真核生物基因組極其復(fù)雜,不僅能夠產(chǎn)生編碼能力的m RNA同時(shí)還存在大量的非編碼RNA,真核生物基因組內(nèi)大約98%的區(qū)域是非編碼RNA區(qū)域。過去十年時(shí)間對于非編碼RNA的研究主要集中于短的非編碼RNA,例如micro RNAs、small interfering RNAs和Piwi-associated RNAs。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,一類新型的非編碼RNA長鏈非編碼RNA(Long noncoding RNA,lnc RNA)被逐漸發(fā)現(xiàn)。植物中研究發(fā)現(xiàn)lnc RNA能夠調(diào)控植物的抗病、開花、產(chǎn)量和果實(shí)發(fā)育等重要的生物學(xué)過程。沙棘果實(shí)發(fā)育成熟過程受到多種調(diào)節(jié)因子的協(xié)同作用,通過對參與沙棘果實(shí)成熟發(fā)育過程的關(guān)鍵調(diào)節(jié)基因以及功能元件的進(jìn)一步研究,能夠幫助研究人員更好的理解沙棘果實(shí)發(fā)育成熟過程中的分子調(diào)控機(jī)制,從而更好的進(jìn)行沙棘的培育和育種工作。因此,本研究以內(nèi)蒙古磴口縣種植的雜交種‘紅棘’沙棘的三個(gè)不同發(fā)育時(shí)期果實(shí)為試驗(yàn)材料進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序,通過建立生物信息學(xué)分析流程在全基因組水平上鑒定出高可信度沙棘長鏈非編碼RNA。對獲得的沙棘長鏈非編碼RNA進(jìn)行了序列特征、染色體分布特征和表達(dá)特征分...

【文章頁數(shù)】：116 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖1-1miRNA經(jīng)典和非經(jīng)典合成途徑[28]

第一章緒論6合成途徑包括四種，包括經(jīng)典的miRNA合成途徑、DroshaandDGCR8非依賴性途徑、TUTase依賴性途徑和Dicer非依賴性途徑[28]。如圖1-1所示，經(jīng)典的合成途徑是在細(xì)胞核內(nèi)miRNA基因首先由RNA聚合酶II催化轉(zhuǎn)錄生成pri-miRNA，隨之Dros....

圖1-2lncRNA分類[60]

第一章緒論161.1.3.1長鏈非編碼RNA（lncRNA）簡介長鏈非編碼RNA（Longnon-codingRNA，lncRNA）是一類長度超過200nt、缺乏蛋白編碼能力的內(nèi)源性非編碼RNA分子[56]。通常情況下，在結(jié)構(gòu)上大部分lncRNA都具有帽子結(jié)構(gòu)和polyA尾。此外....

圖1-3lncRNA作用機(jī)制[65]

第一章緒論19圖1-3lncRNA作用機(jī)制[65]Fig.1-3lncRNAfunctionalmechanism[65]注：（A）lncRNA介導(dǎo)的順式基因調(diào)控（B）lncRNA位點(diǎn)的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的表達(dá)調(diào)控影響（C）lncRNA位點(diǎn)處的DNA調(diào)控元件Note：(A)lncRNA-m....

圖1-4lncRNA作為內(nèi)源模擬靶標(biāo)發(fā)揮功能示意圖[75]

第一章緒論21圖1-4lncRNA作為內(nèi)源模擬靶標(biāo)發(fā)揮功能示意圖[75]Fig.1-4FunctiondiagramoflncRNAasanendogenoussimulatedtarget[75]注：（A）miRNA的一般機(jī)制：靶mRNA結(jié)合（B）miRNA：TM結(jié)合的一般機(jī)制....

本文編號：3891449