大豆疫霉無(wú)毒基因PsAvr3c的功能與作用機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-13 13:01
大豆疫霉(Phytophthora sojae)侵染大豆引起的疫霉根腐病是大豆生產(chǎn)上的毀滅性病害,平均每年給全世界大豆生產(chǎn)造成10-20億美元的經(jīng)濟(jì)損失,防控大豆疫霉根腐病最經(jīng)濟(jì)有效的方式是種植抗病大豆品種。大豆疫霉與大豆的互作符合“基因?qū)颉奔僬f(shuō):當(dāng)大豆疫霉攜帶無(wú)毒(Avr)基因而大豆攜帶對(duì)應(yīng)的抗病受體(R)基因時(shí),大豆R受體如果能特異性地識(shí)別疫霉菌Avr基因產(chǎn)物,就能為大豆提供對(duì)大豆疫霉的抗性。因此,研究大豆疫霉無(wú)毒基因的功能及其作用機(jī)制,不僅可以深入理解疫霉菌病害侵染機(jī)制,而且能為設(shè)計(jì)大豆疫病防控方法提供新的研究思路。本研究以無(wú)毒基因PsAvr3c為研究對(duì)象,通過一系列遺傳、生化、細(xì)胞生物學(xué)實(shí)驗(yàn)并結(jié)合轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等手段,發(fā)現(xiàn)PsAvr3c與植物可變剪切復(fù)合體中的一類新型調(diào)控蛋白GmSKRPs互作,從而大規(guī)模重編程寄主基因的pre-m RNA可變剪切抑制植物免疫。病菌無(wú)毒基因通常通過基因缺失、序列變異或者轉(zhuǎn)錄沉默等多種方式逃避植物抗病基因的識(shí)別,而PsAvr3c逃避抗病基因識(shí)別的分子機(jī)理尚不清楚。本研究通過定點(diǎn)突變結(jié)合群體序列分析發(fā)現(xiàn)PsAvr3c通過將第174位絲氨酸突變?yōu)楦拾彼?..
【文章來(lái)源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:222 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1-2卵菌無(wú)毒基因的基因結(jié)構(gòu)(Morgan?&Kamoun,?2007)??Fi.?1-2?The?oomcete?avirulentene?structureatternMoran?&?Kamoun2007
ER序列突變??為AAAAAA以后,PsAvrlb就會(huì)喪失進(jìn)入大豆細(xì)胞的能力,這說(shuō)明dEER序列對(duì)于??效應(yīng)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)很重要(Dou?e/?fl/.,2008b)。??2.2卵菌無(wú)毒基因C端特征??目前己經(jīng)鑒定出的所有卵菌無(wú)毒效應(yīng)分子,其N端都具有信號(hào)肽和RXLR-dEER??這一段保守的序列,起轉(zhuǎn)運(yùn)的作用,而C端是蛋白的功能域。通過MEME軟件對(duì)大??豆疫霉和橡樹疫霉中的RXLR類效應(yīng)分子的C端區(qū)域進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,發(fā)現(xiàn)了多個(gè)20-30??個(gè)氨基酸的保守功能域,稱為W、Y和L功能域(圖1-3)?(Jiang故a/.,2008)。??1-8?repeated?modules??SP?[^IXLR-dE,??SP民?XLR-dEER]??圖1-3?RXLR類效應(yīng)分子的C端保守結(jié)構(gòu)特征(Jiang?e/d.,?2008)??Fig.?1-3?Conserved?C-terminal?motifs?of?RXLR?effectors?(Jiang?etal.9?2008)??Motifs?in?Avh?proteins;?36%?of?the?Avh?proteins?have?a?combination?of?W,?Y,?and?L?motifs,?22%?have??only?W?motifs,?and?the?remaining?42%?do?not?have?identifiable?W,?Y,?or?L?motifs.SP,?signal?peptide.??對(duì)大豆疫霉菌中的無(wú)毒基因C端區(qū)域進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)PsAvrla,PsAvrld,PsAvr3a,??PsAvr3b和PsAvr3c均預(yù)測(cè)含有W結(jié)構(gòu)域,PsAvrlb含有K
?大豆疫霉無(wú)毒基因PsAvr3c的功能與作用機(jī)制研究???喪失機(jī)制的理解,為植物抗病資源的進(jìn)一步開發(fā)和利用提供新的思路。??a?Direct?b?Guard/decoy?c?Bait??◎?T9??圖1*4無(wú)毒基因與抗病基因的互作模式(Dodds?&Rathjen,2010)??Fig.?1-4?Models?of?direct?and?indirect?recognition?(Dodds?&?Rathjen,?2010)??Plant?nucleotide-binding?(NB)-leucine-rich?repeat?(LRR)?receptors?can?recognize?pathogen?effectors?by??either?direct?or?indirect?mechanisms.?a|?In?direct?recognition,?the?effector?(green)?triggers?immune??signalling?by?physically?binding?to?the?receptor?(purple,?orange,?yellow?and?blue;?see?FIG.?lfor?a??description?of?the?receptor).?b|?In?the?guard?and?decoy?models,?the?effectoT?modifies?an?accessory?protein??(red),?which?may?be?its?virulence?target?(guard?model)?or?a?structural?mimic?of?such?a?target?
本文編號(hào):3586477
【文章來(lái)源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:222 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1-2卵菌無(wú)毒基因的基因結(jié)構(gòu)(Morgan?&Kamoun,?2007)??Fi.?1-2?The?oomcete?avirulentene?structureatternMoran?&?Kamoun2007
ER序列突變??為AAAAAA以后,PsAvrlb就會(huì)喪失進(jìn)入大豆細(xì)胞的能力,這說(shuō)明dEER序列對(duì)于??效應(yīng)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)很重要(Dou?e/?fl/.,2008b)。??2.2卵菌無(wú)毒基因C端特征??目前己經(jīng)鑒定出的所有卵菌無(wú)毒效應(yīng)分子,其N端都具有信號(hào)肽和RXLR-dEER??這一段保守的序列,起轉(zhuǎn)運(yùn)的作用,而C端是蛋白的功能域。通過MEME軟件對(duì)大??豆疫霉和橡樹疫霉中的RXLR類效應(yīng)分子的C端區(qū)域進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,發(fā)現(xiàn)了多個(gè)20-30??個(gè)氨基酸的保守功能域,稱為W、Y和L功能域(圖1-3)?(Jiang故a/.,2008)。??1-8?repeated?modules??SP?[^IXLR-dE,??SP民?XLR-dEER]??圖1-3?RXLR類效應(yīng)分子的C端保守結(jié)構(gòu)特征(Jiang?e/d.,?2008)??Fig.?1-3?Conserved?C-terminal?motifs?of?RXLR?effectors?(Jiang?etal.9?2008)??Motifs?in?Avh?proteins;?36%?of?the?Avh?proteins?have?a?combination?of?W,?Y,?and?L?motifs,?22%?have??only?W?motifs,?and?the?remaining?42%?do?not?have?identifiable?W,?Y,?or?L?motifs.SP,?signal?peptide.??對(duì)大豆疫霉菌中的無(wú)毒基因C端區(qū)域進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)PsAvrla,PsAvrld,PsAvr3a,??PsAvr3b和PsAvr3c均預(yù)測(cè)含有W結(jié)構(gòu)域,PsAvrlb含有K
?大豆疫霉無(wú)毒基因PsAvr3c的功能與作用機(jī)制研究???喪失機(jī)制的理解,為植物抗病資源的進(jìn)一步開發(fā)和利用提供新的思路。??a?Direct?b?Guard/decoy?c?Bait??◎?T9??圖1*4無(wú)毒基因與抗病基因的互作模式(Dodds?&Rathjen,2010)??Fig.?1-4?Models?of?direct?and?indirect?recognition?(Dodds?&?Rathjen,?2010)??Plant?nucleotide-binding?(NB)-leucine-rich?repeat?(LRR)?receptors?can?recognize?pathogen?effectors?by??either?direct?or?indirect?mechanisms.?a|?In?direct?recognition,?the?effector?(green)?triggers?immune??signalling?by?physically?binding?to?the?receptor?(purple,?orange,?yellow?and?blue;?see?FIG.?lfor?a??description?of?the?receptor).?b|?In?the?guard?and?decoy?models,?the?effectoT?modifies?an?accessory?protein??(red),?which?may?be?its?virulence?target?(guard?model)?or?a?structural?mimic?of?such?a?target?
本文編號(hào):3586477
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