在全球氣候快速變化條件下,現(xiàn)有森林樹種的生存面臨極大的挑戰(zhàn)。為了預(yù)測(cè)森林對(duì)氣候變化的響應(yīng),提高森林的適應(yīng)能力,研究者們需要了解森林樹種的進(jìn)化歷史和適應(yīng)性的遺傳基礎(chǔ)。但是人們對(duì)森林樹種尤其是針葉樹種的遺傳分化和適應(yīng)性機(jī)制的研究遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后于草本植物。本研究選取中國(guó)北方的主要針葉林樹種-油松（Pinus tabuliformis Carr.）為對(duì)象,以研究該樹種的遺傳多樣性和適應(yīng)性進(jìn)化機(jī)制。在覆蓋油松全分布區(qū)采樣的基礎(chǔ)上,本研究通過(guò)簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù)（genotyping by sequencing,GBS）尋找覆蓋全基因組的多態(tài)性（SNP）位點(diǎn),然后結(jié)合細(xì)胞質(zhì)基因組標(biāo)記共同分析油松遺傳變異的空間分布格局;并運(yùn)用溯祖模擬探討油松的分化歷史;最后利用基因型-環(huán)境相關(guān)方法解析油松的生態(tài)位分化,挖掘發(fā)生適應(yīng)性分化的位點(diǎn),定量中性因素和自然選擇在油松遺傳分化中的作用。本研究的主要研究結(jié)果如下:（1）分析了油松核基因群體結(jié)構(gòu)和遺傳變異模式。在油松全分布區(qū)一共采集了17個(gè)群體,利用簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù)GBS,得到393,488個(gè)SNPs,通過(guò)嚴(yán)格地過(guò)濾最終保留了 4077個(gè)高質(zhì)量的SNPs用于后續(xù)分析。結(jié)果... 

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

GBS數(shù)據(jù)質(zhì)量統(tǒng)計(jì)

￣Ｆｉｇ．２－４?ＰＣＡ?ｐｌｏｔｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ＧＢＳ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ?ｉｎ?１７?ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ?ｏｆ?Ｐ．?ｔａｂｕｌｉｆｏｒｍｉｓ??注：如圖給出了從ＰＣＩ到ＰＣ４的遺傳變異模式??Ｎｏｔｅ：?Ｐａｔｔｅｒｎｓ?ｏｆ?ｇｅｎｅｔｉｃ?ｄｉｖｅｒｇｅｎｃｅ?ａｌｏｎｇ?ＰＣ１－ＰＣ４?ａｒｅ?ｐｒｅｓｅｎｔｅｄ．??油松群體間分化程度普遍較低。三個(gè)大組（北部、西部和南部）之間的群體分??化系數(shù)（Ｆｓｔ）為０．００６－０．０３２，其中南部組與其它兩個(gè)組間的分化系數(shù)較高??（Ｆ＝０．０３０－０．０３２）（Ｆ＝０．００６２－３。

異一共得到１０９個(gè)葉綠體單倍型，總的雜合度是０．９８６?（表３－１和３－５）。油松中所有??的葉綠體單倍型發(fā)生的頻率都小于５％，其中有８３個(gè)單倍型在所有樣本中只出現(xiàn)過(guò)??一次，最常見的單倍型Ｃ３也只在１２個(gè)體（覆蓋９個(gè)群體）中出現(xiàn)（圖３－１）。因此??每個(gè)油松群體含有不同的葉綠體單倍型成分（圖３－１）。去除僅出現(xiàn)一次的單倍型后，??我們對(duì)剩下的３９個(gè)單倍型構(gòu)建ｎｅｔｗｏｒｋ，結(jié)果顯示這些單倍型表現(xiàn)出復(fù)雜的網(wǎng)狀關(guān)??系（圖３－１）。??叫?ｆｃ?ｍｏ＊?ｂ?ｉ２ｙ?ｅ??二：廠??一，＇?ｓｓ?癱??ｚｗ?，?—ｌｋ?？＿：：ｔ?＾??ｆ?ｌｃｖａｉｉｏｎ?ｇｒａｄｉｅｎｔ?ｂａｒ?Ｓｃａｌｅ?ｂａｒ??ａ?７Ｍ?ＩＫＡ?Ｉ７Ｕ＞?ＭＵＯ?ｎｆｌＵ４４ａｉＭＵＵｍ?ｌ？＜?４＜ｋｌｌｃｉ？??圖３－１葉綠體單倍型網(wǎng)絡(luò)圖和油松每個(gè)群體的葉綠體組成??Ｆｉｇ．?３－１?Ｎｅｔｗｏｒｋ?ｏｆ?ｃｈｒｏｌｏｐｌａｓｔ?ｈｙｐｌｏｔｙｐｅ?ａｎｄ?ｐｉｅ?ｃｈａｒｔｓ??３．２．２線粒體遺傳變異模式??線粒體三個(gè)片段聯(lián)合的長(zhǎng)度在個(gè)體間差異較小，為１４４３到１４６８ｂｐ不等。ｍ？／ｌ－??２、ｍ＾４－３與ｍ＾５－ｌ三個(gè)片段在２１６個(gè)個(gè)體中分別得到２個(gè)、３個(gè)和４個(gè)單倍型（表??３－１），合并３個(gè)位點(diǎn)上的變異共獲得１０個(gè)單倍型（表３－５），總的雜合度是０．８３８。??線粒體片段的單倍型在油松中呈現(xiàn)出清晰的地區(qū)特異分布模式（圖３－２）。三個(gè)??西部群體由Ｍ１０主導(dǎo)，三個(gè)南部群體由Ｍ８主導(dǎo)（包括兩個(gè)南方群體和ＺＷ子午??嶺）

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]物種分布模型理論研究進(jìn)展[J]. 李國(guó)慶,劉長(zhǎng)成,劉玉國(guó),楊軍,張新時(shí),郭柯.  生態(tài)學(xué)報(bào). 2013(16)
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[5]油松同工酶位點(diǎn)選擇研究[J]. 張春曉,李悅,陳雪梅.  北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1999(01)



本文編號(hào)：3349260