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海島棉類受體蛋白基因GbVDR5和GbVDR6的抗黃萎病功能分析

發(fā)布時間:2022-01-15 05:49
  棉花黃萎病是影響我國棉花生產(chǎn)最主要的病害,致病菌為大麗輪枝菌(Verticillum dahliae)。目前尚無針對這種病害的有效藥劑,只能依靠種植抗病品種為主的綜合防治措施防治病害大發(fā)生。黃萎病的抗性資源主要存在于海島棉(Gossypium barbadense L)以及野生棉中,但由于存在種間障礙,很難直接利用。因此,克隆抗性基因、解析其抗病機制對抗黃萎病育種具有重要意義。類受體蛋白基因(RLPs)在植物抗病與發(fā)育中發(fā)揮重要作用,其中番茄(Solanum lycopersicum)Ve1是第一個通過圖位克隆獲得的抗黃萎病基因。為了獲得棉花Ve類似基因,首先利用棉花EST庫中Ve同源片段篩選棉花BAC文庫(來源于耐病棉花品種Acala maxxa),并獲得了 40個BAC 陽性克隆。進一步利用染色體步移(genomewalking)和RT-PCR,獲得抗病海島棉品種海7124中Ve類似基因GbVDR5和GbVDR6。GbVDR5的開放閱讀框為3234 bp,編碼1077 aa的蛋白。與之相比感病材料軍棉1號,渝棉1號,蘇棉12以及泗棉3號中的等位基因在第2766 nt位置缺失了胞嘧啶... 

【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:115 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

海島棉類受體蛋白基因GbVDR5和GbVDR6的抗黃萎病功能分析


圖1.1?RLP以及RLK的激活模式圖(引自Gust?&?Felix?Ci?2014)??a:?RLP蛋白通過其LRR結(jié)構(gòu)域與類受體激酶SOBIR]結(jié)合;b:?RLP與SOBIR1形成雙分子??受體激酶與RLK調(diào)控通路類似??

電泳圖,基因,片段,電泳圖


EST庫中設(shè)/基因的相??似片段作為探針篩選棉花BAC?(細菌人工染色體組)文庫,構(gòu)建文庫所用棉花品種為??Acalamaxxa,?Acalamaxxa為一種耐黃萎病的陸地棉品種(Erdoganetal,2010)。通過??篩選一共得到40個BAC陽性克攏用CveF和CveR在擴增BAC克隆C9中獲得了??1?Kb片段,根據(jù)該片段設(shè)計genomewalking引物擴增5’以及3’的未知片段。??Genomewalking擴増獲得了?5’未知片段約1.6?Kb,3’未知片段約2?Kb?(圖2.2),將這??兩個片段與原序列拼接,獲得了?C9中RLP基因的完整開放讀碼框。根據(jù)預(yù)測的讀碼??框設(shè)計擴增基因全長的引物C9F-BamHl核C9R-Kpnl并對BAC克。茫惯M行擴增,??獲得3.2Kb左右的條帶(圖2.2)。測序結(jié)果表明C9中的冷類似基因編碼框長度為3237??bp,編碼1078?aa,該蛋白的分子量為118.83?kDa,等電點為6.32。??3kb—_?:!?,,??2kb^_?,:e;^?^??1kb-^??1?一?■?h,:-^;;s?'?■"?1??0J5kb^■:':;:??0.5kb^H?^?i:?ll|?,u?^?I??圖2.2?Genomewalking擴增基因的5’和3’未知片段以及RT-PCR擴增基因全長的電泳圖??Fig?2.2?Electrophorogram?of?the?unknown?fragment?amplified?by?genomewalking?and?the?full??length?of?the?gene?by?RT-PCR.??28??

氨基,基因,材料,結(jié)構(gòu)域


?海島棉類受體蛋白基因和Gfa辦6的抗黃萎病功能分析???啶(C)(圖2.4)因而發(fā)生了移碼突變,出現(xiàn)了提前終止子,編碼的氨基酸長度僅為??937個氨基酸(圖2.5)。結(jié)構(gòu)域分析表明該蛋白缺失了?N端的跨膜結(jié)構(gòu)域,并且只含??有27個LRR結(jié)構(gòu)域(圖2.3)。??2610?2620?2630?2640?2650?2660?2670?26S0??????????I?????■???I?????■???I?_???????I?????????I???■?????I?????????I?????????I?????????I?■???????I?■?■?????I?????????I?■?■?????I?????■?■?I?■?■?????I??Acaia?m?j?Jr???3??Junmian?j?JE????Sumian_?j?JJ???_?迓:二'??,.?3,;?.?:?^?'v;r?'vL?.?Q?'■■':.?'£?';:??Yumian_?s?3E?j?免t533—1!t?1153嗛??simian_?s?26?2?9(jQQQQ^jQ^^QQQQQ^9|^QQ^Suu^9ujQQuDQQEm1Q^9QuQuE。蓿梗眩眩眩溃眩眩眩蓿蓿樱拢拢眩蓿蓿酰眩拢拢酰。蓿玻剩眩拢模眩酰蓿酰拢眩蓿蓿常眩眩蓿蓿眩眨蓿梗??2690?2700?2710?2720?2730?2740?2750?2760???_????I???■?.?.?i?.?.?.?.?i?????■???I?????????i?■?■?????i?■???■?.?i?-?■?-???i?????-?,

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
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本文編號:3590028

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