大豆成熟籽粒硬度的全基因組關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-09-21 18:50
大豆是重要的糧食和油料作物,是人類和動物最主要的植物蛋白和油脂來源之一。由大豆籽粒加工而成的豆制品是亞洲的重要傳統(tǒng)食品且其有利于人們的健康,目前豆制品在世界范圍內(nèi)正日益受歡迎。大豆籽粒硬度是大豆重要的品質(zhì)性狀,影響了納豆的質(zhì)量和加工以及菜用大豆的食味品質(zhì)。硬粒型種子不利于種子的加工,菜用大豆也需要軟粒的種子以獲得更好的口感。選育籽粒硬度較軟的大豆具有重要現(xiàn)實(shí)意義,而研究大豆籽粒硬度遺傳機(jī)制有助于提高軟粒品種選育的效率。為加深對大豆籽粒硬度遺傳機(jī)制的認(rèn)識,本研究對216份中國栽培大豆微核心種質(zhì)的籽粒硬度表型進(jìn)行鑒定,分析了不同生態(tài)區(qū)和所屬亞群之間籽粒硬度的變化以及籽粒蛋白含量、油脂含量和籽粒硬度的相關(guān)性,并分析了影響大豆籽粒硬度的因素。進(jìn)一步基于多位點(diǎn)關(guān)聯(lián)分析mrMLM方法利用1514個(gè)高質(zhì)量的SNP分子標(biāo)記對大豆籽粒硬度進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,檢測與大豆籽粒硬度顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn),在位點(diǎn)LD衰減區(qū)間內(nèi)篩選候選基因并分析其表達(dá)模式,主要研究結(jié)果如下:本研究通過質(zhì)構(gòu)儀探針破碎籽粒的最大力Fm以及探針壓入籽粒穩(wěn)定時(shí)間段(0.3-0.5s)的力隨時(shí)間變化率H兩個(gè)指標(biāo)來衡量籽粒硬度,于2011-201...
【文章頁數(shù)】:114 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 大豆籽粒硬度研究進(jìn)展
1.1 籽粒硬度測量方法
1.2 影響大豆籽粒硬度的因素
1.3 大豆籽粒硬度的連鎖分析
2 關(guān)聯(lián)分析的研究與應(yīng)用
2.1 關(guān)聯(lián)作圖群體的選擇
2.2 基因分型和表型鑒定
2.3 連鎖不平衡
2.4 群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系
2.5 關(guān)聯(lián)分析方式與方法
2.6 大豆品質(zhì)性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
3 本研究的目的意義和技術(shù)路線
3.1 研究目的和意義
3.2 研究內(nèi)容和技術(shù)路線
第二章 大豆成熟籽粒硬度表型鑒定
1 試驗(yàn)材料與方法
1.1 供試大豆材料
1.2 田間設(shè)計(jì)與管理
1.3 籽粒硬度測定方法
2 結(jié)果與分析
2.1 籽粒硬度表現(xiàn)
2.2 籽粒硬度的次數(shù)分布和方差分析
2.3 種質(zhì)材料來源生態(tài)區(qū)、所屬亞群與籽粒硬度的關(guān)系
3 討論
3.1 中國栽培大豆微核心種質(zhì)群體
3.2 大豆成熟籽粒硬度的特征
3.3 大豆成熟籽粒硬度與材料生態(tài)區(qū)和亞群的關(guān)系
第三章 大豆成熟籽粒硬度相關(guān)性狀的研究
1 試驗(yàn)材料與方法
1.1 供試大豆材料
1.2 田間設(shè)計(jì)與管理
1.3 表型鑒定方法
2 結(jié)果與分析
2.1 籽粒硬度和籽粒吸水率的相關(guān)性
2.2 籽粒蛋白、油脂和水分含量表現(xiàn)
2.3 籽粒蛋白、油脂和水分含量與材料生態(tài)區(qū)和亞群的關(guān)系
2.4 籽粒硬度與大豆其他主要品質(zhì)性狀的相關(guān)性分析
3 討論
3.1 大豆籽粒蛋白含量、油脂含量和含水量與吸水率
3.2 大豆品質(zhì)性狀與生態(tài)區(qū)和亞群的關(guān)系
3.3 大豆籽粒硬度與其他主要品質(zhì)性狀的相關(guān)性
第四章 大豆成熟籽粒硬度和油脂含量的關(guān)聯(lián)定位
1 試驗(yàn)材料與方法
1.1 供試材料
1.2 基因分型和LD分析
1.3 群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系
1.4 GWAS使用的模型
1.5 候選基因預(yù)測和注釋
1.6 候選基因表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 大豆微核心種質(zhì)LD分析、群體結(jié)構(gòu)與親緣關(guān)系
2.2 大豆籽粒硬度的全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.3 大豆籽粒油脂含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.4 大豆成熟籽粒硬度候選基因功能注釋
2.5 大豆成熟籽粒硬度候選基因表達(dá)模式
3 討論
3.1 大豆微核心種質(zhì)的LD分析、群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系
3.2 大豆微核心群體籽粒硬度和油脂含量的關(guān)聯(lián)分析
3.3 大豆籽粒硬度候選基因的功能注釋和表達(dá)分析
全文總結(jié)
本研究創(chuàng)新之處
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水稻復(fù)雜性狀研究的新途徑:水稻重要農(nóng)藝性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 侯青青,司麗珍,黃學(xué)輝,韓斌. 生命科學(xué). 2016(10)
[2]園藝作物核心種質(zhì)構(gòu)建的研究進(jìn)展[J]. 繆黎明,王神云,鄒明華,李建斌,孔李俊,余小林. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2016(05)
[3]植物關(guān)聯(lián)分析方法的研究進(jìn)展[J]. 馮建英,溫陽俊,張瑾,章元明. 作物學(xué)報(bào). 2016(07)
[4]Detection and fine-mapping of SC7 resistance genes via linkage and association analysis in soybean[J]. Honglang Yan,Hui Wang,Hao Cheng,Zhenbin Hu,Shanshan Chu,Guozheng Zhang,Deyue Yu. Journal of Integrative Plant Biology. 2015(08)
[5]水稻近等基因系構(gòu)建及應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 盛浩聞,羅麗華,肖應(yīng)輝. 作物研究. 2014(03)
[6]中國栽培大豆(Glycine max (L.) Merr.)微核心種質(zhì)的群體結(jié)構(gòu)與遺傳多樣性[J]. 宋喜娥,李英慧,常汝鎮(zhèn),郭平毅,邱麗娟. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(11)
[7]大豆核心種質(zhì)和微核心種質(zhì)的構(gòu)建、驗(yàn)證與研究進(jìn)展[J]. 邱麗娟,李英慧,關(guān)榮霞,劉章雄,王麗俠,常汝鎮(zhèn). 作物學(xué)報(bào). 2009(04)
[8]植物遺傳資源核心種質(zhì)新概念與應(yīng)用進(jìn)展[J]. 王建成,胡晉,黃歆賢,徐盛春. 種子. 2008(05)
[9]我國小麥硬度質(zhì)量狀況和硬度分類的研究[J]. 孫輝,吳存榮,楊中建,姜薇莉,唐懷建,周展明. 中國糧油學(xué)報(bào). 2008(03)
[10]桃(Prunus persica(L.) Batsch.)品種核心種質(zhì)的構(gòu)建與評價(jià)[J]. 李銀霞,安麗君,姜全,趙劍波,李天紅. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(05)
博士論文
[1]中國大豆品種生育期組的精細(xì)劃分與應(yīng)用[D]. 宋雯雯.中國科學(xué)院研究生院(東北地理與農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所) 2016
本文編號:3680476
【文章頁數(shù)】:114 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 大豆籽粒硬度研究進(jìn)展
1.1 籽粒硬度測量方法
1.2 影響大豆籽粒硬度的因素
1.3 大豆籽粒硬度的連鎖分析
2 關(guān)聯(lián)分析的研究與應(yīng)用
2.1 關(guān)聯(lián)作圖群體的選擇
2.2 基因分型和表型鑒定
2.3 連鎖不平衡
2.4 群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系
2.5 關(guān)聯(lián)分析方式與方法
2.6 大豆品質(zhì)性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
3 本研究的目的意義和技術(shù)路線
3.1 研究目的和意義
3.2 研究內(nèi)容和技術(shù)路線
第二章 大豆成熟籽粒硬度表型鑒定
1 試驗(yàn)材料與方法
1.1 供試大豆材料
1.2 田間設(shè)計(jì)與管理
1.3 籽粒硬度測定方法
2 結(jié)果與分析
2.1 籽粒硬度表現(xiàn)
2.2 籽粒硬度的次數(shù)分布和方差分析
2.3 種質(zhì)材料來源生態(tài)區(qū)、所屬亞群與籽粒硬度的關(guān)系
3 討論
3.1 中國栽培大豆微核心種質(zhì)群體
3.2 大豆成熟籽粒硬度的特征
3.3 大豆成熟籽粒硬度與材料生態(tài)區(qū)和亞群的關(guān)系
第三章 大豆成熟籽粒硬度相關(guān)性狀的研究
1 試驗(yàn)材料與方法
1.1 供試大豆材料
1.2 田間設(shè)計(jì)與管理
1.3 表型鑒定方法
2 結(jié)果與分析
2.1 籽粒硬度和籽粒吸水率的相關(guān)性
2.2 籽粒蛋白、油脂和水分含量表現(xiàn)
2.3 籽粒蛋白、油脂和水分含量與材料生態(tài)區(qū)和亞群的關(guān)系
2.4 籽粒硬度與大豆其他主要品質(zhì)性狀的相關(guān)性分析
3 討論
3.1 大豆籽粒蛋白含量、油脂含量和含水量與吸水率
3.2 大豆品質(zhì)性狀與生態(tài)區(qū)和亞群的關(guān)系
3.3 大豆籽粒硬度與其他主要品質(zhì)性狀的相關(guān)性
第四章 大豆成熟籽粒硬度和油脂含量的關(guān)聯(lián)定位
1 試驗(yàn)材料與方法
1.1 供試材料
1.2 基因分型和LD分析
1.3 群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系
1.4 GWAS使用的模型
1.5 候選基因預(yù)測和注釋
1.6 候選基因表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 大豆微核心種質(zhì)LD分析、群體結(jié)構(gòu)與親緣關(guān)系
2.2 大豆籽粒硬度的全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.3 大豆籽粒油脂含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.4 大豆成熟籽粒硬度候選基因功能注釋
2.5 大豆成熟籽粒硬度候選基因表達(dá)模式
3 討論
3.1 大豆微核心種質(zhì)的LD分析、群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系
3.2 大豆微核心群體籽粒硬度和油脂含量的關(guān)聯(lián)分析
3.3 大豆籽粒硬度候選基因的功能注釋和表達(dá)分析
全文總結(jié)
本研究創(chuàng)新之處
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水稻復(fù)雜性狀研究的新途徑:水稻重要農(nóng)藝性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 侯青青,司麗珍,黃學(xué)輝,韓斌. 生命科學(xué). 2016(10)
[2]園藝作物核心種質(zhì)構(gòu)建的研究進(jìn)展[J]. 繆黎明,王神云,鄒明華,李建斌,孔李俊,余小林. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2016(05)
[3]植物關(guān)聯(lián)分析方法的研究進(jìn)展[J]. 馮建英,溫陽俊,張瑾,章元明. 作物學(xué)報(bào). 2016(07)
[4]Detection and fine-mapping of SC7 resistance genes via linkage and association analysis in soybean[J]. Honglang Yan,Hui Wang,Hao Cheng,Zhenbin Hu,Shanshan Chu,Guozheng Zhang,Deyue Yu. Journal of Integrative Plant Biology. 2015(08)
[5]水稻近等基因系構(gòu)建及應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 盛浩聞,羅麗華,肖應(yīng)輝. 作物研究. 2014(03)
[6]中國栽培大豆(Glycine max (L.) Merr.)微核心種質(zhì)的群體結(jié)構(gòu)與遺傳多樣性[J]. 宋喜娥,李英慧,常汝鎮(zhèn),郭平毅,邱麗娟. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(11)
[7]大豆核心種質(zhì)和微核心種質(zhì)的構(gòu)建、驗(yàn)證與研究進(jìn)展[J]. 邱麗娟,李英慧,關(guān)榮霞,劉章雄,王麗俠,常汝鎮(zhèn). 作物學(xué)報(bào). 2009(04)
[8]植物遺傳資源核心種質(zhì)新概念與應(yīng)用進(jìn)展[J]. 王建成,胡晉,黃歆賢,徐盛春. 種子. 2008(05)
[9]我國小麥硬度質(zhì)量狀況和硬度分類的研究[J]. 孫輝,吳存榮,楊中建,姜薇莉,唐懷建,周展明. 中國糧油學(xué)報(bào). 2008(03)
[10]桃(Prunus persica(L.) Batsch.)品種核心種質(zhì)的構(gòu)建與評價(jià)[J]. 李銀霞,安麗君,姜全,趙劍波,李天紅. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(05)
博士論文
[1]中國大豆品種生育期組的精細(xì)劃分與應(yīng)用[D]. 宋雯雯.中國科學(xué)院研究生院(東北地理與農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所) 2016
本文編號:3680476
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