牦牛是分布在青藏高原及其瀕臨的高山、亞高山地區(qū)的特有牛種。牦牛的遺傳多樣性及起源問題,是近年來牦�？茖W(xué)研究中的熱點(diǎn)問題之一。當(dāng)前,牦牛的遺傳多樣性及起源研究大多來自線粒體基因組和核基因組常染色體遺傳變異的信息,而基于Y染色體序列變異（即父系遺傳信息）的研究相對較少。本研究采用PCR產(chǎn)物直接測序和微衛(wèi)星（STR）基因型分型技術(shù)篩選牦牛Y-SNP和Y-STR多態(tài)標(biāo)記,基于這2種多態(tài)標(biāo)記的聯(lián)合分析,確定牦牛Y染色體單倍型。以家牦牛11個地方品種（即九龍、麥洼、娘亞、斯布、帕里、高原、環(huán)湖、甘南、巴州、中甸和天祝牦牛）、1個培育品種（即大通牦牛）和3個群體（即塔縣、雪多和類烏齊牦牛）共682頭公牦牛和8頭野牦牛公牛為研究對象,對其Y染色體遺傳變異、父系遺傳多樣性、譜系地理結(jié)構(gòu)、分化、聚類關(guān)系、分子變異（AMOVA）及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系等進(jìn)行綜合分析,獲得如下結(jié)果:1)通過對5個牦牛Y-SNPs標(biāo)記（即SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3和OFD1Y10）進(jìn)行測序分析,在確認(rèn)先前報道的6個Y-SNPs基礎(chǔ)上,本研究首次在牦牛OFD1Y10標(biāo)記發(fā)現(xiàn)4個新的Y-SNPs。通過篩選40個普通牛Y-... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：107 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

牦牛線粒體基因組結(jié)構(gòu)簡圖

用 SPSS 17.0 軟件基于 Rst 值遺傳距離矩陣，l Scaling，MDS）分析，探究牦牛品種（群體）的聚.6.1.5 軟件（Bandelt et al. 1999）被用于構(gòu)建牦牛 Yining，MJ）網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖，以確定不同單倍型間的系異被給予不同的加權(quán)（W），其中轉(zhuǎn)換為 W=10，顛酸變異具有較高的權(quán)重分配（Ginja et al. 2009; Li et a傳的研究報道（Li et al. 2007），牦牛 Y-STR 標(biāo)記根不同的權(quán)重分配。A 檢測 DNA 經(jīng) 1.5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測，結(jié)果如圖 2無降解和蛋白污染現(xiàn)象，可開展后續(xù) PCR 擴(kuò)增實(shí)

31圖 2-2 牦牛 5 個 Y-SNPs 標(biāo)記中 10 個 SNPs 位點(diǎn)的測序峰圖。圖中 g～j 為本研究在 OFD1Y1標(biāo)記上新發(fā)現(xiàn)的 4 個 SNPs 位點(diǎn)測序峰圖Figure 2-2 The sequencing maps of the five yak Y-SNPs markers having 10 SNPs. The four newSNPs found in OFD1Y10 marker in this study were showed in figures g, h, i and j.(i) OFD1Y10（g. 608G>T）(j) OFD1Y10（g. 653G>C）

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號：3141849