甜瓜株型和抗白粉病性狀的遺傳與全基因組關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時間:2021-09-30 09:11
甜瓜(Cucumis melo L.)是一個世界范圍廣泛種植的園藝作物,多樣性較高,許多農(nóng)藝性狀如株型性狀、抗白粉病、耐裂果性狀對甜瓜的生產(chǎn)十分重要。深入挖掘、利用甜瓜重要性狀遺傳變異對改良甜瓜品種,促進甜瓜產(chǎn)業(yè)化發(fā)展至關(guān)重要。本研究以甜瓜為實驗材料,開展甜瓜農(nóng)藝性狀的遺傳分析。并利用簡化基因組測序與SNP (Single nucleotide polymorphisms)分型技術(shù),對甜瓜株型性狀、抗白粉病性狀等重要農(nóng)藝性狀進行全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association studies, GWAS),為甜瓜育種與后續(xù)研究提供借鑒。主要研究內(nèi)容與結(jié)果如下:1.以哈密瓜‘AM-5’為母本,網(wǎng)紋甜瓜‘RE-19’為父本,構(gòu)建P1、P2、Fl和F2四世代遺傳群體,對甜瓜節(jié)間長、側(cè)枝長、主莖直徑、葉面積和果皮顏色進行遺傳分析,發(fā)現(xiàn)甜瓜果皮顏色為質(zhì)量性狀,受單基因控制,其它性狀為數(shù)量性狀,受多基因控制。采用主基因+多基因遺傳模型對4個數(shù)量性狀進行分析發(fā)現(xiàn):節(jié)間長和側(cè)枝長遺傳符合兩對加性-顯性主基因+加性-顯性多基因模型,主莖直徑遺傳符合兩對加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性...
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:102 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
致謝
縮略詞表
摘要
Abstract
1 前言
1.1 甜瓜生物學(xué)特征
1.2 研究背景
2 文獻綜述
2.1 甜瓜的起源與分類
2.2 甜瓜重要農(nóng)藝性狀的研究進展
2.2.1 甜瓜株型性狀
2.2.2 甜瓜抗白粉病性狀
2.2.3 甜瓜耐裂果性狀
2.3 甜瓜遺傳圖譜與分子標記的研究進展
2.4 SNP標記的高通量開發(fā)與分型
2.5 全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進展
2.6 本研究的目的與意義
3 甜瓜株型性狀的遺傳分析
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 試驗材料
3.2.2 試驗方法
3.2.3 統(tǒng)計分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 四世代株型相關(guān)性狀值分布
3.3.2 遺傳模型的選擇和檢測
3.3.3 遺傳參數(shù)的估計
3.4 討論
4 甜瓜株型性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析
4.1 引言
4.2 材料與方法
4.2.1 試驗材料
4.2.2 試驗方法
4.2.3 性狀調(diào)查
4.2.4 甜瓜基因組DNA提取
4.2.5 RAD文庫構(gòu)建與測序
4.2.6 SNP基因型分型
4.2.7 全基因組關(guān)聯(lián)分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 表型數(shù)據(jù)分析
4.3.2 限制性內(nèi)切酶與測序深度的選擇
4.3.3 測序數(shù)據(jù)的統(tǒng)計
4.3.4 甜瓜五個性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
4.4 討論
5 甜瓜耐裂果性狀的遺傳分析
5.1 引言
5.2 材料與方法
5.2.1 試驗材料
5.2.2 試驗方法
5.2.3 性狀調(diào)查
5.2.4 統(tǒng)計分析
5.3 結(jié)果與分析
5.3.1 甜瓜耐裂果性狀鑒定方法和評價標準
5.3.2 六世代耐裂果性狀值分布
5.3.3 遺傳模型的選擇和檢測
5.3.4 遺傳參數(shù)的估計
5.4 討論
6 甜瓜抗白粉病性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
6.1 引言
6.2 材料與方法
6.2.1 試驗材料
6.2.2 試驗方法
6.2.3 甜瓜基因組DNA提取
6.2.4 白粉病接種、癥狀及病原菌形態(tài)觀察
6.2.5 抗病性調(diào)查與混池構(gòu)建
6.2.6 2b-RAD文庫構(gòu)建與測序
6.2.7 SNP calling與Genotyping
6.2.8 全基因組關(guān)聯(lián)分析
6.3 結(jié)果與分析
6.3.1 白粉病病原與免疫葉片鏡檢
6.3.2 甜瓜大棚內(nèi)接種白粉病抗性遺傳規(guī)律分析
6.3.3 測序數(shù)據(jù)的統(tǒng)計與SNP基因型分型
6.3.4 甜瓜抗白粉病性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
6.4 討論
7 總結(jié)、展望與創(chuàng)新性
7.1 全文總結(jié)
7.2 本研究創(chuàng)新性
7.3 后續(xù)展望
參考文獻
附錄一
附錄二
附錄三
攻讀博士學(xué)位期間主要的研究成果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]榨菜瘤狀莖膨大性狀遺傳分析[J]. 張郎郎,劉斌,李俊星,陳利萍. 核農(nóng)學(xué)報. 2014(01)
[2]羅漢果裂果的預(yù)防試驗初報[J]. 彭小列,田啟建,陳繼富,張繼賢,劉世彪. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(19)
[3]甜瓜(Cucumis melo L.)種下分類專論[J]. 林德佩. 中國瓜菜. 2012(05)
[4]新疆紅棗裂果機理研究進展[J]. 陳輝惶,李建貴,張俊,杜妍. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(06)
[5]辣椒果實性狀主基因+多基因遺傳分析[J]. 陳學(xué)軍,方榮,周坤華,繆南生,黃長林. 西北植物學(xué)報. 2012(02)
[6]甜瓜遺傳圖譜的構(gòu)建及果實與種子QTL分析[J]. 王賢磊,高興旺,李冠,王惠林,耿守東,康鋒,聶祥祥. 遺傳. 2011(12)
[7]上海地區(qū)西甜瓜白粉病菌生理小種的鑒定[J]. 顧海峰,張旭,張文芳,金春英,徐蘭,盧小露,樊靜華. 上海農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2010(04)
[8]柚裂果研究進展[J]. 李進學(xué),朱春華,高俊燕,楊恩聰,岳建強. 亞熱帶農(nóng)業(yè)研究. 2010(03)
[9]中國栽培甜瓜植物的起源、分類及進化[J]. 林德佩. 中國瓜菜. 2010(04)
[10]西瓜裂果性狀的基因型研究[J]. 江海坤,袁希漢,章鎮(zhèn),蘇小俊,徐海,宋波,陳龍正,安林海,單奇?zhèn)?張其安. 華北農(nóng)學(xué)報. 2009(S1)
碩士論文
[1]哈密瓜SSR永久遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀定位分析[D]. 陸芳.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號:3415557
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:102 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
致謝
縮略詞表
摘要
Abstract
1 前言
1.1 甜瓜生物學(xué)特征
1.2 研究背景
2 文獻綜述
2.1 甜瓜的起源與分類
2.2 甜瓜重要農(nóng)藝性狀的研究進展
2.2.1 甜瓜株型性狀
2.2.2 甜瓜抗白粉病性狀
2.2.3 甜瓜耐裂果性狀
2.3 甜瓜遺傳圖譜與分子標記的研究進展
2.4 SNP標記的高通量開發(fā)與分型
2.5 全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進展
2.6 本研究的目的與意義
3 甜瓜株型性狀的遺傳分析
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 試驗材料
3.2.2 試驗方法
3.2.3 統(tǒng)計分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 四世代株型相關(guān)性狀值分布
3.3.2 遺傳模型的選擇和檢測
3.3.3 遺傳參數(shù)的估計
3.4 討論
4 甜瓜株型性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析
4.1 引言
4.2 材料與方法
4.2.1 試驗材料
4.2.2 試驗方法
4.2.3 性狀調(diào)查
4.2.4 甜瓜基因組DNA提取
4.2.5 RAD文庫構(gòu)建與測序
4.2.6 SNP基因型分型
4.2.7 全基因組關(guān)聯(lián)分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 表型數(shù)據(jù)分析
4.3.2 限制性內(nèi)切酶與測序深度的選擇
4.3.3 測序數(shù)據(jù)的統(tǒng)計
4.3.4 甜瓜五個性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
4.4 討論
5 甜瓜耐裂果性狀的遺傳分析
5.1 引言
5.2 材料與方法
5.2.1 試驗材料
5.2.2 試驗方法
5.2.3 性狀調(diào)查
5.2.4 統(tǒng)計分析
5.3 結(jié)果與分析
5.3.1 甜瓜耐裂果性狀鑒定方法和評價標準
5.3.2 六世代耐裂果性狀值分布
5.3.3 遺傳模型的選擇和檢測
5.3.4 遺傳參數(shù)的估計
5.4 討論
6 甜瓜抗白粉病性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
6.1 引言
6.2 材料與方法
6.2.1 試驗材料
6.2.2 試驗方法
6.2.3 甜瓜基因組DNA提取
6.2.4 白粉病接種、癥狀及病原菌形態(tài)觀察
6.2.5 抗病性調(diào)查與混池構(gòu)建
6.2.6 2b-RAD文庫構(gòu)建與測序
6.2.7 SNP calling與Genotyping
6.2.8 全基因組關(guān)聯(lián)分析
6.3 結(jié)果與分析
6.3.1 白粉病病原與免疫葉片鏡檢
6.3.2 甜瓜大棚內(nèi)接種白粉病抗性遺傳規(guī)律分析
6.3.3 測序數(shù)據(jù)的統(tǒng)計與SNP基因型分型
6.3.4 甜瓜抗白粉病性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
6.4 討論
7 總結(jié)、展望與創(chuàng)新性
7.1 全文總結(jié)
7.2 本研究創(chuàng)新性
7.3 后續(xù)展望
參考文獻
附錄一
附錄二
附錄三
攻讀博士學(xué)位期間主要的研究成果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]榨菜瘤狀莖膨大性狀遺傳分析[J]. 張郎郎,劉斌,李俊星,陳利萍. 核農(nóng)學(xué)報. 2014(01)
[2]羅漢果裂果的預(yù)防試驗初報[J]. 彭小列,田啟建,陳繼富,張繼賢,劉世彪. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(19)
[3]甜瓜(Cucumis melo L.)種下分類專論[J]. 林德佩. 中國瓜菜. 2012(05)
[4]新疆紅棗裂果機理研究進展[J]. 陳輝惶,李建貴,張俊,杜妍. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(06)
[5]辣椒果實性狀主基因+多基因遺傳分析[J]. 陳學(xué)軍,方榮,周坤華,繆南生,黃長林. 西北植物學(xué)報. 2012(02)
[6]甜瓜遺傳圖譜的構(gòu)建及果實與種子QTL分析[J]. 王賢磊,高興旺,李冠,王惠林,耿守東,康鋒,聶祥祥. 遺傳. 2011(12)
[7]上海地區(qū)西甜瓜白粉病菌生理小種的鑒定[J]. 顧海峰,張旭,張文芳,金春英,徐蘭,盧小露,樊靜華. 上海農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2010(04)
[8]柚裂果研究進展[J]. 李進學(xué),朱春華,高俊燕,楊恩聰,岳建強. 亞熱帶農(nóng)業(yè)研究. 2010(03)
[9]中國栽培甜瓜植物的起源、分類及進化[J]. 林德佩. 中國瓜菜. 2010(04)
[10]西瓜裂果性狀的基因型研究[J]. 江海坤,袁希漢,章鎮(zhèn),蘇小俊,徐海,宋波,陳龍正,安林海,單奇?zhèn)?張其安. 華北農(nóng)學(xué)報. 2009(S1)
碩士論文
[1]哈密瓜SSR永久遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀定位分析[D]. 陸芳.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號:3415557
本文鏈接:http://sikaile.net/shoufeilunwen/nykjbs/3415557.html
最近更新
教材專著