家牛性情是指人為操作和環(huán)境適應(yīng)所引起的一系列復(fù)雜反應(yīng)的總稱。由于與生產(chǎn)效率、勞動安全和動物福利相關(guān),因此,家牛性情是最令人感興趣的性狀之一。家牛性情性狀的特點是難以度量,因此,其背后潛在的遺傳機制研究還處于起步階段。與相對溫順的普通牛而言,婆羅門牛是性情較暴躁的瘤牛品種之一。云嶺牛是一個典型的三元雜交品種,包含1/2婆羅門牛、1/4莫累灰牛和1/4云南本地牛血統(tǒng)。本研究以婆羅門牛和云嶺牛為對象,測試了211頭牛的逃離距離、361頭牛的擠壓得分和逃離速度、157頭牛的5項神經(jīng)遞質(zhì)濃度、234頭牛的15個曠場性狀和14個新物體性狀,測試的個體之間存在較大的交集。更重要的是,本研究還對其中測試的31頭婆羅門牛和131頭云嶺牛進行了全基因組測序。通過對上述表型性狀的全基因組關(guān)聯(lián)（GWAS）分析,取得如下新的結(jié)果:1.通過比較云嶺�；蚪M和云嶺牛祖先基因組,發(fā)現(xiàn)云嶺牛含有44%的歐洲普通牛、48%的印度瘤牛和8%的中國瘤牛血統(tǒng),表明云嶺牛是研究諸如性情一類復(fù)雜性狀遺傳基礎(chǔ)的理想群體。利用局部祖先分析技術(shù)發(fā)現(xiàn),在云嶺牛基因組中,部分歐洲普通牛源、印度瘤牛源和中國瘤牛源的單倍型比例顯著高于全基因組水... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：125 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
主要符號對照表
文獻綜述
    第一章 黃牛性情性狀遺傳選育的研究進展
        1.1 性情的定義和重要性
        1.2 性情性狀的定義和測量
            1.2.1 肉牛的操作性狀
            1.2.2 奶牛的擠奶性狀
            1.2.3 其他性狀
        1.3 品種內(nèi)或品種間性情性狀的遺傳變異
            1.3.1 品種差異
            1.3.2 品種內(nèi)性情性狀的遺傳變異
            1.3.3 生產(chǎn)性狀的選擇對性情的影響
            1.3.4 分子方法:QTL和 GWAS
            1.3.5 性情性狀在選擇育種中的利用
        1.4 性情性狀選擇的壁壘
        1.5 性情性狀選育的前景
        1.6 云嶺牛和婆羅門牛的性情
            1.6.1 云嶺牛的性情
            1.6.2 婆羅門牛的性情
試驗研究
    第二章 云嶺牛的全局和局部祖先比例分析
        2.1 引言
        2.2 材料和方法
            2.2.1 樣品采集和基因組測序
            2.2.2 reads比對和SNP檢測
            2.2.3 核苷酸多樣性和連鎖不平衡檢測
            2.2.4 全局祖先比例分析
            2.2.5 局部祖先比例推斷
        2.3 結(jié)果與分析
            2.3.1 云嶺牛與婆羅門牛全基因組SNP的鑒定和核苷酸多樣性
            2.3.2 云嶺牛的全局祖先比例
            2.3.3 云嶺牛的局部祖先比例
        2.4 討論
        2.5 小結(jié)
    第三章 云嶺牛和婆羅門牛逃離反應(yīng)性狀的GWAS分析
        3.1 引言
        3.2 材料與方法
            3.2.1 表型測定
            3.2.2 遺傳分析
        3.3 結(jié)果與分析
            3.3.1 逃離反應(yīng)性狀的表型變異
            3.3.2 家牛逃離反應(yīng)性狀的相關(guān)基因座位
        3.4 討論
        3.5 小結(jié)
    第四章 云嶺牛和婆羅門牛神經(jīng)遞質(zhì)濃度的GWAS分析
        4.1 引言
        4.2 材料和方法
            4.2.1 試驗動物
            4.2.2 表型檢測和分析
            4.2.3 基因組測序、比對和SNP檢測
            4.2.4 GWAS分析
        4.3 結(jié)果與分析
            4.3.1 神經(jīng)遞質(zhì)濃度與家牛體尺性狀的關(guān)系
            4.3.2 家牛5項神經(jīng)遞質(zhì)濃度的相關(guān)基因座位
        4.4 討論
        4.5 小結(jié)
    第五章 云嶺牛和婆羅門牛曠場測試和新物體測試相關(guān)性狀的GWAS分析
        5.1 引言
        5.2 材料和方法
            5.2.1 動物群體
            5.2.2 性情性狀檢測
            5.2.3 表型分析
            5.2.4 樣品采集、基因組測序和SNP檢測
            5.2.5 GWAS分析
            5.2.6 GWAS相關(guān)座位的功能注釋
            5.2.7 通路分析
            5.2.8 組織特異性表達分析
        5.3 結(jié)果與分析
            5.3.1 性情性狀的變異及其對家牛體尺性狀的影響
            5.3.2 曠場測試相關(guān)性狀的兩品種全基因組關(guān)聯(lián)分析
            5.3.3 新物體測試相關(guān)性狀的兩品種全基因組關(guān)聯(lián)分析
            5.3.4 云嶺牛單品種的全基因組關(guān)聯(lián)分析
        5.4 討論
        5.5 小結(jié)
    第六章 結(jié)論和創(chuàng)新點
        6.1 結(jié)論
        6.2 創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
個人簡歷


【參考文獻】：
期刊論文
[1]北京地區(qū)中國荷斯坦牛性情遺傳評估[J]. 常瑤,李想,張海亮,亓建剛,郭剛,劉林,王雅春.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2019(04)
[2]奶牛性情評定方法及其影響因素分析[J]. 張馳,羅宇茜,王嘉熠,�，�,李源韜,蘇義童,黃銘逸,徐偉,張海亮,董剛輝,李錫智,王雅春.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2018(03)



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