玉米（Zea mays L.）隸屬于禾本科玉蜀黍?qū)?作為世界上主要的糧食作物、飼料及工業(yè)原料之一,廣泛分布于全球各個(gè)國家,其產(chǎn)量和品質(zhì)一直以來是玉米育種的主要目標(biāo)。為了摸清新形勢下四川玉米育種的種質(zhì)特點(diǎn),為未來四川玉米育種發(fā)展方向的確定提供參考,本研究以“十三五”四川省玉米育種攻關(guān)組8家骨干參加單位當(dāng)前廣泛使用的玉米骨干自交系為材料,通過簡化基因組測序（genotyping by sequencing,GBS）分析自交系間的遺傳關(guān)系、按照NCⅡ遺傳交配設(shè)計(jì)配制雜交組合分析自交系的產(chǎn)量性狀配合力效應(yīng)、利用全基因組關(guān)聯(lián)分析（genome-wide association study,GWAS）策略對穗長等產(chǎn)量性狀一般配合力（general combining ability,GCA）靶點(diǎn)進(jìn)行檢測。本研究主要結(jié)果如下:（1）通過GBS技術(shù)在157份玉米自交系中開發(fā)了4,976個(gè)高質(zhì)量SNP標(biāo)記。SNP分子標(biāo)記的等位基因變異為3⁵個(gè),平均為3.22個(gè);基因多樣性（gene diversity,GD）為0.1470⁰.7512,平均為0.5066;多態(tài)... 

【文章來源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：175 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
abstract
符號說明
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 玉米種質(zhì)資源的形成與利用
        1.1.1 玉米的起源與馴化
        1.1.2 玉米的傳播與分布
        1.1.3 玉米的種質(zhì)多樣性與分類
        1.1.4 我國玉米種質(zhì)資源的利用現(xiàn)狀
    1.2 DNA分子標(biāo)記與測序技術(shù)的發(fā)展
        1.2.1 分子標(biāo)記的類型
        1.2.2 傳統(tǒng)(一代)測序技術(shù)簡介
        1.2.3 高通量(二代)測序技術(shù)的突破
        1.2.4 第三代測序技術(shù)的發(fā)展
        1.2.5 各類測序技術(shù)的廣泛應(yīng)用
    1.3 植物性狀配合力與雜種優(yōu)勢群劃分
        1.3.1 配合力的概念
        1.3.2 配合力的測定及評價(jià)
        1.3.3 配合力在植物中的研究概況
        1.3.4 玉米產(chǎn)量相關(guān)性狀配合力的研究進(jìn)展
        1.3.5 基于配合力的玉米雜種優(yōu)勢群劃分
        1.3.6 基于分子標(biāo)記的玉米類群劃分
    1.4 全基因組關(guān)聯(lián)分析及其對重要性狀的研究進(jìn)展
        1.4.1 連鎖不平衡(LD)的概念及原理
        1.4.2 影響連鎖不平衡(LD)的因素
        1.4.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析的發(fā)展
        1.4.4 全基因組關(guān)聯(lián)分析的基本方法
        1.4.5 全基因組關(guān)聯(lián)分析的應(yīng)用
    1.5 本研究的意義和技術(shù)路線
        1.5.1 研究的意義
        1.5.2 技術(shù)路線
        1.5.3 研究的內(nèi)容
第二章 基于SNPs的四川當(dāng)前玉米種質(zhì)的遺傳特征鑒定
    2.1 材料與方法
        2.1.1 試驗(yàn)材料
        2.1.2 DNA樣品制備
        2.1.3 玉米GBS文庫構(gòu)建與測序
        2.1.4 SNP基因型鑒定
        2.1.5 SNP統(tǒng)計(jì)分析
        2.1.6 親緣關(guān)系評估
        2.1.7 群體結(jié)構(gòu)分析
        2.1.8 連鎖不平衡分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 基因組DNA提取
        2.2.2 Illumina xten測序
        2.2.3 參考基因組序列比對
        2.2.4 SNP的鑒定與篩選
        2.2.5 SNP特征分析
        2.2.6 Kinship分析
        2.2.7 群體結(jié)構(gòu)分析
        2.2.8 主成分分析
        2.2.9 系統(tǒng)發(fā)育樹分析
        2.2.10 亞群間遺傳多樣性分析
        2.2.11 連鎖不平衡分析
    2.3 討論與結(jié)論
        2.3.1 GBS提供經(jīng)濟(jì)高效的基因分型技術(shù)
        2.3.2 四川當(dāng)前玉米育種種質(zhì)的遺傳多樣性
        2.3.3 四川當(dāng)前玉米育種自交系群體的連鎖不平衡距離
        2.3.4 四川當(dāng)前玉米種質(zhì)的雜種優(yōu)勢模式與利用
第三章 四川當(dāng)前玉米種質(zhì)的產(chǎn)量配合力評價(jià)
    3.1 材料與方法
        3.1.1 試驗(yàn)材料
        3.1.2 雜交組合配制
        3.1.3 田間試驗(yàn)設(shè)計(jì)
        3.1.4 產(chǎn)量相關(guān)性狀調(diào)查
        3.1.5 性狀資料的整理與描述
        3.1.6 表型差異顯著性檢驗(yàn)
        3.1.7 產(chǎn)量性狀配合力分析
        3.1.8 表型相關(guān)性分析
        3.1.9 雜種優(yōu)勢分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 雜交組合產(chǎn)量性狀的群體表現(xiàn)
        3.2.2 組合間的表型方差分析
        3.2.3 玉米自交系的配合力分析
        3.2.4 親本配合力效應(yīng)與雜交組合表型的相關(guān)性
        3.2.5 144個(gè)自交系的綜合評價(jià)
        3.2.6 雜種優(yōu)勢分析及雜優(yōu)類群劃分
    3.3 討論與結(jié)論
        3.3.1 玉米產(chǎn)量性狀及其配合力相關(guān)性
        3.3.2 配合力評價(jià)中測驗(yàn)種的選擇
        3.3.3 四川當(dāng)前育種自交系配合力評價(jià)與后續(xù)應(yīng)用
        3.3.4 四川當(dāng)前玉米育種自交系的雜優(yōu)類群劃分
第四章 玉米產(chǎn)量性狀配合力的全基因組關(guān)聯(lián)分析
    4.1 材料與方法
        4.1.1 試驗(yàn)材料
        4.1.2 田間試驗(yàn)和性狀調(diào)查
        4.1.3 基因型鑒定
        4.1.4 親緣關(guān)系、LD和群體結(jié)構(gòu)評估
        4.1.5 全基因組關(guān)聯(lián)分析
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 關(guān)聯(lián)分析模型的選取
        4.2.2 產(chǎn)量性狀GCA顯著位點(diǎn)
        4.2.3 兩個(gè)環(huán)境中的一致性GCA位點(diǎn)
        4.2.4 本研究中產(chǎn)量GCA位點(diǎn)與早期結(jié)果的比較
    4.3 討論與結(jié)論
        4.3.1 適合關(guān)聯(lián)分析表型性狀的選擇
        4.3.2 關(guān)聯(lián)分析群體構(gòu)建
        4.3.3 LD大小及模型對分析結(jié)果的影響
        4.3.4 玉米產(chǎn)量相關(guān)性狀配合力位點(diǎn)研究
第五章 全文總結(jié)與討論
    5.1 四川當(dāng)前玉米種質(zhì)的遺傳結(jié)構(gòu)
    5.2 四川當(dāng)前玉米種質(zhì)的產(chǎn)量性狀配合力
    5.3 基于四川當(dāng)前玉米種質(zhì)的GCA分子位點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡歷



本文編號：3190311