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植物促生菌解淀粉芽孢桿菌SQR9根際趨化的分子機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2021-07-09 03:41
  植物根際促生菌(Plantgrowth-promotingrhizobacteria,PGPRs)具有植物促生及土傳病原菌生防功能,合理施用含PGPRs的生物肥料是實(shí)現(xiàn)我國化肥減施、促進(jìn)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的有效途徑。生物肥料中的PGPRs施入土壤后需在作物根際有效定殖才能發(fā)揮作用,而由根系分泌物介導(dǎo)的PGPRs向根表的趨化過程是其有效定殖的重要前提。解淀粉芽孢桿菌是根際環(huán)境中一類比較重要的PGPRs,然而對其在根際趨化分子機(jī)制的相關(guān)研究鮮有報(bào)道。解淀粉芽孢桿菌SQR9(Bacillus amyloliquefaciens SQR9,以下簡稱SQR9)是本實(shí)驗(yàn)室分離自健康黃瓜根際并廣泛應(yīng)用的植物根際促生菌,前期研究發(fā)現(xiàn)菌株SQR9對黃瓜根系分泌物中的多種小分子有機(jī)酸表現(xiàn)出較強(qiáng)趨化性。在此基礎(chǔ)上,本文緊緊圍繞菌株SQR9趨化黃瓜根際過程中相互作用的兩個(gè)方面,即菌株 SQR9 中甲基趨化受體蛋白(Methyl-acceptingchemotaxisproteins,MCPs)和黃瓜根系分泌物(Cucumber root exudates,CREs)中的趨化物,開展了一系列研究。首先,依據(jù)MCPs... 

【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:134 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

植物促生菌解淀粉芽孢桿菌SQR9根際趨化的分子機(jī)制研究


圖1-2大腸桿菌的趨化信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑示意圖(Porter?etal.,2011)??ure?1-2?Thecohoxisahwa

序列,豐度,受體,蛋白


物的機(jī)制和規(guī)律具有重要意義(Alvaro?et??al.,?2017)。甲基化結(jié)構(gòu)域,由兩個(gè)螺旋束構(gòu)成,攜帶保守的谷氨酰胺和谷氨酸殘基,??可被甲基轉(zhuǎn)移酶CheR甲基化,被甲基酯酶CheB去甲基化,用于適應(yīng)趨化效應(yīng)物濃??度變化。另外,甲基化結(jié)構(gòu)域可以作為判斷甲基趨化受體蛋白的評判標(biāo)準(zhǔn)(Alexander??and?Zhulin,?2007)。??研究發(fā)現(xiàn),己經(jīng)確定的LBD種類約八十多種,而未被發(fā)現(xiàn)的LBD數(shù)量將遠(yuǎn)遠(yuǎn)超??過該數(shù)字(Wuichet?and?Zhulin,2010)。如圖1-3所示,一共分析了?26530條序列,其??中10658條序列沒有LBD或?qū)儆谖粗愋停蹋拢,其它15872條序列存在己知LBD。??LBD類型中豐度最高的依次為4HB、dCache和PAS:?4HB是豐度最高的,占了?31?%,??普遍存在于細(xì)菌和古菌中(UlrichandZhUlin,2005),尤其是大腸桿菌中研宄的最透徹??(Parkinson?etal.,2015);?Cache?又分為?sCache?和?dCache,共計(jì)占?33?%,其中?dCache??的豐度遠(yuǎn)高于sCache,僅次于4HB,而且dCache與配體的結(jié)合位點(diǎn)全部位于膜遠(yuǎn)端??(Alvaroetal.,2017);?PAS的豐度排第三,與前兩種主要存在于原核生物中的結(jié)構(gòu)域??不同,PAS也廣泛存在于真核生物中,而且?guī)缀跛械模校粒又淮嬖谟诎|(zhì)中(Taylor??and?Zhulin,?1999;?Henry?and?Crosson,?2011),研宄發(fā)現(xiàn),PAS與趨氧性和能量趨化的關(guān)??系都比較密切(Alvaro?etal.,2017);除上述三種LBD結(jié)構(gòu)域(

技術(shù)路線圖,技術(shù)路線,基因,菌株


終獲得SQR9中所有趨化受體基因的突變體。??#??.-?UP?down?back???^?hh???|?Fusion?P(?R??|?Transform??UP?down?back????■■???I?SoirrtioQ?on?Spc??thr????、、??^???t?i??\?/??、、???????,?’??|?Srlrctioii?on?I)L-4-<?l-Pbc??<hr ̄aiKH???圖2-1基因無痕敲除的技術(shù)路線??Figure?2-1?The?technology?route?of?marker-free?chromosome?deletion??1.2.3菌株SQR9互補(bǔ)菌株構(gòu)建??利用融合PCR技術(shù),將回補(bǔ)基因(如圖2-2,攜帶自身啟動(dòng)子,、抗性基??因片段(c/w或ipc)以及插入位點(diǎn)上下游同源片段和om_)^-Dn)進(jìn)行融合,??經(jīng)同源重組雙交換后,插入SQR9染色體基因組的淀粉酶基因位點(diǎn),得到互補(bǔ)菌株,??構(gòu)建融合片段步驟詳見本章方法1.2.2中所述。??22??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3272949

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