利用轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組測序篩選綿羊多羔基因的研究
發(fā)布時間:2021-10-15 04:41
產(chǎn)羔數(shù)是一個受微效多基因控制的數(shù)量性狀,很難通過傳統(tǒng)的育種手段來快速提高。因此,尋找與綿羊產(chǎn)羔數(shù)性狀相關(guān)的基因和分子標(biāo)記一直都是育種學(xué)家關(guān)注的熱點。近年來,隨著生物技術(shù)的發(fā)展,轉(zhuǎn)錄組分析、基因組重測序、蛋白質(zhì)組學(xué)以及代謝組等各種組學(xué)技術(shù)已經(jīng)成為挖掘綿羊多羔基因的重要工具。目前,關(guān)于綿羊產(chǎn)羔數(shù)性狀的研究主要集中在垂體、卵巢和睪丸,然而有關(guān)綿羊子宮與產(chǎn)羔數(shù)相關(guān)的研究報道甚少。因此,在本研究中以FecB++基因型(無FecB突變)小尾寒羊母羊為研究對象,首先利用子宮RNA-Seq和子宮蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)篩選與綿羊多羔性狀相關(guān)的差異表達(dá)的mRNA和差異表達(dá)的蛋白質(zhì);其次利用MassARRAY技術(shù)對篩選的候選基因進行質(zhì)譜分型并與小尾寒羊產(chǎn)羔數(shù)關(guān)聯(lián)分析,以期為解析綿羊多羔性狀的分子機制提供理論基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.綿羊子宮轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究通過對卵泡期和黃體期的FecB++基因型單、多羔小尾寒羊的子宮組織進行RNA-Seq后,在卵泡期,與單羔組(MG)相比,多羔組(PG)中有166個差異表達(dá)的mRNA,其中33個上調(diào)、133個下調(diào);473個差異表達(dá)的lncRNA,其中242個上調(diào)、231個下調(diào);147...
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:123 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
LncRNA基因特征和表達(dá)分析
甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆博士學(xué)位論文26圖2-2對差異表達(dá)的mRNA和差異表達(dá)的lncRNA的靶基因進行GO富集分析Fig.2-2GOenrichmentanalysisofdifferentiallyexpressedmRNAsandtargetgenesofdifferentiallyexpressedlncRNAs(A)卵泡期的差異表達(dá)的mRNA的GO分析;(B)黃體期的差異表達(dá)的mRNA的GO分析;(C)卵泡期的差異表達(dá)的lncRNA的靶基因的GO分析;(D)黃體期的差異表達(dá)的lncRNA的靶基因的GO分析(A)ThedifferentiallyexpressedmRNAsGOenrichmentanalysisinthefollicularphase;(B)ThedifferentiallyexpressedmRNAsGOenrichmentanalysisinthelutealphase;(C)ThedifferentiallyexpressedlncRNAstargetgenesGOenrichmentanalysisinthefollicularphase;(D)ThedifferentiallyexpressedlncRNAstargetgenesGOenrichmentanalysisinthelutealphase.
利用轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組測序篩選綿羊多羔基因的研究27圖2-3差異表達(dá)mRNA和lncRNA的KEGG富集分析Fig.2-3KEGGpathwayanalysisofdifferentiallyexpressedmRNAsandlncRNAs(A)卵泡期差異表達(dá)mRNA的KEGG富集分析;(B)黃體期差異表達(dá)mRNA的KEGG富集分析;(C)卵泡期差異表達(dá)lncRNA的KEGG富集分析;(D)黃體期差異表達(dá)lncRNA的KEGG富集分析。(A)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedmRNAsarepresentedinthefollicularphase;(B)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedmRNAsarepresentedinthelutealphase;(C)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedlncRNAsarepresentedinthefollicularphase;(D)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedlncRNAsarepresentedinthelutealphase.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Analyses of circRNA profiling during the development from pre-receptive to receptive phases in the goat endometrium[J]. Yuxuan Song,Lei Zhang,Xiaorui Liu,Mengxiao Niu,Jiuzeng Cui,Sicheng Che,Yuexia Liu,Xiaopeng An,Binyun Cao. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2019(03)
[2]6群不同品種(系)綿羊BMPR-IB基因多態(tài)性及與產(chǎn)羔數(shù)的關(guān)系研究[J]. 陳勇,雒秋江,李登忠,張亞軍,楊風(fēng)云,楊菊清,朱文淵. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2008(02)
[3]5個綿羊群體的BMPR-IB基因多態(tài)性分析[J]. 王公金,竇德宇,花衛(wèi)華,聶曉偉,儲國良,徐曉波,趙偉,劉亞柏. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2007(05)
博士論文
[1]利用轉(zhuǎn)錄組測序和蛋白質(zhì)組學(xué)分析篩選綿羊多羔候選基因的研究[D]. 湯繼順.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2019
[2]FecB基因影響小尾寒羊繁殖力的分子機制研究[D]. 郭曉飛.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
碩士論文
[1]MGST1基因調(diào)控雞胚肝細(xì)胞的分子機制研究[D]. 施肇源.合肥工業(yè)大學(xué) 2019
本文編號:3437440
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:123 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
LncRNA基因特征和表達(dá)分析
甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆博士學(xué)位論文26圖2-2對差異表達(dá)的mRNA和差異表達(dá)的lncRNA的靶基因進行GO富集分析Fig.2-2GOenrichmentanalysisofdifferentiallyexpressedmRNAsandtargetgenesofdifferentiallyexpressedlncRNAs(A)卵泡期的差異表達(dá)的mRNA的GO分析;(B)黃體期的差異表達(dá)的mRNA的GO分析;(C)卵泡期的差異表達(dá)的lncRNA的靶基因的GO分析;(D)黃體期的差異表達(dá)的lncRNA的靶基因的GO分析(A)ThedifferentiallyexpressedmRNAsGOenrichmentanalysisinthefollicularphase;(B)ThedifferentiallyexpressedmRNAsGOenrichmentanalysisinthelutealphase;(C)ThedifferentiallyexpressedlncRNAstargetgenesGOenrichmentanalysisinthefollicularphase;(D)ThedifferentiallyexpressedlncRNAstargetgenesGOenrichmentanalysisinthelutealphase.
利用轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組測序篩選綿羊多羔基因的研究27圖2-3差異表達(dá)mRNA和lncRNA的KEGG富集分析Fig.2-3KEGGpathwayanalysisofdifferentiallyexpressedmRNAsandlncRNAs(A)卵泡期差異表達(dá)mRNA的KEGG富集分析;(B)黃體期差異表達(dá)mRNA的KEGG富集分析;(C)卵泡期差異表達(dá)lncRNA的KEGG富集分析;(D)黃體期差異表達(dá)lncRNA的KEGG富集分析。(A)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedmRNAsarepresentedinthefollicularphase;(B)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedmRNAsarepresentedinthelutealphase;(C)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedlncRNAsarepresentedinthefollicularphase;(D)KEGGenrichmentpathwaysfordifferentiallyexpressedlncRNAsarepresentedinthelutealphase.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Analyses of circRNA profiling during the development from pre-receptive to receptive phases in the goat endometrium[J]. Yuxuan Song,Lei Zhang,Xiaorui Liu,Mengxiao Niu,Jiuzeng Cui,Sicheng Che,Yuexia Liu,Xiaopeng An,Binyun Cao. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2019(03)
[2]6群不同品種(系)綿羊BMPR-IB基因多態(tài)性及與產(chǎn)羔數(shù)的關(guān)系研究[J]. 陳勇,雒秋江,李登忠,張亞軍,楊風(fēng)云,楊菊清,朱文淵. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2008(02)
[3]5個綿羊群體的BMPR-IB基因多態(tài)性分析[J]. 王公金,竇德宇,花衛(wèi)華,聶曉偉,儲國良,徐曉波,趙偉,劉亞柏. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2007(05)
博士論文
[1]利用轉(zhuǎn)錄組測序和蛋白質(zhì)組學(xué)分析篩選綿羊多羔候選基因的研究[D]. 湯繼順.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2019
[2]FecB基因影響小尾寒羊繁殖力的分子機制研究[D]. 郭曉飛.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
碩士論文
[1]MGST1基因調(diào)控雞胚肝細(xì)胞的分子機制研究[D]. 施肇源.合肥工業(yè)大學(xué) 2019
本文編號:3437440
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