半滑舌鰨抗哈維氏弧菌病相關(guān)QTL定位及免疫相關(guān)基因篩選和功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-30 05:14
鲆鰈魚(yú)類(lèi)在形態(tài)學(xué)分類(lèi)上隸屬鰈形目。其中,半滑舌鰨是我國(guó)特有的,溫水性近海營(yíng)底棲生活的海水魚(yú)類(lèi),主要分布于我國(guó)渤海、黃海等沿海地區(qū),在我國(guó)具有極高經(jīng)濟(jì)價(jià)值和較高的科學(xué)研究?jī)r(jià)值。為了更好的適應(yīng)底棲生活方式,半滑舌鰨進(jìn)化發(fā)展成為一種具有內(nèi)臟小,運(yùn)動(dòng)少,生長(zhǎng)快,占用較少的水體生活空間等生物學(xué)特性的鲆鰈魚(yú)類(lèi),加之其肉味鮮美,口感爽滑,蛋白質(zhì)含量高,營(yíng)養(yǎng)豐富,市場(chǎng)價(jià)格高,經(jīng)濟(jì)效益好等特點(diǎn),深受廣大海水養(yǎng)殖者的喜愛(ài),成為我國(guó)海水養(yǎng)殖的重要經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi)。哈維氏弧菌是半滑舌鰨養(yǎng)殖過(guò)程中細(xì)菌病的主要病原之一,嚴(yán)重影響了半滑舌鰨的經(jīng)濟(jì)價(jià)值并阻礙了半滑舌鰨養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展。本論文主要通過(guò)對(duì)半滑舌鰨抗哈維氏弧菌病相關(guān)基因座進(jìn)行定位,對(duì)免疫相關(guān)基因進(jìn)行初步篩選及對(duì)免疫相關(guān)基因進(jìn)行初步功能研究,以期為解析半滑舌鰨抗病機(jī)制提供研究基礎(chǔ)。1.半滑舌鰨抗哈維氏弧菌病QTL定位及抗病免疫相關(guān)基因篩選為了方便篩選到與抗病免疫相關(guān)的候選基因,在實(shí)驗(yàn)室之前的研究基礎(chǔ)上,對(duì)17號(hào)染色體(LG18連鎖群)已經(jīng)定位到的抗哈維氏弧菌病相關(guān)區(qū)間qE進(jìn)行加密,在半滑舌鰨加密后的整合(LG18)、雌性(LG18F)、雄性(LG18M)連鎖群上定位到1...
【文章來(lái)源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:186 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1-1技術(shù)路線(xiàn)??Fig.?1-1?Technology?roadmap??
?第二章半滑舌鰨抗哈維氏弧菌。眩裕潭ㄎ患翱共∶庖呦嚓P(guān)基因篩選???100個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR)位點(diǎn)并設(shè)計(jì)了引物進(jìn)行基因分型,其中有33個(gè)標(biāo)記統(tǒng)??計(jì)得到基因分型結(jié)果,分別得到整合圖譜(LG18)、雌性圖譜(LG18F)和雄性??圖譜(LG18M),如圖2-1和表2-2所示。??LG18?LG18F?LG18、I??_?〇.〇—Pl—chrl?7-16-17??O.O-H—chr17-12-119?〇.〇—F|—chrl?7-12-119??24.3?a?/-chrl?7-9-51??34.9?A?A-chrl?7-24-7?■??36.3?7r?chrl?7-21-67?F_F,??qK-.516-4^?1^7-18-75?K_,?I?■?,??q?44.9-\1?f/Chrl7-13-102?M?32.8?/?chrl7-18-75?■??45.2?Ap?r?chrl7-20-2?..?...?461?-Al?/r?chrl?7-20-2?33.8?chrl7-13-102??50.2?chrl?7-17-16?卟卜-5?54?5?飛\?廠?/f?chrl?7-13*31?351?^?chrl?7-17-46??52.0?A1?chrl7-13-31?61?9?"ft?ft?chrl7-16-28?37.2—二一?chrl7-13^103??53.6?chrl7-13-103?.?.?.67?4^?/f?chrl7-9-40?38.5?chrl7-20-2??59.6\?-?/chr17-16-28?qh?69.7?Wr?/!?chr17-17-131?40.8?
圖3-2半滑舌鰨必加5的基因組結(jié)構(gòu)和可變剪切示意圖??注:(A)半滑舌鰨的基因組結(jié)構(gòu)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Performance Comparison of Two Efficient Genomic Selection Methods(gsbay & MixP ) Applied in Aquacultural Organisms[J]. SU Hailin,LI Hengde,WANG Shi,WANG Yangfan,BAO Zhenmin. Journal of Ocean University of China. 2017(01)
[2]半滑舌鰨抗哈維氏弧菌病相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及QTL定位[J]. 戴歡,劉洋,王文文,位戰(zhàn)飛,高進(jìn),高峰濤,李祥孔,劉洋,陳松林. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2017(01)
[3]中國(guó)大陸尼羅羅非魚(yú)引進(jìn)群體間遺傳關(guān)系分析[J]. 唐首杰,楊潔,王成輝,李思發(fā),趙金良. 水生生物學(xué)報(bào). 2017(01)
[4]半滑舌鰨CD40基因克隆及其免疫功能分析[J]. 位戰(zhàn)飛,郭華,李海龍,鄭衛(wèi)衛(wèi),王文文,戴歡,朱穎,劉洋,董忠典,陳松林. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2016(05)
[5]野生亞?wèn)|鮭群體遺傳多樣性及其種質(zhì)來(lái)源研究[J]. 戶(hù)國(guó),王芳,周建設(shè),潘瑛子,李寶海,谷偉,孫鵬,白慶利,王炳謙. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(01)
[6]半滑舌鰨體表潰瘍病病原的分離鑒定[J]. 徐曉麗,邵蓬,李賀密,姚學(xué)良,鄭艷坤,包海巖. 中國(guó)海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(11)
[7]半滑舌鰨腐皮病病原分離鑒定及對(duì)中草藥的敏感性實(shí)驗(yàn)(英文)[J]. 高桂生,張艷英,史秋梅,高光平,韓紅升,黃曉媛,繳寶豐,常瑤瑤. Agricultural Science & Technology. 2015(10)
[8]牙鲆抗遲緩愛(ài)德華菌病家系建立與抗病性能評(píng)價(jià)[J]. 張英平,陳松林,孫何軍,王磊,范彩霞,于洋,張文婷,楊英明,張永珍,田永勝,鄧寒,陳紅林,劉肖峰,吳婭紅. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2014(11)
[9]半滑舌鰨性別特異微衛(wèi)星標(biāo)記的SCAR轉(zhuǎn)化及其應(yīng)用[J]. 劉洋,陳松林,高峰濤,孟亮,胡喬木,宋文濤,邵長(zhǎng)偉,呂為群. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2014(06)
[10]我國(guó)高附加值海水養(yǎng)殖業(yè)經(jīng)濟(jì)分析——以半滑舌鰨為例[J]. 郭鴻鵠,楊正勇. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(10)
博士論文
[1]半滑舌鰨和牙鲆變態(tài)相關(guān)基因座定位及抗病性狀的基因組選擇[D]. 劉洋.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]半滑舌鰨經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳評(píng)估及基因組選擇初步研究[D]. 劉峰.上海海洋大學(xué) 2015
碩士論文
[1]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)R-spondin2基因的分子克隆、表達(dá)模式及其在肌肉發(fā)育過(guò)程中功能的初步探究[D]. 楊芳.中國(guó)海洋大學(xué) 2015
[2]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)R-spondin1和R-spondin3基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 劉田田.中國(guó)海洋大學(xué) 2015
本文編號(hào):3557547
【文章來(lái)源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:186 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1-1技術(shù)路線(xiàn)??Fig.?1-1?Technology?roadmap??
?第二章半滑舌鰨抗哈維氏弧菌。眩裕潭ㄎ患翱共∶庖呦嚓P(guān)基因篩選???100個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR)位點(diǎn)并設(shè)計(jì)了引物進(jìn)行基因分型,其中有33個(gè)標(biāo)記統(tǒng)??計(jì)得到基因分型結(jié)果,分別得到整合圖譜(LG18)、雌性圖譜(LG18F)和雄性??圖譜(LG18M),如圖2-1和表2-2所示。??LG18?LG18F?LG18、I??_?〇.〇—Pl—chrl?7-16-17??O.O-H—chr17-12-119?〇.〇—F|—chrl?7-12-119??24.3?a?/-chrl?7-9-51??34.9?A?A-chrl?7-24-7?■??36.3?7r?chrl?7-21-67?F_F,??qK-.516-4^?1^7-18-75?K_,?I?■?,??q?44.9-\1?f/Chrl7-13-102?M?32.8?/?chrl7-18-75?■??45.2?Ap?r?chrl7-20-2?..?...?461?-Al?/r?chrl?7-20-2?33.8?chrl7-13-102??50.2?chrl?7-17-16?卟卜-5?54?5?飛\?廠?/f?chrl?7-13*31?351?^?chrl?7-17-46??52.0?A1?chrl7-13-31?61?9?"ft?ft?chrl7-16-28?37.2—二一?chrl7-13^103??53.6?chrl7-13-103?.?.?.67?4^?/f?chrl7-9-40?38.5?chrl7-20-2??59.6\?-?/chr17-16-28?qh?69.7?Wr?/!?chr17-17-131?40.8?
圖3-2半滑舌鰨必加5的基因組結(jié)構(gòu)和可變剪切示意圖??注:(A)半滑舌鰨的基因組結(jié)構(gòu)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Performance Comparison of Two Efficient Genomic Selection Methods(gsbay & MixP ) Applied in Aquacultural Organisms[J]. SU Hailin,LI Hengde,WANG Shi,WANG Yangfan,BAO Zhenmin. Journal of Ocean University of China. 2017(01)
[2]半滑舌鰨抗哈維氏弧菌病相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及QTL定位[J]. 戴歡,劉洋,王文文,位戰(zhàn)飛,高進(jìn),高峰濤,李祥孔,劉洋,陳松林. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2017(01)
[3]中國(guó)大陸尼羅羅非魚(yú)引進(jìn)群體間遺傳關(guān)系分析[J]. 唐首杰,楊潔,王成輝,李思發(fā),趙金良. 水生生物學(xué)報(bào). 2017(01)
[4]半滑舌鰨CD40基因克隆及其免疫功能分析[J]. 位戰(zhàn)飛,郭華,李海龍,鄭衛(wèi)衛(wèi),王文文,戴歡,朱穎,劉洋,董忠典,陳松林. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2016(05)
[5]野生亞?wèn)|鮭群體遺傳多樣性及其種質(zhì)來(lái)源研究[J]. 戶(hù)國(guó),王芳,周建設(shè),潘瑛子,李寶海,谷偉,孫鵬,白慶利,王炳謙. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(01)
[6]半滑舌鰨體表潰瘍病病原的分離鑒定[J]. 徐曉麗,邵蓬,李賀密,姚學(xué)良,鄭艷坤,包海巖. 中國(guó)海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(11)
[7]半滑舌鰨腐皮病病原分離鑒定及對(duì)中草藥的敏感性實(shí)驗(yàn)(英文)[J]. 高桂生,張艷英,史秋梅,高光平,韓紅升,黃曉媛,繳寶豐,常瑤瑤. Agricultural Science & Technology. 2015(10)
[8]牙鲆抗遲緩愛(ài)德華菌病家系建立與抗病性能評(píng)價(jià)[J]. 張英平,陳松林,孫何軍,王磊,范彩霞,于洋,張文婷,楊英明,張永珍,田永勝,鄧寒,陳紅林,劉肖峰,吳婭紅. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2014(11)
[9]半滑舌鰨性別特異微衛(wèi)星標(biāo)記的SCAR轉(zhuǎn)化及其應(yīng)用[J]. 劉洋,陳松林,高峰濤,孟亮,胡喬木,宋文濤,邵長(zhǎng)偉,呂為群. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2014(06)
[10]我國(guó)高附加值海水養(yǎng)殖業(yè)經(jīng)濟(jì)分析——以半滑舌鰨為例[J]. 郭鴻鵠,楊正勇. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(10)
博士論文
[1]半滑舌鰨和牙鲆變態(tài)相關(guān)基因座定位及抗病性狀的基因組選擇[D]. 劉洋.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]半滑舌鰨經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳評(píng)估及基因組選擇初步研究[D]. 劉峰.上海海洋大學(xué) 2015
碩士論文
[1]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)R-spondin2基因的分子克隆、表達(dá)模式及其在肌肉發(fā)育過(guò)程中功能的初步探究[D]. 楊芳.中國(guó)海洋大學(xué) 2015
[2]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)R-spondin1和R-spondin3基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 劉田田.中國(guó)海洋大學(xué) 2015
本文編號(hào):3557547
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