新疆褐牛肉用功能基因篩選及基于轉(zhuǎn)錄組和全基因組的群體選育進(jìn)程分析
發(fā)布時(shí)間:2021-04-26 12:36
新疆褐牛是以新疆本地哈薩克牛為母本,先后與瑞士褐牛、阿拉塔烏牛以及科斯特羅姆牛進(jìn)行雜交,經(jīng)長(zhǎng)期選育而成的乳肉兼用型牛。經(jīng)過(guò)多年改良,其肉、乳產(chǎn)量得以有效提高。目前,新疆褐牛和哈薩克牛是新疆肉牛生產(chǎn)的主要品種。本研究以新疆褐牛和哈薩克牛種用群體為研究對(duì)象,首先對(duì)兩個(gè)品種的屠宰性狀、胴體性狀、營(yíng)養(yǎng)成分、食用品質(zhì)進(jìn)行了對(duì)比分析;接著,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序比較了兩個(gè)品種牛背最長(zhǎng)肌轉(zhuǎn)錄組差異,挖掘差異表達(dá)基因和潛在影響肉質(zhì)的生物學(xué)通路;最后,通過(guò)基因組重測(cè)序技術(shù)明確了到目前階段為止新疆褐牛選育過(guò)程中受人為選擇的基因,并利用轉(zhuǎn)錄組及基因組測(cè)序結(jié)果聯(lián)合分析的方法明確了新疆褐牛選育過(guò)程中有關(guān)肉質(zhì)性狀的分子改良進(jìn)展,主要結(jié)果如下:1、新疆褐牛與哈薩克牛群體間屠宰及胴體性狀、肉質(zhì)性狀對(duì)比分析發(fā)現(xiàn),新疆褐牛產(chǎn)肉性能、體表脂肪沉積、胴體指標(biāo)優(yōu)于哈薩克牛;新疆褐牛部位肉剪切力值、蒸煮損失等肉質(zhì)性狀好于哈薩克牛。2、RNA高通量測(cè)序表明,哈薩克牛與新疆褐牛背最長(zhǎng)肌存在673個(gè)差異表達(dá)基因,其中在哈薩克牛中高表達(dá)的共286個(gè),在新疆褐牛高表達(dá)的共387個(gè)。其中,(1)ABLIM2、ACTB、ARPC1A、DNAAF1、C...
【文章來(lái)源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:209 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
英文縮略詞表
前言
第一篇 文獻(xiàn)綜述
第1章 新疆褐牛遺傳改良進(jìn)展
1.1 無(wú)序雜交的改良階段(20世紀(jì)初-1949年)
1.2 有序?qū)氲倪x育階段(1950年至1976年)
1.3 品種形成的登記階段(1977-1986年)
1.4 選育提高的擴(kuò)群階段(1987-2006年)
1.5 專用品系的培育階段(2007年至今)
第2章 高通量測(cè)序技術(shù)在牛生產(chǎn)中的應(yīng)用
2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)在牛業(yè)生產(chǎn)與研究中的應(yīng)用
2.2 全基因組測(cè)序技術(shù)在牛業(yè)生產(chǎn)與研究中的應(yīng)用
第二篇 研究?jī)?nèi)容
第1章 新疆褐牛產(chǎn)肉能力及肉品質(zhì)綜合評(píng)價(jià)
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.3 結(jié)果與分析
1.4 討論
1.5 小結(jié)
第2章 新疆褐牛與哈薩克牛背最長(zhǎng)肌差異表達(dá)基因研究
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.3 結(jié)果與分析
2.4 討論
2.5 小結(jié)
第3章 新疆褐牛與哈薩克牛不同部位肉功能基因差異表達(dá)研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.3 結(jié)果與分析
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第4章 新疆褐牛和哈薩克牛全基因組測(cè)序
4.1 材料與方法
4.2 結(jié)果與分析
4.3 討論
4.4 小結(jié)
第5章 利用基因組及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)分析新疆褐牛選育進(jìn)程
5.1 材料與方法
5.2 結(jié)果與分析
5.3 討論
5.4 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附表
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
作者簡(jiǎn)介
攻讀博士期間取得的科研成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Proteomic analysis reveals dysregulated cell signaling in ejaculated spermatozoa from infertile men[J]. Luna Samanta,Rakesh Sharma,Zhihong Cui,Ashok Agarwal. Asian Journal of Andrology. 2019(02)
[2]Contactins in the central nervous system: role in health and disease[J]. Madhurima Chatterjee,Detlev Schild,Charlotte E.Teunissen. Neural Regeneration Research. 2019(02)
[3]新疆褐牛導(dǎo)入安格斯基因后生產(chǎn)性能研究[J]. 李娜,崔繁榮,閆向民,張金山,李紅波,葉治兵,杜瑋,袁理星,張楊. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2018(05)
[4]不同月齡去勢(shì)對(duì)新疆褐牛公牛增重及產(chǎn)肉性能的影響[J]. 閆向民,耿娟,安堯汶,李紅波,張金山,張楊. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(13)
[5]新疆褐;蛲怙@子多態(tài)性及其與SCS和泌乳性狀關(guān)聯(lián)性分析[J]. 劉麗元,周靖航,張夢(mèng)華,李金霞,方季青,譚世新,王愛(ài)芳,黃錫霞,王雅春. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(13)
[6]新疆褐牛和美新褐牛F1不同泌乳月產(chǎn)奶量差異研究[J]. 熱沙來(lái)提·托乎塔尤甫,吐?tīng)栠d江·吾木爾艾力,馬軍,道吾然·托力干. 新疆畜牧業(yè). 2017(03)
[7]新疆褐牛Leptin基因外顯子Ⅱ E2JW多態(tài)性與體尺性狀的相關(guān)性研究[J]. 薩吉代姆·麥麥提,李娜,王金泉,李紅波,馮亮,張金山,閆向民,周振勇,張楊,姚剛. 家畜生態(tài)學(xué)報(bào). 2017(01)
[8]不同肉用品種牛與新疆褐牛最佳雜交組合篩選試驗(yàn)[J]. 全靈,范守民,策仁道爾吉,納進(jìn)程. 畜牧與飼料科學(xué). 2016(05)
[9]不同月齡新疆褐牛閹牛胴體性狀及肉品質(zhì)比較研究[J]. 閆向民,張金山,李紅波,李娜,杜瑋,周振勇,張楊. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2015(11)
[10]新疆褐牛公牛與閹牛產(chǎn)肉性能和肉品質(zhì)比較研究[J]. 閆向民,李娜,張金山,周振勇,李紅波,杜瑋,邵偉. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2015(06)
博士論文
[1]miRNA、mRNA調(diào)控新疆褐牛和哈薩克牛肉質(zhì)成脂性狀分子機(jī)制研究[D]. 李娜.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]廣西巴馬小型豬全基因組測(cè)序及分析研究[D]. 張?bào)?廣西大學(xué) 2019
[3]全基因組測(cè)序揭示牛屬物種的進(jìn)化關(guān)系和適應(yīng)性基因滲透[D]. 王勝.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
碩士論文
[1]利用全基因組測(cè)序技術(shù)篩選影響鴨羽色、喙色及蹼色的候選基因及其關(guān)聯(lián)驗(yàn)證[D]. 余維立.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
本文編號(hào):3161423
【文章來(lái)源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:209 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
英文縮略詞表
前言
第一篇 文獻(xiàn)綜述
第1章 新疆褐牛遺傳改良進(jìn)展
1.1 無(wú)序雜交的改良階段(20世紀(jì)初-1949年)
1.2 有序?qū)氲倪x育階段(1950年至1976年)
1.3 品種形成的登記階段(1977-1986年)
1.4 選育提高的擴(kuò)群階段(1987-2006年)
1.5 專用品系的培育階段(2007年至今)
第2章 高通量測(cè)序技術(shù)在牛生產(chǎn)中的應(yīng)用
2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)在牛業(yè)生產(chǎn)與研究中的應(yīng)用
2.2 全基因組測(cè)序技術(shù)在牛業(yè)生產(chǎn)與研究中的應(yīng)用
第二篇 研究?jī)?nèi)容
第1章 新疆褐牛產(chǎn)肉能力及肉品質(zhì)綜合評(píng)價(jià)
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.3 結(jié)果與分析
1.4 討論
1.5 小結(jié)
第2章 新疆褐牛與哈薩克牛背最長(zhǎng)肌差異表達(dá)基因研究
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.3 結(jié)果與分析
2.4 討論
2.5 小結(jié)
第3章 新疆褐牛與哈薩克牛不同部位肉功能基因差異表達(dá)研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.3 結(jié)果與分析
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第4章 新疆褐牛和哈薩克牛全基因組測(cè)序
4.1 材料與方法
4.2 結(jié)果與分析
4.3 討論
4.4 小結(jié)
第5章 利用基因組及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)分析新疆褐牛選育進(jìn)程
5.1 材料與方法
5.2 結(jié)果與分析
5.3 討論
5.4 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附表
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
作者簡(jiǎn)介
攻讀博士期間取得的科研成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Proteomic analysis reveals dysregulated cell signaling in ejaculated spermatozoa from infertile men[J]. Luna Samanta,Rakesh Sharma,Zhihong Cui,Ashok Agarwal. Asian Journal of Andrology. 2019(02)
[2]Contactins in the central nervous system: role in health and disease[J]. Madhurima Chatterjee,Detlev Schild,Charlotte E.Teunissen. Neural Regeneration Research. 2019(02)
[3]新疆褐牛導(dǎo)入安格斯基因后生產(chǎn)性能研究[J]. 李娜,崔繁榮,閆向民,張金山,李紅波,葉治兵,杜瑋,袁理星,張楊. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2018(05)
[4]不同月齡去勢(shì)對(duì)新疆褐牛公牛增重及產(chǎn)肉性能的影響[J]. 閆向民,耿娟,安堯汶,李紅波,張金山,張楊. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(13)
[5]新疆褐;蛲怙@子多態(tài)性及其與SCS和泌乳性狀關(guān)聯(lián)性分析[J]. 劉麗元,周靖航,張夢(mèng)華,李金霞,方季青,譚世新,王愛(ài)芳,黃錫霞,王雅春. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(13)
[6]新疆褐牛和美新褐牛F1不同泌乳月產(chǎn)奶量差異研究[J]. 熱沙來(lái)提·托乎塔尤甫,吐?tīng)栠d江·吾木爾艾力,馬軍,道吾然·托力干. 新疆畜牧業(yè). 2017(03)
[7]新疆褐牛Leptin基因外顯子Ⅱ E2JW多態(tài)性與體尺性狀的相關(guān)性研究[J]. 薩吉代姆·麥麥提,李娜,王金泉,李紅波,馮亮,張金山,閆向民,周振勇,張楊,姚剛. 家畜生態(tài)學(xué)報(bào). 2017(01)
[8]不同肉用品種牛與新疆褐牛最佳雜交組合篩選試驗(yàn)[J]. 全靈,范守民,策仁道爾吉,納進(jìn)程. 畜牧與飼料科學(xué). 2016(05)
[9]不同月齡新疆褐牛閹牛胴體性狀及肉品質(zhì)比較研究[J]. 閆向民,張金山,李紅波,李娜,杜瑋,周振勇,張楊. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2015(11)
[10]新疆褐牛公牛與閹牛產(chǎn)肉性能和肉品質(zhì)比較研究[J]. 閆向民,李娜,張金山,周振勇,李紅波,杜瑋,邵偉. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2015(06)
博士論文
[1]miRNA、mRNA調(diào)控新疆褐牛和哈薩克牛肉質(zhì)成脂性狀分子機(jī)制研究[D]. 李娜.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]廣西巴馬小型豬全基因組測(cè)序及分析研究[D]. 張?bào)?廣西大學(xué) 2019
[3]全基因組測(cè)序揭示牛屬物種的進(jìn)化關(guān)系和適應(yīng)性基因滲透[D]. 王勝.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
碩士論文
[1]利用全基因組測(cè)序技術(shù)篩選影響鴨羽色、喙色及蹼色的候選基因及其關(guān)聯(lián)驗(yàn)證[D]. 余維立.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
本文編號(hào):3161423
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