白菜類作物逆境相關(guān)基因的進(jìn)化模式及低溫春化下的LncRNA分析
發(fā)布時間:2021-10-26 06:31
植物生長發(fā)育過程中會經(jīng)歷各種脅迫,這嚴(yán)重的影響了植物的正常生長。研究植物逆境相關(guān)基因及逆境信號傳導(dǎo)的分子機制,具有重要的理論意義和實際應(yīng)用價值。白菜類作物主要包括,大白菜(Brassica rapa ssp.pekinensis)、不結(jié)球白菜(Brassica rapa ssp.chinensis)和蕪菁(Brassica rapa ssp.rapa),屬于十字花科(Cruciferae)蕓薹屬(Brassica)植物。大白菜是中國廣泛種植的蔬菜之一,在長期的人工馴化選擇過程中形成了豐富的種質(zhì)資源。目前,主要是利用各種組學(xué)技術(shù),例如基因組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)等手段,系統(tǒng)研究各種植物外源脅迫信號對植物生長發(fā)育的影響和調(diào)控。從分子、進(jìn)化水平和基因功能層面揭示其內(nèi)在規(guī)律,解析其代謝調(diào)控和信號傳導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)。模式植物擬南芥中逆境相關(guān)基因已經(jīng)研究的比較透徹,關(guān)于白菜類作物的研究相對較少。因此對白菜類作物逆境相關(guān)基因的系統(tǒng)研究,為栽培和育種提供重要的理論依據(jù)。本研究在大白菜基因組中鑒定了抗逆相關(guān)基因(MAPK級聯(lián)基因、CDPK-SnRK、TIFY、BES1)及低溫春化相關(guān)的LncRNA,利用比較基因組...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:151 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1-2比較基因組分析蕓苔屬植物結(jié)構(gòu)(Cheng?etal.,?2012)??(a)根據(jù)全基因組序列分析大白菜和甘藍(lán)染色體共線性
?白菜類作物逆境相關(guān)基因的進(jìn)化模式及低溫春化下LncRNA的分析???-?I?i?^?e???.<?、?■?I?MAPKK?z嚴(yán)?I?m??h?i?ri?l?7?/?:?k,?E??i■?_|-?\.^?(?/?luilb??b麵??圖2-1?MAPK級聯(lián)基因在大白菜和擬南芥之間的共線性和不同保留程度的分析??(a<)?MAPK、MAPKK、MAPKKK在大白菜和擬南芥之間的共線性基因用線表示在丨0條大白??菜染色體(BrOl-BrlO)和5條擬南芥染色體上(AtOl-At05)。紅色的線代表擬南芥和大白菜之??間的共線性基因?qū),藍(lán)色的線代表大白菜的共線性基因?qū)Α#ǎ洌?MAPK級聯(lián)基因在LF、MF〗和??MF2三個亞基因上的保留(e)?MAPK級聯(lián)基因在大白菜三倍化和分餾后的數(shù)目。??Figure?2-1?The?syntenic?MAPK?cascade?genes?between?Brassica?rapa?and?Arabidopsis?thaliana?and??their?different?retentions.??(a-c)MAPK.?MAPKK,?MAPKKK?syntenic?genes?lines?are?shown?among?the?10?B.?rapa??chromosomes(BrOl-BrlO)?and?the?five?A.?Thaliana?chromosomes?(At01-At05).?The?red?lines?represent??the?syntenic?genes?pairs?between?B.?rapa?and?Arabidopsis,?and?the?b
?|J?|?._??I?\?:L?■?.?I??-3?I?wfnwmjl??A?l?Dupbcalcd?Gene?Type???曝。{Li-??丨丨丨?M?\?/\?Duphcwsd?Ty〇*???Jl?hzAj?dI??00?05?,0?5?;j?■??—??Ks?(synonymous?mutalon?numbers?pet?synonymous??<*?)?■??I?_?I??T*r?d?m,WOD?0???DuO*cal?l?G?o*?Type*??圖2-3大白菜和擬南芥MAPK級聯(lián)同源基因?qū)Φ模柚岛蛷?fù)制類型??(a)大白菜和擬南芥MAPK級聯(lián)同源基因?qū)Φ模耍渲钡姆植记闆r。(b-d)大白菜MAPK級聯(lián)基??因的復(fù)制類型。??Figure?2-3?F3airwise?comparison?of?the?Ks?values?for?MAPK?cascade?homologous?genes?in?B.?rapa?and??A.?thaliana?and?their?different?duplicated?types.??(a)The?distribution?of?Ks?values?for?MAPK?cascade?genes?between?B.?rapa?and?A.?thaliana?.??(b-d)Duplicated?types?of?MAPK?cascade?genes?in?B.?rapa.??3.4?MAPK基因在植物中的擴張和進(jìn)化??用另外的八個關(guān)鍵物種構(gòu)建MAPK基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹,來研究它在植物中??的進(jìn)化。我們選擇四個被子植物葡萄、毛果楊、番木瓜,因為這些物種沒有經(jīng)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不結(jié)球白菜種質(zhì)資源的研究與利用[J]. 侯喜林,宋小明. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(05)
[2]不結(jié)球白菜育種研究新進(jìn)展[J]. 侯喜林. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2003(04)
本文編號:3459018
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:151 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1-2比較基因組分析蕓苔屬植物結(jié)構(gòu)(Cheng?etal.,?2012)??(a)根據(jù)全基因組序列分析大白菜和甘藍(lán)染色體共線性
?白菜類作物逆境相關(guān)基因的進(jìn)化模式及低溫春化下LncRNA的分析???-?I?i?^?e???.<?、?■?I?MAPKK?z嚴(yán)?I?m??h?i?ri?l?7?/?:?k,?E??i■?_|-?\.^?(?/?luilb??b麵??圖2-1?MAPK級聯(lián)基因在大白菜和擬南芥之間的共線性和不同保留程度的分析??(a<)?MAPK、MAPKK、MAPKKK在大白菜和擬南芥之間的共線性基因用線表示在丨0條大白??菜染色體(BrOl-BrlO)和5條擬南芥染色體上(AtOl-At05)。紅色的線代表擬南芥和大白菜之??間的共線性基因?qū),藍(lán)色的線代表大白菜的共線性基因?qū)Α#ǎ洌?MAPK級聯(lián)基因在LF、MF〗和??MF2三個亞基因上的保留(e)?MAPK級聯(lián)基因在大白菜三倍化和分餾后的數(shù)目。??Figure?2-1?The?syntenic?MAPK?cascade?genes?between?Brassica?rapa?and?Arabidopsis?thaliana?and??their?different?retentions.??(a-c)MAPK.?MAPKK,?MAPKKK?syntenic?genes?lines?are?shown?among?the?10?B.?rapa??chromosomes(BrOl-BrlO)?and?the?five?A.?Thaliana?chromosomes?(At01-At05).?The?red?lines?represent??the?syntenic?genes?pairs?between?B.?rapa?and?Arabidopsis,?and?the?b
?|J?|?._??I?\?:L?■?.?I??-3?I?wfnwmjl??A?l?Dupbcalcd?Gene?Type???曝。{Li-??丨丨丨?M?\?/\?Duphcwsd?Ty〇*???Jl?hzAj?dI??00?05?,0?5?;j?■??—??Ks?(synonymous?mutalon?numbers?pet?synonymous??<*?)?■??I?_?I??T*r?d?m,WOD?0???DuO*cal?l?G?o*?Type*??圖2-3大白菜和擬南芥MAPK級聯(lián)同源基因?qū)Φ模柚岛蛷?fù)制類型??(a)大白菜和擬南芥MAPK級聯(lián)同源基因?qū)Φ模耍渲钡姆植记闆r。(b-d)大白菜MAPK級聯(lián)基??因的復(fù)制類型。??Figure?2-3?F3airwise?comparison?of?the?Ks?values?for?MAPK?cascade?homologous?genes?in?B.?rapa?and??A.?thaliana?and?their?different?duplicated?types.??(a)The?distribution?of?Ks?values?for?MAPK?cascade?genes?between?B.?rapa?and?A.?thaliana?.??(b-d)Duplicated?types?of?MAPK?cascade?genes?in?B.?rapa.??3.4?MAPK基因在植物中的擴張和進(jìn)化??用另外的八個關(guān)鍵物種構(gòu)建MAPK基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹,來研究它在植物中??的進(jìn)化。我們選擇四個被子植物葡萄、毛果楊、番木瓜,因為這些物種沒有經(jīng)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不結(jié)球白菜種質(zhì)資源的研究與利用[J]. 侯喜林,宋小明. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(05)
[2]不結(jié)球白菜育種研究新進(jìn)展[J]. 侯喜林. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2003(04)
本文編號:3459018
本文鏈接:http://sikaile.net/shoufeilunwen/nykjbs/3459018.html
最近更新
教材專著