中國(guó)是第一養(yǎng)豬大國(guó),也是第一豬肉消費(fèi)大國(guó),隨著消費(fèi)者對(duì)豬肉品質(zhì)要求的不斷提高,優(yōu)質(zhì)豬肉的生產(chǎn)已成為養(yǎng)豬業(yè)亟待解決的重要問(wèn)題。肌內(nèi)脂肪是評(píng)價(jià)豬肉品質(zhì)的一個(gè)重要指標(biāo),其與肉的嫩度、風(fēng)味等肉品質(zhì)性狀有著密切的聯(lián)系。肌內(nèi)脂肪性狀的遺傳改良一直是豬遺傳育種領(lǐng)域關(guān)注的重點(diǎn),然而,長(zhǎng)期以來(lái)利用常規(guī)育種技術(shù)進(jìn)行豬肌內(nèi)脂肪性狀的遺傳改良效果并不理想。因此,█鑒定影響肌內(nèi)脂肪性狀的關(guān)鍵基因,開(kāi)發(fā)出有價(jià)值的分子標(biāo)記,對(duì)開(kāi)展肌內(nèi)脂肪性狀的早期、準(zhǔn)確選育,對(duì)加快豬肌內(nèi)脂肪性狀的遺傳改良進(jìn)程及提高豬肉品質(zhì)有著非常重要的意義。本研究利用全基因組重測(cè)序及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)對(duì)影響豬肌內(nèi)脂肪的變異位點(diǎn)及關(guān)鍵候選基因進(jìn)行鑒定,其研究結(jié)果可為深入開(kāi)展肌內(nèi)脂肪形成的分子調(diào)控機(jī)制的研究,以及分子標(biāo)記技術(shù)的研發(fā)奠定理論基礎(chǔ)。1.利用全基因組重測(cè)序技術(shù)鑒定影響豬肌內(nèi)脂肪的關(guān)鍵遺傳變異位點(diǎn)本研究以1,310頭皮杜長(zhǎng)大四元雜交豬為研究群體,利用索氏抽提法對(duì)其背最長(zhǎng)肌中肌內(nèi)脂肪進(jìn)行提取。從中選取極高或低肌內(nèi)脂肪個(gè)體各30個(gè),且它們之間肌內(nèi)脂肪含量差異極顯著（P<0.01）。對(duì)高組和低組的30個(gè)個(gè)體分別進(jìn)行等量混池后構(gòu)建了兩個(gè)文庫(kù)且在Hi... 

【文章來(lái)源】：南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：163 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖１－３不同類(lèi)型脂肪細(xì)胞分化的來(lái)源１??Ｆｉｇ．?１－３?Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ?ｏｒｉｇｉｎｓ?ｆｏｒ?ｄｉｓｔｉｎｃｔ?ｔｙｐｅｓ?ｏｆ?ａｄｉｐｏｃｙｔｅ??

?ＳＲＥＢＰｌｃ）和早期?Ｂ?細(xì)胞因子?１?（ｅａｒｌｙ?Ｂ－ｃｅｌｌ?ｆａｃｔｏｒ?１，Ｅｂｆｌ）??的表達(dá)［６（）］。ＳＲＥＢＰｌｃ是一種重要的促脂肪細(xì)胞生成轉(zhuǎn)錄因子，可調(diào)節(jié)許多脂質(zhì)代謝??基因的表達(dá)，并有助于內(nèi)源性ＰＰＡＲ配體的產(chǎn)生［６１］。此外，Ｅｂｆｌ也通過(guò)激活ＰＰＡＲｙ??轉(zhuǎn)錄來(lái)促進(jìn)脂肪形成。另一方面，Ｃ／ＥＢＰ卩通過(guò)抑制ＷｎｔｌＯｂ的表達(dá)進(jìn)而來(lái)抑制??Ｗｎｔ／ｐ－ｃａｔｅｎｉｎ信號(hào)通路�？偠灾�，這些研宄結(jié)果揭示了?Ｃ／ＥＢＰＰ在終末脂肪細(xì)胞分??化中有著許多重要的功能（圖１－５）。??Ｇｒｏｗｔｈ?Ａｒｒｅｓｔｅｄ??Ｐｒｅａｄｉｐｏｃｙｔｅｓ??＆?＾?＾?—ｉ?＾?｜??ＰＫＭ２?????爾??＼?德多?一?￣?：?Ａｕｔｏｐｈａｇｙ?…Ｈ??１?＇ｑ／ＪＢＰ，／?｜?Ｉ??＼?＼?Ｉ?Ｉｆ??＇？?＾?§１??＼?－?－?－＞?ｉｓｒ?＾?ｙ??ＶＣｇ��？——－＞??Ｍａｔｕｒｅ?Ａｄｉｐｏｃｙｔｅｓ??圖１－５?Ｃ／ＥＢＰｐ在脂肪形成中的許多功能［６２］??Ｆｉｇ．?１－５?Ｍｕｌｔｉｐｌｅ?ｆｕｎｃｔｉｏｎｓ?ｏｆ?Ｃ／ＥＢＰｐ?ｄｕｒｉｎｇ?ａｄｉｐｏｇｅｎｅｓｉｓ??６??

Ｗｈｏｌｅ－ｇｅｎｏｍｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ??Ｕｎｐｏｏｌｅｄ??Ｕ?■＿?■■＿?丨丨丨??＾?＊■＿?＾?｜｜ＭｅｇＨ？￥?ＢｔｗｉＯＴＭＪｇｇ?Ｍｊｉ＾ｗｗｉｇｇ?ＳＳＳＳ＞＾�。樱�??＼Ｊ?二二—‘??＼Ｊ??Ｐｏｏｌｅｄ??“?ｗ??、秦?ｉ．，??Ｉ?＿?ａ??］Ｈ？Ｉ??ＪＳＥＳＢＨ??＇?々、，、ｉ?一：１?＾?Ｌ－乂?丨＂，?，｜＾？?ｆ?一?‘…一?＇?－?＇…??〇．?？?＞?ｐ－Ｍ．?－?—??／曹’、??圖２－１?ｐｏｏｌ－ｓｅｑ的示意圖［＿??Ｆｉｇ．?２－１?Ｓｃｈｅｍａｔｉｃ?ｏｆ?ｐｏｏｌ－ｓｅｑ??３．１?ｐｏｏｌ－ｓｅｑ的測(cè)序成本優(yōu)點(diǎn)??群體遺傳的研究關(guān)鍵在于鑒定基因組多態(tài)性位點(diǎn)和在許多群體中變異位點(diǎn)的堿??基頻率的信息。利用群體樣本中多個(gè)個(gè)體進(jìn)行遺傳分析能夠強(qiáng)有力的增加基因頻率的??準(zhǔn)確性［１６６］。Ｐｏｏｌ－ｓｅｑ比個(gè)體測(cè)序能夠在降低成本的前提下更加準(zhǔn)確的分析基因組變異??位點(diǎn)的頻率［１６７］。為了準(zhǔn)確分析這些遺傳差異，基因頻率的結(jié)果來(lái)自于一個(gè)大的群體??抽樣是至關(guān)重要的；較小的樣本會(huì)受到更大的采樣方差，即使在樣品中的等位基因頻??率能夠被準(zhǔn)確分析與計(jì)算，但是可能會(huì)導(dǎo)致相當(dāng)大的誤差［１６８］。換而言之，精確測(cè)序??小樣本群體仍將能夠?qū)е滤^等位基因頻率估計(jì)產(chǎn)生誤差。??當(dāng)考慮測(cè)序建庫(kù)的費(fèi)用時(shí)Ｐ〇〇〗－ｓｅｑ的成本效益是更加明顯的，Ｐｏｏｌ－ｓｅｑ測(cè)序時(shí)只??需要對(duì)整個(gè)樣本建一個(gè)測(cè)序文庫(kù)，而個(gè)體測(cè)序則需要對(duì)于每個(gè)個(gè)體都需要構(gòu)建文庫(kù)。??文庫(kù)的構(gòu)建相當(dāng)于一個(gè)中等基因組測(cè)序費(fèi)用的２０％，因此它也是測(cè)序中影響成本一項(xiàng)??重要的因素。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Expression profiling analysis for genes related to meat quality and carcass traits during postnatal development of backfat in two pig breeds[J]. LI MingZhou1, ZHU Li1, LI XueWei1, SHUAI SuRong1, TENG XiaoKun2, XIAO HuaSheng2, LI Qiang1, CHEN Lei1, GUO YuJiao1 & WANG JinYong3.  Science in China（Series C:Life Sciences）. 2008(08)



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