鳙群體遺傳與生長(zhǎng)性狀評(píng)估及早期發(fā)育轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時(shí)間：2021-11-08 18:06
鳙（Hypophthamichthys nobilis）是我國(guó)江、河、湖、庫(kù)等大水面水體中特有的半洄游性魚類,為典型的濾食性魚類,是我國(guó)傳統(tǒng)淡水養(yǎng)殖對(duì)象,具有悠久的養(yǎng)殖歷史。本研究收集了9個(gè)鳙群體,分別來(lái)自包括4個(gè)國(guó)家級(jí)原種場(chǎng)鳙群體（湖北石首、湖南長(zhǎng)沙、江西瑞昌和江蘇邗江）、2個(gè)省級(jí)良種場(chǎng)親本群體（江蘇漕湖和廣西玉林）和3個(gè)長(zhǎng)江江段捕撈群體（鎮(zhèn)江、張家港和常熟）,利用分子標(biāo)記技術(shù),結(jié)合群體遺傳學(xué)、分子遺傳學(xué)、數(shù)量遺傳學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué),從遺傳變異分析、遺傳參數(shù)估計(jì)、選育效果評(píng)估和早期生長(zhǎng)發(fā)育轉(zhuǎn)錄組分析等方面開(kāi)展研究,根據(jù)研究結(jié)果,構(gòu)建選育基礎(chǔ)群體,并開(kāi)展不同雜交組合子代的遺傳評(píng)估,獲得優(yōu)質(zhì)雜交組合,同時(shí)結(jié)合轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果,制定鳙遺傳改良技術(shù)方案。具體結(jié)果如下:1.鳙群體的遺傳變異分析利用mt DNA D-Loop區(qū)序列,對(duì)鳙群體開(kāi)展遺傳變異分析。在共計(jì)401條D-loop序列（939bp）中共檢測(cè)到37個(gè)變異位點(diǎn)（不含插入/缺失變異）,42個(gè)單倍型,單倍型多樣性（Hd）介于0.665—0.905。群體間Kimura雙參數(shù)遺傳距離介于0.0034—0.0068,結(jié)合遺傳聚類分析,發(fā)現(xiàn)長(zhǎng)江下游捕...
【文章來(lái)源】：上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】：117 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【部分圖文】：
鳙9個(gè)群體的采樣地點(diǎn)Fig.2-1Samplingsitesof9bigheadcarppopulations
鳙群體遺傳與生長(zhǎng)性狀評(píng)估及早期發(fā)育轉(zhuǎn)錄組分析23表2-5.鳙群體間的K2P遺傳距離（對(duì)角線下）和遺傳分化指數(shù)（FST,對(duì)角線上）Tab.2-5K2Pgeneticdistances(belowdiagonal)andfixtionindexes(FST,abovediagonal)among10bigheadcarppopulationsSSCSRCHJCHZHJZJGCSUYLUSASS-0.0329*0.1022**0.0282*0.02360.0814*0.0802*0.0318*0.03100.1074*CS0.0064-0.1009**0.02040.0466*0.0774*0.0656**0.0119-0.01510.0451RC0.00570.0051-0.0561**0.0882**0.0398**0.0224*0.0724**0.1071**0.2267**HJ0.00610.00550.0046-0.01430.0499*0.0311*0.0312*0.02050.1339**CH0.00610.00570.00470.0053-0.02180.03060.0415*0.0416**0.1863**ZHJ0.00560.00500.00340.00450.0046--0.00450.0422*0.0868**0.2634**ZJG0.00590.00520.00370.00480.00490.0037-0.0369**0.0744**0.2244**CSU0.00630.00560.00480.00550.00560.00470.0049-0.01840.1285**YL0.00630.00540.00500.00540.00560.00500.00510.0055-0.0688*USA0.00680.00580.00590.00620.00640.00600.00610.00630.0058-注：群體標(biāo)示如前表；*表示統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著水平（P<0.05）；**表示統(tǒng)計(jì)學(xué)極顯著水平（P<0.01）。基于群體間的遺傳距離構(gòu)建NJ樹，長(zhǎng)江下游捕撈群體與中下游原種場(chǎng)群體的遺傳距離較近，而石首和美國(guó)群體均與其它群體的遺傳距離較遠(yuǎn)；其中，珠江流域玉林群體與長(zhǎng)江流域長(zhǎng)沙群體遺傳距離相對(duì)較近，如圖2-2。圖2-2.鳙10個(gè)群體基于D-loop序列變異的K2P遺傳距離的NJ聚類樹Fig.2-2NJtreebasedonmtDNAD-Loopregionsequencesof10bigheadcarppopulations
鳙群體遺傳與生長(zhǎng)性狀評(píng)估及早期發(fā)育轉(zhuǎn)錄組分析25圖2-3.鳙基于D-loop序列變異的群體間遺傳分化指數(shù)Fig.2-3Interpopulationgeneticdifferentiationindexofd-loopsequencevariationinbigheadcarp2.1.2.4單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)根據(jù)單倍型分布網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖（圖2-4），根據(jù)單倍型的進(jìn)化和分布情況，發(fā)現(xiàn)2個(gè)分支共有6個(gè)優(yōu)勢(shì)單倍型（hap1，hap2，hap5，hap14，hap15，hap20），而這6個(gè)優(yōu)勢(shì)單倍型在5個(gè)群體中（長(zhǎng)沙、漕湖、鎮(zhèn)江、張家港、常熟）均有分布。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于SSR標(biāo)記的長(zhǎng)江下游原良種場(chǎng)鳙親本和后備親本種質(zhì)資源現(xiàn)狀分析[J]. 馮曉婷,張桂寧,薛向平,王邢燕,周彥鋒,方弟安,徐東坡. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2020(05)
[2]上海市江心水庫(kù)鰱、鳙年齡結(jié)構(gòu)及生長(zhǎng)特性[J]. 魏憲蕓,顧靜,張名全,秦智杰,迪麗娜爾·艾尼瓦爾,龔小玲. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(01)
[3]虹鱒生長(zhǎng)性狀的隨機(jī)回歸分析[J]. 王悅玲,谷偉,王炳謙,蔣麗,楊潤(rùn)清. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2018(06)
[4]山東半島南部三疣梭子蟹增殖放流群體貢獻(xiàn)率[J]. 趙國(guó)慶,邱盛堯,張玉欽,李楚禹,李登來(lái). 水產(chǎn)科學(xué). 2018(05)
[5]6個(gè)野生與選育鯉群體的微衛(wèi)星遺傳分析[J]. 董在杰,劉念,傅建軍,朱文彬,王蘭梅,蘇勝?gòu)? 南方水產(chǎn)科學(xué). 2018(04)
[6]鳙基于10個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的親子鑒定分析[J]. 張丹,傅建軍,張利德,方敏,朱文彬,王蘭梅,蘇勝?gòu)?董在杰. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019(07)
[7]草魚生長(zhǎng)性狀的遺傳參數(shù)和育種值估計(jì)[J]. 姜鵬,韓林強(qiáng),白俊杰,樊佳佳,陳柏湘,胡重江,周春龍,李勝杰. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2018(01)
[8]不同養(yǎng)殖模式建鯉家系選育F3代生長(zhǎng)性能比較分析[J]. 廖愚,王培培,袁宗偉,楊賓蘭,鄭海濤,盧飛麟,呂業(yè)堅(jiān),覃俊奇. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(12)
[9]長(zhǎng)江靖江段沿岸似鳊生長(zhǎng)及種群參數(shù)估算[J]. 郭弘藝,魏凱,唐文喬,張旭光,周天舒,劉東,李輝華,沈林宏. 長(zhǎng)江流域資源與環(huán)境. 2017(09)
[10]三峽水庫(kù)正常運(yùn)行期間四大家魚的時(shí)空分布特征[J]. 楊志,龔云,董純,喬曄,陳小娟,唐會(huì)元. 水生態(tài)學(xué)雜志. 2017(05)
博士論文
[1]通關(guān)藤遺傳多樣性及轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 鄭開(kāi)顏.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]鰱、鳙魚遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和鳙魚蛋白感染因子基因的克隆[D]. 廖梅杰.中國(guó)海洋大學(xué) 2007
碩士論文
[1]洞頭海域大黃魚增殖放流及其效果初步評(píng)價(jià)[D]. 馬曉林.浙江海洋大學(xué) 2016
[2]基于分子標(biāo)記的三疣梭子蟹和中國(guó)對(duì)蝦增殖放流效果研究[D]. 蔡珊珊.中國(guó)海洋大學(xué) 2015
[3]草魚微衛(wèi)星標(biāo)記開(kāi)發(fā)及9個(gè)養(yǎng)殖群體遺傳多樣性分析[D]. 李達(dá).上海海洋大學(xué) 2014
[4]鄱陽(yáng)湖水系青魚、草魚、鰱、鳙形態(tài)度量學(xué)分析[D]. 張希.南昌大學(xué) 2011
本文編號(hào)：3483969
【文章來(lái)源】：上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】：117 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【部分圖文】：
鳙9個(gè)群體的采樣地點(diǎn)Fig.2-1Samplingsitesof9bigheadcarppopulations
鳙群體遺傳與生長(zhǎng)性狀評(píng)估及早期發(fā)育轉(zhuǎn)錄組分析23表2-5.鳙群體間的K2P遺傳距離（對(duì)角線下）和遺傳分化指數(shù)（FST,對(duì)角線上）Tab.2-5K2Pgeneticdistances(belowdiagonal)andfixtionindexes(FST,abovediagonal)among10bigheadcarppopulationsSSCSRCHJCHZHJZJGCSUYLUSASS-0.0329*0.1022**0.0282*0.02360.0814*0.0802*0.0318*0.03100.1074*CS0.0064-0.1009**0.02040.0466*0.0774*0.0656**0.0119-0.01510.0451RC0.00570.0051-0.0561**0.0882**0.0398**0.0224*0.0724**0.1071**0.2267**HJ0.00610.00550.0046-0.01430.0499*0.0311*0.0312*0.02050.1339**CH0.00610.00570.00470.0053-0.02180.03060.0415*0.0416**0.1863**ZHJ0.00560.00500.00340.00450.0046--0.00450.0422*0.0868**0.2634**ZJG0.00590.00520.00370.00480.00490.0037-0.0369**0.0744**0.2244**CSU0.00630.00560.00480.00550.00560.00470.0049-0.01840.1285**YL0.00630.00540.00500.00540.00560.00500.00510.0055-0.0688*USA0.00680.00580.00590.00620.00640.00600.00610.00630.0058-注：群體標(biāo)示如前表；*表示統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著水平（P<0.05）；**表示統(tǒng)計(jì)學(xué)極顯著水平（P<0.01）。基于群體間的遺傳距離構(gòu)建NJ樹，長(zhǎng)江下游捕撈群體與中下游原種場(chǎng)群體的遺傳距離較近，而石首和美國(guó)群體均與其它群體的遺傳距離較遠(yuǎn)；其中，珠江流域玉林群體與長(zhǎng)江流域長(zhǎng)沙群體遺傳距離相對(duì)較近，如圖2-2。圖2-2.鳙10個(gè)群體基于D-loop序列變異的K2P遺傳距離的NJ聚類樹Fig.2-2NJtreebasedonmtDNAD-Loopregionsequencesof10bigheadcarppopulations
鳙群體遺傳與生長(zhǎng)性狀評(píng)估及早期發(fā)育轉(zhuǎn)錄組分析25圖2-3.鳙基于D-loop序列變異的群體間遺傳分化指數(shù)Fig.2-3Interpopulationgeneticdifferentiationindexofd-loopsequencevariationinbigheadcarp2.1.2.4單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)根據(jù)單倍型分布網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖（圖2-4），根據(jù)單倍型的進(jìn)化和分布情況，發(fā)現(xiàn)2個(gè)分支共有6個(gè)優(yōu)勢(shì)單倍型（hap1，hap2，hap5，hap14，hap15，hap20），而這6個(gè)優(yōu)勢(shì)單倍型在5個(gè)群體中（長(zhǎng)沙、漕湖、鎮(zhèn)江、張家港、常熟）均有分布。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于SSR標(biāo)記的長(zhǎng)江下游原良種場(chǎng)鳙親本和后備親本種質(zhì)資源現(xiàn)狀分析[J]. 馮曉婷,張桂寧,薛向平,王邢燕,周彥鋒,方弟安,徐東坡. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2020(05)
[2]上海市江心水庫(kù)鰱、鳙年齡結(jié)構(gòu)及生長(zhǎng)特性[J]. 魏憲蕓,顧靜,張名全,秦智杰,迪麗娜爾·艾尼瓦爾,龔小玲. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(01)
[3]虹鱒生長(zhǎng)性狀的隨機(jī)回歸分析[J]. 王悅玲,谷偉,王炳謙,蔣麗,楊潤(rùn)清. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2018(06)
[4]山東半島南部三疣梭子蟹增殖放流群體貢獻(xiàn)率[J]. 趙國(guó)慶,邱盛堯,張玉欽,李楚禹,李登來(lái). 水產(chǎn)科學(xué). 2018(05)
[5]6個(gè)野生與選育鯉群體的微衛(wèi)星遺傳分析[J]. 董在杰,劉念,傅建軍,朱文彬,王蘭梅,蘇勝?gòu)? 南方水產(chǎn)科學(xué). 2018(04)
[6]鳙基于10個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的親子鑒定分析[J]. 張丹,傅建軍,張利德,方敏,朱文彬,王蘭梅,蘇勝?gòu)?董在杰. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019(07)
[7]草魚生長(zhǎng)性狀的遺傳參數(shù)和育種值估計(jì)[J]. 姜鵬,韓林強(qiáng),白俊杰,樊佳佳,陳柏湘,胡重江,周春龍,李勝杰. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2018(01)
[8]不同養(yǎng)殖模式建鯉家系選育F3代生長(zhǎng)性能比較分析[J]. 廖愚,王培培,袁宗偉,楊賓蘭,鄭海濤,盧飛麟,呂業(yè)堅(jiān),覃俊奇. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(12)
[9]長(zhǎng)江靖江段沿岸似鳊生長(zhǎng)及種群參數(shù)估算[J]. 郭弘藝,魏凱,唐文喬,張旭光,周天舒,劉東,李輝華,沈林宏. 長(zhǎng)江流域資源與環(huán)境. 2017(09)
[10]三峽水庫(kù)正常運(yùn)行期間四大家魚的時(shí)空分布特征[J]. 楊志,龔云,董純,喬曄,陳小娟,唐會(huì)元. 水生態(tài)學(xué)雜志. 2017(05)
博士論文
[1]通關(guān)藤遺傳多樣性及轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 鄭開(kāi)顏.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]鰱、鳙魚遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和鳙魚蛋白感染因子基因的克隆[D]. 廖梅杰.中國(guó)海洋大學(xué) 2007
碩士論文
[1]洞頭海域大黃魚增殖放流及其效果初步評(píng)價(jià)[D]. 馬曉林.浙江海洋大學(xué) 2016
[2]基于分子標(biāo)記的三疣梭子蟹和中國(guó)對(duì)蝦增殖放流效果研究[D]. 蔡珊珊.中國(guó)海洋大學(xué) 2015
[3]草魚微衛(wèi)星標(biāo)記開(kāi)發(fā)及9個(gè)養(yǎng)殖群體遺傳多樣性分析[D]. 李達(dá).上海海洋大學(xué) 2014
[4]鄱陽(yáng)湖水系青魚、草魚、鰱、鳙形態(tài)度量學(xué)分析[D]. 張希.南昌大學(xué) 2011
本文編號(hào)：3483969
本文鏈接：http://sikaile.net/shoufeilunwen/nykjbs/3483969.html
最近更新
教材專著
