榛（Hazelnut）隸屬于樺木科（Betulaceae）榛屬（Corylus Linn.）植物,世界上約有20種（變種）,在亞洲、歐洲和北美洲呈洲際間斷分布。自19世紀(jì)中期以來(lái),國(guó)內(nèi)外學(xué)者都曾致力于榛屬的系統(tǒng)發(fā)育研究,但到目前為止仍沒(méi)有明確的定論,尤其是對(duì)榛屬的起源、演化及分布格局成因的研究仍為空白。中國(guó)是榛屬植物的多樣性分布中心,其中平榛物種復(fù)合體（C.heterophylla Fisch.complex）是分布最廣泛的一個(gè)類(lèi)群,由平榛（C.heterophylla Fisch.）及其近緣種川榛（C.kweichowensis Hu.）、滇榛（C.yunnanensis A.Camus）構(gòu)成。該復(fù)合體蘊(yùn)藏著豐富的遺傳資源,但關(guān)于它們的物種分化、群體結(jié)構(gòu)及基因譜系關(guān)系的研究極為有限,從而阻礙了資源保護(hù)和良種選育的進(jìn)程。本研究在對(duì)榛屬物種及平榛復(fù)合體居群進(jìn)行全面取樣的基礎(chǔ)上,基于葉綠體全基因組測(cè)序,揭示了榛屬葉綠體基因組的變異和進(jìn)化特征,并在質(zhì)體基因組水平對(duì)種間關(guān)系進(jìn)行評(píng)估;通過(guò)2b-RAD簡(jiǎn)化基因組測(cè)序,在核基因組水平研究了榛屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和生物地理學(xué);以單拷貝核基因?yàn)榉肿訕?biāo)記,采... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】：133 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 引言
        1.1.1 研究背景
        1.1.2 國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展
    1.2 研究目標(biāo)和主要內(nèi)容
        1.2.1 關(guān)鍵的科學(xué)問(wèn)題與研究目標(biāo)
        1.2.2 研究?jī)?nèi)容
    1.3 研究技術(shù)路線(xiàn)
第二章 榛屬葉綠體比較和系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究
    2.1 材料與方法
        2.1.1 試驗(yàn)材料
        2.1.2 試驗(yàn)方法
        2.1.3 數(shù)據(jù)分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 葉綠體基因組的測(cè)序結(jié)果
        2.2.2 榛屬葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)特征
        2.2.3 榛屬葉綠體基因組的共線(xiàn)性分析
        2.2.4 高分辨率分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
        2.2.5 IR區(qū)的收縮與擴(kuò)張
        2.2.6 重復(fù)結(jié)構(gòu)分析
        2.2.7 系統(tǒng)發(fā)育分析
    2.3 討論
        2.3.1 榛屬葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)特征
        2.3.2 榛屬葉綠體基因組變異和序列分化
        2.3.3 重復(fù)結(jié)構(gòu)分析
        2.3.4 榛屬的系統(tǒng)發(fā)育地位及屬內(nèi)種間關(guān)系
    2.4 小結(jié)
第三章 榛屬系統(tǒng)發(fā)育和生物地理學(xué)研究
    3.1 材料與方法
        3.1.1 試驗(yàn)材料
        3.1.2 試驗(yàn)方法
        3.1.3 數(shù)據(jù)分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 2b-RAD測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)及SNP分型
        3.2.2 重組檢測(cè)
        3.2.3 系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.2.4 物種樹(shù)和遺傳結(jié)構(gòu)推斷
        3.2.5 Neighbor-Net分析
        3.2.6 分化時(shí)間估算
        3.2.7 祖先分布區(qū)重建
    3.3 討論
        3.3.1 核質(zhì)系統(tǒng)發(fā)育不一致評(píng)估
        3.3.2 榛屬種間進(jìn)化關(guān)系和分類(lèi)意義
        3.3.3 榛屬物種分化和生物地理學(xué)歷史
    3.4 小結(jié)
第四章 平榛物種復(fù)合體的遺傳分化研究
    4.1 試驗(yàn)材料和方法
        4.1.1 試驗(yàn)材料
        4.1.2 試驗(yàn)方法
        4.1.3 數(shù)據(jù)分析
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 核苷酸多態(tài)性
        4.2.2 重組和中性檢驗(yàn)
        4.2.3 遺傳分化和群體結(jié)構(gòu)
        4.2.4 單倍型譜系關(guān)系
    4.3 討論
        4.3.1 核苷酸多態(tài)性
        4.3.2 群體結(jié)構(gòu)與物種分化
    4.4 小結(jié)
第五章 結(jié)論、創(chuàng)新點(diǎn)與展望
    5.1 結(jié)論
        5.1.1 榛屬葉綠體比較和系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)
        5.1.2 基于全基因組SNPs的榛屬系統(tǒng)發(fā)育和生物地理學(xué)
        5.1.3 平榛物種復(fù)合體的遺傳分化
    5.2 創(chuàng)新點(diǎn)
    5.3 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
在讀期間的學(xué)術(shù)研究
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]中國(guó)榛屬植物資源培育與利用研究（Ⅰ）——榛種質(zhì)資源研究[J]. 王貴禧.  林業(yè)科學(xué)研究. 2018(01)
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博士論文
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[2]沙芥屬（十字花科）物種界定及物種形成研究[D]. 王倩.蘭州大學(xué) 2012
[3]西藏圓柏復(fù)合體的群體遺傳學(xué)與物種形成研究[D]. 李忠虎.蘭州大學(xué) 2010

碩士論文
[1]地黃屬植物葉綠體基因組研究[D]. 曾淑云.西北大學(xué) 2017
[2]百合屬的比較葉綠體基因組學(xué)研究[D]. 畢彧.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]華山松及其近緣種的群體遺傳學(xué)和物種形成研究[D]. 祝娟.西北大學(xué) 2016
[4]蒼山冷杉復(fù)合體與巴山冷杉復(fù)合體的物種劃分[D]. 姜雪蓮.哈爾濱師范大學(xué) 2016
[5]長(zhǎng)白耬斗菜復(fù)合體的遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 龐迪.東北師范大學(xué) 2013
[6]基于混合樣品高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的植物葉綠體基因組拼接和分析[D]. 白雪菲.浙江大學(xué) 2013



本文編號(hào)：3165904