銀杏是我國(guó)特有的珍貴樹(shù)種,具有典型的喜溫暖和陽(yáng)光的特性,適應(yīng)性廣,抗逆性強(qiáng)、壽命長(zhǎng)、病蟲(chóng)害少、經(jīng)濟(jì)價(jià)值高;銀杏因其形態(tài)特性及進(jìn)化地位,具有極大的葉用價(jià)值、核用價(jià)值、觀賞價(jià)值、生態(tài)價(jià)值、科研價(jià)值,目前銀杏的藥用價(jià)值在世界范圍內(nèi)得到廣泛的關(guān)注和認(rèn)可。銀杏全基因組測(cè)序工作的完成為銀杏高通量測(cè)序技術(shù)提供了可用的參考基因組,但有參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序仍然未在解釋銀杏生物學(xué)現(xiàn)象中普遍應(yīng)用;蛋白質(zhì)組、代謝組,尤其是多組學(xué)聯(lián)合分析技術(shù)是解釋自然界生物學(xué)現(xiàn)象的有效工具,但目前在銀杏中尚未得到應(yīng)用。雖然到目前為止很多銀杏黃酮合成相關(guān)的基因已經(jīng)被克隆,但是針對(duì)它們的研究深度都比較淺,黃酮類(lèi)化合物在銀杏中的生物合成途徑尚不十分清楚。本研究以葉用銀杏良種‘銀杏泰山（TS10）家系’為研究對(duì)象,對(duì)該家系葉片黃酮類(lèi)化合物進(jìn)行年動(dòng)態(tài)觀測(cè),探明其黃酮類(lèi)化合物年變化規(guī)律,并對(duì)銀杏葉片中代謝物與黃酮類(lèi)化合物進(jìn)行定量、定性分析;首次在銀杏葉片3個(gè)關(guān)鍵發(fā)育時(shí)期進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組、代謝組、蛋白組多組學(xué)分析,對(duì)銀杏葉片中黃酮類(lèi)化合物生物合成機(jī)理進(jìn)行了系統(tǒng)研究,通過(guò)不同時(shí)期差異基因、差異蛋白、差異代謝物的表達(dá)量相互關(guān)系,篩選出銀杏葉黃酮類(lèi)化合物生物合... 

【文章來(lái)源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
符號(hào)說(shuō)明
中文摘要
Abstract
1 引言
    1.1 銀杏簡(jiǎn)介
    1.2 銀杏藥用價(jià)值研究進(jìn)展
    1.3 銀杏黃酮類(lèi)化合物及其提取純化技術(shù)
        1.3.1 黃酮類(lèi)化合物的概念及分類(lèi)
        1.3.2 銀杏黃酮類(lèi)化合物提技術(shù)
    1.4 黃酮類(lèi)化合物生物合成途徑調(diào)控機(jī)制進(jìn)展
        1.4.1 擬南芥等物種黃酮類(lèi)化合物生物合成途徑調(diào)控機(jī)制進(jìn)展
        1.4.2 銀杏黃酮類(lèi)化合物生物合成途徑調(diào)控機(jī)制進(jìn)展
    1.5 測(cè)序技術(shù)在遺傳育種中的應(yīng)用
        1.5.1 轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在木本植物中的應(yīng)用
        1.5.2 蛋白組技術(shù)在木本植物中的應(yīng)用
        1.5.3 代謝組技術(shù)在木本植物中的應(yīng)用
    1.6 研究的目的及意義
    1.7 本研究技術(shù)路線
2 材料與方法
    2.1 試驗(yàn)地概況
    2.2 試驗(yàn)材料
    2.3 研究方法
        2.3.1 不同月份銀杏葉及不同銀杏組織黃酮類(lèi)化合物含量測(cè)定
        2.3.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生物信息學(xué)分析
        2.3.3 代謝組測(cè)序及生物信息學(xué)分析
        2.3.4 iTRAQ蛋白組測(cè)序及生物信息學(xué)分析
        2.3.5 多組學(xué)聯(lián)合分析
        2.3.6 差異表達(dá)基因的表達(dá)量分析
    2.4 數(shù)據(jù)處理
3 結(jié)果與分析
    3.1 銀杏葉及不同組織黃酮類(lèi)化合物含量季節(jié)變化分析
        3.1.1 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物含量年變化
        3.1.2 銀杏不同組織黃酮類(lèi)化合物含量差異
        3.1.3 不同對(duì)比組合間銀杏葉片黃酮類(lèi)化合物含量差異
    3.2 銀杏葉代謝物及黃酮類(lèi)化合物定量及定性檢測(cè)
        3.2.1 銀杏葉代謝物種類(lèi)的定量及定性分析
        3.2.2 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物定量及定性檢測(cè)
    3.3 不同時(shí)期銀杏葉片廣泛靶向代謝組測(cè)序及生物信息學(xué)分析
        3.3.1 總體樣本主成分分析
        3.3.2 聚類(lèi)分析
        3.3.3 重復(fù)相關(guān)性評(píng)估
        3.3.4 不同時(shí)期銀杏葉差異代謝物篩選
        3.3.5 差異代謝物KEGG功能注釋及富集分析
        3.3.6 銀杏葉差異代謝物在黃酮類(lèi)化合物補(bǔ)充數(shù)據(jù)庫(kù)中的表達(dá)
    3.4 不同發(fā)育時(shí)期銀杏葉片轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生物信息學(xué)分析
        3.4.1 各樣本測(cè)序數(shù)據(jù)過(guò)濾統(tǒng)計(jì)分析
        3.4.2 各樣本c DNA文庫(kù)與銀杏參考基因組比對(duì)分析
        3.4.3 表達(dá)量估計(jì)
        3.4.4 差異表達(dá)分析
        3.4.5 差異表達(dá)基因統(tǒng)計(jì)結(jié)果注釋
        3.4.6 差異表達(dá)基因(DEGs)GO功能分析
        3.4.7 KEGG通路分析
        3.4.8 變異分析
        3.4.9 轉(zhuǎn)錄因子分析
    3.5 基于iTRAQ定量的不同時(shí)期銀杏葉片蛋白組測(cè)序及生物信息學(xué)分析
        3.5.1 蛋白質(zhì)鑒定
        3.5.2 蛋白質(zhì)iTRAQ定量及差異蛋白的篩選
        3.5.3 蛋白GO注釋分析
        3.5.4 差異表達(dá)蛋白KOG注釋
        3.5.5 差異蛋白的Pathway富集分析
        3.5.6 差異表達(dá)蛋白亞細(xì)胞定位
    3.6 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物調(diào)控的轉(zhuǎn)錄、蛋白、代謝聯(lián)合分析
        3.6.1 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物合成途徑關(guān)鍵基因、蛋白及代謝物的篩選
        3.6.2 黃酮類(lèi)化合物生物合成途徑差異基因與差異代謝物表達(dá)的相關(guān)網(wǎng)絡(luò)關(guān)系
        3.6.3 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物生物合成與其他生物學(xué)途徑相互關(guān)系
        3.6.4 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物合成關(guān)鍵調(diào)控途徑
    3.7 差異基因表達(dá)量的qRT-PCR分析
        3.7.1 差異基因的表達(dá)量驗(yàn)證
        3.7.2 關(guān)鍵基因在不同銀杏組織中的表達(dá)量驗(yàn)證
4 討論
    4.1 銀杏葉片黃酮類(lèi)化合物的種類(lèi)
    4.2 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物含量的時(shí)間、空間變化分析
    4.3 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物合成與其他生物代謝途徑的關(guān)系
    4.4 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物合成關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄、蛋白、代謝調(diào)控機(jī)制
5 結(jié)論
    5.1 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物含量年變化及不同銀杏組織黃酮類(lèi)化合物含量分析
    5.2 銀杏葉代謝物及黃酮類(lèi)化合物種類(lèi)的定量及定性分析
    5.3 基于多組學(xué)分析的不同時(shí)期銀杏葉片黃酮類(lèi)化合物合成差異分析
    5.4 銀杏葉黃酮類(lèi)化合物合成的轉(zhuǎn)錄、蛋白及代謝調(diào)控
參考文獻(xiàn)
附表1 銀杏葉中32大類(lèi)代謝物定性及定量表
附表2 銀杏葉中165種黃酮類(lèi)化合物定性及定量分析表
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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[3]從銀杏葉中提取精制銀杏黃酮的研究[D]. 趙文龍.北京化工大學(xué) 2018
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[6]銀杏3個(gè)WD40轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及表達(dá)量分析[D]. 馮如.武漢輕工大學(xué) 2017
[7]不同樹(shù)齡銀杏葉片差異蛋白研究[D]. 周凱凱.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[8]銀杏種子休眠不同階段的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究[D]. 崔慧.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[9]銀杏不同樹(shù)齡維管形成層活動(dòng)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究[D]. 趙建國(guó).揚(yáng)州大學(xué) 2017
[10]銀杏種胚發(fā)育的差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 李佳.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



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