鳙（Hypophthamichthys nobilis）是我國江、河、湖、庫等大水面水體中特有的半洄游性魚類,為典型的濾食性魚類,是我國傳統(tǒng)淡水養(yǎng)殖對象,具有悠久的養(yǎng)殖歷史。本研究收集了9個鳙群體,分別來自包括4個國家級原種場鳙群體（湖北石首、湖南長沙、江西瑞昌和江蘇邗江）、2個省級良種場親本群體（江蘇漕湖和廣西玉林）和3個長江江段捕撈群體（鎮(zhèn)江、張家港和常熟）,利用分子標記技術,結(jié)合群體遺傳學、分子遺傳學、數(shù)量遺傳學和轉(zhuǎn)錄組學,從遺傳變異分析、遺傳參數(shù)估計、選育效果評估和早期生長發(fā)育轉(zhuǎn)錄組分析等方面開展研究,根據(jù)研究結(jié)果,構(gòu)建選育基礎群體,并開展不同雜交組合子代的遺傳評估,獲得優(yōu)質(zhì)雜交組合,同時結(jié)合轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果,制定鳙遺傳改良技術方案。具體結(jié)果如下:1.鳙群體的遺傳變異分析利用mt DNA D-Loop區(qū)序列,對鳙群體開展遺傳變異分析。在共計401條D-loop序列（939bp）中共檢測到37個變異位點（不含插入/缺失變異）,42個單倍型,單倍型多樣性（Hd）介于0.665—0.905。群體間Kimura雙參數(shù)遺傳距離介于0.0034—0.0068,結(jié)合遺傳聚類分析,發(fā)現(xiàn)長江下游捕... 

【文章來源】：上海海洋大學上海市

【文章頁數(shù)】：117 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

鳙9個群體的采樣地點Fig.2-1Samplingsitesof9bigheadcarppopulations

鳙群體遺傳與生長性狀評估及早期發(fā)育轉(zhuǎn)錄組分析23表2-5.鳙群體間的K2P遺傳距離（對角線下）和遺傳分化指數(shù)（FST,對角線上）Tab.2-5K2Pgeneticdistances(belowdiagonal)andfixtionindexes(FST,abovediagonal)among10bigheadcarppopulationsSSCSRCHJCHZHJZJGCSUYLUSASS-0.0329*0.1022**0.0282*0.02360.0814*0.0802*0.0318*0.03100.1074*CS0.0064-0.1009**0.02040.0466*0.0774*0.0656**0.0119-0.01510.0451RC0.00570.0051-0.0561**0.0882**0.0398**0.0224*0.0724**0.1071**0.2267**HJ0.00610.00550.0046-0.01430.0499*0.0311*0.0312*0.02050.1339**CH0.00610.00570.00470.0053-0.02180.03060.0415*0.0416**0.1863**ZHJ0.00560.00500.00340.00450.0046--0.00450.0422*0.0868**0.2634**ZJG0.00590.00520.00370.00480.00490.0037-0.0369**0.0744**0.2244**CSU0.00630.00560.00480.00550.00560.00470.0049-0.01840.1285**YL0.00630.00540.00500.00540.00560.00500.00510.0055-0.0688*USA0.00680.00580.00590.00620.00640.00600.00610.00630.0058-注：群體標示如前表；*表示統(tǒng)計學顯著水平（P<0.05）；**表示統(tǒng)計學極顯著水平（P<0.01）�；谌后w間的遺傳距離構(gòu)建NJ樹，長江下游捕撈群體與中下游原種場群體的遺傳距離較近，而石首和美國群體均與其它群體的遺傳距離較遠；其中，珠江流域玉林群體與長江流域長沙群體遺傳距離相對較近，如圖2-2。圖2-2.鳙10個群體基于D-loop序列變異的K2P遺傳距離的NJ聚類樹Fig.2-2NJtreebasedonmtDNAD-Loopregionsequencesof10bigheadcarppopulations

鳙群體遺傳與生長性狀評估及早期發(fā)育轉(zhuǎn)錄組分析25圖2-3.鳙基于D-loop序列變異的群體間遺傳分化指數(shù)Fig.2-3Interpopulationgeneticdifferentiationindexofd-loopsequencevariationinbigheadcarp2.1.2.4單倍型網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)根據(jù)單倍型分布網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)圖（圖2-4），根據(jù)單倍型的進化和分布情況，發(fā)現(xiàn)2個分支共有6個優(yōu)勢單倍型（hap1，hap2，hap5，hap14，hap15，hap20），而這6個優(yōu)勢單倍型在5個群體中（長沙、漕湖、鎮(zhèn)江、張家港、常熟）均有分布。

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：3483969