樣性分析結(jié)果??在以下結(jié)果中，除非特別說(shuō)明，所有數(shù)據(jù)都用中位數(shù)的形式呈現(xiàn)。??如下圖２－４所示，隨母哺乳組和人工詞喂組中ＯＴＵｓ數(shù)量（Ｐ?＝０．０２５）和Ｃｈａｏｌ??指數(shù)（Ｐ＝０．０１１）存在顯著差異，人工飼喂組羔羊腸道微生物的ＯＴＵｓ數(shù)量和Ｃｈ....

圖２－４隨母哺乳組和人工飼喂組羔羊腸道微生物菌群ａｌｐｈａ多樣性指數(shù)（ＯＴＵｓ，??Ｃｈａｏｌ，Ｓｈａｎｎｏｎ和Ｓｉｍｐｓｏｎ）

其中１０個(gè)門(mén)的細(xì)菌相對(duì)豐度２０．１％，這１０個(gè)門(mén)水平的細(xì)菌是這兩組羔羊??腸道中的核心菌群。擬桿菌門(mén)（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ），厚壁菌門(mén)（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）和變形??菌門(mén)（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）是這兩組黑羊腸道的優(yōu)勢(shì)菌（表２－４，圖２－５?ａ），擬桿菌??門(mén)，厚壁....

本文編號(hào)：3914398