miRNA、mRNA調(diào)控新疆褐牛和哈薩克牛肉質(zhì)成脂性狀分子機制研究
發(fā)布時間:2022-01-23 20:46
新疆褐牛與哈薩克牛同為新疆優(yōu)良的地方品種,以哈薩克牛為母本,經(jīng)過肉用方向培育的新品種新疆褐牛,其胴體品質(zhì)和肉質(zhì)特性得到明顯改善。目前研究認為,影響新疆褐牛與哈薩克牛肉質(zhì)性狀系統(tǒng)差異以及分子機制,尚不清晰。本研究以新疆褐牛和哈薩克牛為研究對象,系統(tǒng)分析了兩品種屠宰性能、胴體性狀、肉質(zhì)性狀,研究兩個品種間肉質(zhì)性狀的特征,同時運用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(RNA-Seq)對兩個品種牛背最長肌組織mRNA與miRNA的表達情況進行研究,以期闡明鑒定出影響新疆褐牛與哈薩克牛肉質(zhì)性狀差異的功能基因與調(diào)控通路,本研究主要結(jié)果如下:(1)新疆褐牛與哈薩克牛肉質(zhì)性狀分析胴體指標測定結(jié)果表明,新疆褐牛大理石花紋(p<0.05)、背膘厚度(p<0.01)顯著高于哈薩克牛,且眼肌面積平均比哈薩克牛提高1.8%,優(yōu)質(zhì)肉產(chǎn)量得到改善。肉質(zhì)性狀測定結(jié)果表明:新疆褐牛失水率、剪切力極顯著低于哈薩克牛(p<0.01),牛肉色澤和pH值方面兩個品種間無顯著差異(p>0.05);營養(yǎng)品質(zhì)指標測定結(jié)果表明:新疆褐牛背最長肌中水分(p<0.01)、脂肪含量(p<0.05)顯著高于哈薩克牛,蛋白質(zhì)含量極...
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:135 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
新疆褐牛與哈薩克牛牛背最長肌組織樣本總RNA電泳膠圖
圖 3-1 新疆褐牛與哈薩克牛牛背最長肌組織樣本總 RNA 電泳膠圖Figure 3-1 Total RNA electrophoresis gel of the longissimus dorsi tissue samples of Xinjiang brown cattleand Kazakh cattle注:X1、X2、X3 為哈薩克牛背最長肌組織樣本總 RNA 電泳圖,Y1、Y2、Y3 為新疆褐牛背最長肌組織樣本總 RNA 電泳圖。
30甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆博士學(xué)位論文比對上參考基因組的 clean reads 比例 94.90% 94.32% 94.47% 94.44% 93.95% 94.15%唯一比對上參考基因組某一位置的clean reads 比例82.40% 81.78% 82.08% 83.19% 83.19% 83.23%3.3.3 基因表達分析測序飽和度分析可以在一定程度上判斷測序數(shù)據(jù)量是否滿足要求。隨著測序量(Reads 數(shù)量)的增加,檢測到的基因數(shù)也隨之上升,當(dāng)測序量達到一定區(qū)間后其檢測到的基因數(shù)增長速度趨于平緩,表明所檢測到的基因數(shù)趨于飽和,此時測序量結(jié)果達到要求。本試驗中新疆褐牛與哈薩克牛各樣本測序所檢測到的基因數(shù)增長速度趨于平緩,基因數(shù)趨于飽和,其表達量達到要求,結(jié)果見圖 3-3。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]傳統(tǒng)風(fēng)干牦牛肉加工過程中新鮮度的變化[J]. 宋艷艷,馬紀兵,王惠惠,崔文斌,劉小波,張麗,余群力,魏晉梅,郭兆斌. 食品與發(fā)酵科技. 2019(01)
[2]BCG感染牛肺泡巨噬細胞的轉(zhuǎn)錄組測序和分析[J]. 徐金瑞,呂翠萍,楊易,周彥兵,駱佳,王玉炯. 吉林大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2019(01)
[3]牦牛肉牛瘤胃平滑肌肌原纖維蛋白特性及品質(zhì)變化差異分析[J]. 劉慧,余群力,朱躍明,張文華,薄文喜,韓玲. 現(xiàn)代食品科技. 2019(02)
[4]排酸成熟時間對不同品種牛肉質(zhì)影響的研究[J]. 閆向民,謝鵬貴,崔繁榮,葉治兵,李紅波,李娜,袁理星,周振勇,張金山. 畜牧與獸醫(yī). 2018(12)
[5]兩種冷卻方式對宰后成熟過程中牛肉保水性的影響[J]. 惠小洋,余群力,曹暉,韓廣星,吳磊,韓玲. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2018(11)
[6]牦牛骨骼肌、平滑肌和心肌氨基酸和脂肪酸組成分析及營養(yǎng)評價[J]. 李升升,余群力. 營養(yǎng)學(xué)報. 2018(02)
[7]CD46基因在新疆褐牛不同組織中的表達研究[J]. 木哈買提江·鐵格斯,張慧敏,宋煥堂,加爾肯,蘇戰(zhàn)強,冉多良,劉建華. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(06)
[8]‘西門塔爾雜交!c‘平?jīng)黾t!煌课蝗馄焚|(zhì)分析[J]. 韓冬潔,余群力,韓玲,朱躍明,謝卿. 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2016(05)
[9]新疆褐牛POU1F1基因PCR-RFLP分析[J]. 陳然,王傳波,李春明,曹春娜,張燁輝. 新疆畜牧業(yè). 2016(06)
[10]ADIG誘導(dǎo)牛成肌細胞轉(zhuǎn)分化及相關(guān)基因的表達分析[J]. 梅楚剛,張瓊,付常振,劉揚,姜碧杰,成功,昝林森. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2016(04)
博士論文
[1]豬背最長肌肌內(nèi)脂肪含量相關(guān)基因的篩選及表達分析[D]. 王昱丁.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]1. MiR-133a,miR-1,miR-206誘導(dǎo)C2C12細胞成肌前體細胞及miR-133a靶基因Fox12鑒定的研究 2. IL-28B多態(tài)性位點及血清維生素D水平在HCV感染病人中的相關(guān)性分析研究[D]. 羅月球.浙江大學(xué) 2015
[3]秦川牛肌肉生長發(fā)育相關(guān)基因和蛋白質(zhì)的篩選及其初步鑒定[D]. 賀花.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[4]牛FABP4基因代謝功能研究及品種間脂肪細胞發(fā)育特性分析[D]. 魏勝娟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[5]肉牛脂肪組織和背最長肌脂代謝相關(guān)基因差異表達分析[D]. 戢爽.吉林大學(xué) 2013
[6]中國主要牛種肌肉組織基因表達譜特征比較分析[D]. 張鶯鶯.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
碩士論文
[1]我國牛病毒性腹瀉病毒流行情況的Meta分析及感染BVDV的MDBK細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[D]. 馬莉莉.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2018
[2]隆林黃牛、荷斯坦牛和西林水牛的肉質(zhì)、肌纖維和酶活性差異的研究[D]. 方程.廣西大學(xué) 2018
[3]西門塔爾牛及雜種和牛兩群體的肉質(zhì)性狀全基因組關(guān)聯(lián)研究與選擇信號分析[D]. 史新平.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]云嶺牛和文山牛背最長肌肉質(zhì)特性及DNA甲基化分析[D]. 王文強.揚州大學(xué) 2017
[5]IRS-1通過miR-143調(diào)節(jié)前脂肪細胞分化的作用與機制研究[D]. 劉雅青.中南大學(xué) 2014
[6]新疆褐牛POU1F1基因第六外顯子多態(tài)性及mRNA表達相關(guān)研究[D]. 劉磊.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號:3605121
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:135 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
新疆褐牛與哈薩克牛牛背最長肌組織樣本總RNA電泳膠圖
圖 3-1 新疆褐牛與哈薩克牛牛背最長肌組織樣本總 RNA 電泳膠圖Figure 3-1 Total RNA electrophoresis gel of the longissimus dorsi tissue samples of Xinjiang brown cattleand Kazakh cattle注:X1、X2、X3 為哈薩克牛背最長肌組織樣本總 RNA 電泳圖,Y1、Y2、Y3 為新疆褐牛背最長肌組織樣本總 RNA 電泳圖。
30甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆博士學(xué)位論文比對上參考基因組的 clean reads 比例 94.90% 94.32% 94.47% 94.44% 93.95% 94.15%唯一比對上參考基因組某一位置的clean reads 比例82.40% 81.78% 82.08% 83.19% 83.19% 83.23%3.3.3 基因表達分析測序飽和度分析可以在一定程度上判斷測序數(shù)據(jù)量是否滿足要求。隨著測序量(Reads 數(shù)量)的增加,檢測到的基因數(shù)也隨之上升,當(dāng)測序量達到一定區(qū)間后其檢測到的基因數(shù)增長速度趨于平緩,表明所檢測到的基因數(shù)趨于飽和,此時測序量結(jié)果達到要求。本試驗中新疆褐牛與哈薩克牛各樣本測序所檢測到的基因數(shù)增長速度趨于平緩,基因數(shù)趨于飽和,其表達量達到要求,結(jié)果見圖 3-3。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]傳統(tǒng)風(fēng)干牦牛肉加工過程中新鮮度的變化[J]. 宋艷艷,馬紀兵,王惠惠,崔文斌,劉小波,張麗,余群力,魏晉梅,郭兆斌. 食品與發(fā)酵科技. 2019(01)
[2]BCG感染牛肺泡巨噬細胞的轉(zhuǎn)錄組測序和分析[J]. 徐金瑞,呂翠萍,楊易,周彥兵,駱佳,王玉炯. 吉林大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2019(01)
[3]牦牛肉牛瘤胃平滑肌肌原纖維蛋白特性及品質(zhì)變化差異分析[J]. 劉慧,余群力,朱躍明,張文華,薄文喜,韓玲. 現(xiàn)代食品科技. 2019(02)
[4]排酸成熟時間對不同品種牛肉質(zhì)影響的研究[J]. 閆向民,謝鵬貴,崔繁榮,葉治兵,李紅波,李娜,袁理星,周振勇,張金山. 畜牧與獸醫(yī). 2018(12)
[5]兩種冷卻方式對宰后成熟過程中牛肉保水性的影響[J]. 惠小洋,余群力,曹暉,韓廣星,吳磊,韓玲. 食品與發(fā)酵工業(yè). 2018(11)
[6]牦牛骨骼肌、平滑肌和心肌氨基酸和脂肪酸組成分析及營養(yǎng)評價[J]. 李升升,余群力. 營養(yǎng)學(xué)報. 2018(02)
[7]CD46基因在新疆褐牛不同組織中的表達研究[J]. 木哈買提江·鐵格斯,張慧敏,宋煥堂,加爾肯,蘇戰(zhàn)強,冉多良,劉建華. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(06)
[8]‘西門塔爾雜交!c‘平?jīng)黾t!煌课蝗馄焚|(zhì)分析[J]. 韓冬潔,余群力,韓玲,朱躍明,謝卿. 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2016(05)
[9]新疆褐牛POU1F1基因PCR-RFLP分析[J]. 陳然,王傳波,李春明,曹春娜,張燁輝. 新疆畜牧業(yè). 2016(06)
[10]ADIG誘導(dǎo)牛成肌細胞轉(zhuǎn)分化及相關(guān)基因的表達分析[J]. 梅楚剛,張瓊,付常振,劉揚,姜碧杰,成功,昝林森. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2016(04)
博士論文
[1]豬背最長肌肌內(nèi)脂肪含量相關(guān)基因的篩選及表達分析[D]. 王昱丁.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]1. MiR-133a,miR-1,miR-206誘導(dǎo)C2C12細胞成肌前體細胞及miR-133a靶基因Fox12鑒定的研究 2. IL-28B多態(tài)性位點及血清維生素D水平在HCV感染病人中的相關(guān)性分析研究[D]. 羅月球.浙江大學(xué) 2015
[3]秦川牛肌肉生長發(fā)育相關(guān)基因和蛋白質(zhì)的篩選及其初步鑒定[D]. 賀花.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[4]牛FABP4基因代謝功能研究及品種間脂肪細胞發(fā)育特性分析[D]. 魏勝娟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[5]肉牛脂肪組織和背最長肌脂代謝相關(guān)基因差異表達分析[D]. 戢爽.吉林大學(xué) 2013
[6]中國主要牛種肌肉組織基因表達譜特征比較分析[D]. 張鶯鶯.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
碩士論文
[1]我國牛病毒性腹瀉病毒流行情況的Meta分析及感染BVDV的MDBK細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[D]. 馬莉莉.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2018
[2]隆林黃牛、荷斯坦牛和西林水牛的肉質(zhì)、肌纖維和酶活性差異的研究[D]. 方程.廣西大學(xué) 2018
[3]西門塔爾牛及雜種和牛兩群體的肉質(zhì)性狀全基因組關(guān)聯(lián)研究與選擇信號分析[D]. 史新平.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]云嶺牛和文山牛背最長肌肉質(zhì)特性及DNA甲基化分析[D]. 王文強.揚州大學(xué) 2017
[5]IRS-1通過miR-143調(diào)節(jié)前脂肪細胞分化的作用與機制研究[D]. 劉雅青.中南大學(xué) 2014
[6]新疆褐牛POU1F1基因第六外顯子多態(tài)性及mRNA表達相關(guān)研究[D]. 劉磊.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號:3605121
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