豬流行性腹瀉病毒遺傳變異分析及S1蛋白N端區(qū)域?qū)Σ《緩椭频挠绊?/H1>
發(fā)布時間:2022-02-27 07:50
豬流行性腹瀉(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的,主要癥狀以嘔吐、腹瀉和脫水為主的急性腸道傳染病。各年齡豬均可感染PEDV,但主要在仔豬中有較高的死亡率。近年來,PEDV的不斷變異給PED的防控帶來了許多問題。本研究圍繞PEDV的分子流行病學和新出現(xiàn)的S1基因N端區(qū)域大片段缺失毒株展開研究,分析了PEDV的遺傳變異特征、建立了鑒別檢測PEDV經(jīng)典株和變異株的雙重TaqMan RT-qPCR方法并探究了PEDV S1蛋白N端區(qū)域的致病機制,取得了以下結(jié)果:1.檢測了從2014年7月至2015年7月收集的129份來自中國中部地區(qū)17個城市的仔豬腹瀉樣本;赟糖蛋白[Spike,1-789個氨基酸(aa)]的S1亞基和ORF3基因,我們對來自11個城市21個豬場的21個代表性PEDV毒株進行了遺傳變異分析。通過RT-PCR方法進行PEDV的檢測,通過DNAMAN 8軟件Clustal W方法分析S1和ORF3基因序列,并使用MEGA 6軟件鄰近法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學陜西省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:115 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
boshi
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