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對蝦抗脂多糖因子ALF的功能分析和開發(fā)利用

發(fā)布時間:2020-06-01 08:42
【摘要】:對蝦是重要的水產(chǎn)養(yǎng)殖品種之一,由于各類病害的爆發(fā),對對蝦養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。對蝦抵御病原入侵的主要方式是啟動先天免疫應(yīng)答系統(tǒng),通過產(chǎn)生免疫效應(yīng)分子,來清除各種病原?咕淖鳛閷ξr免疫應(yīng)答反應(yīng)產(chǎn)生的一類重要的效應(yīng)分子,在清除感染的外來病原的過程中起著重要作用?怪嗵且蜃(Anti-lipopolysaccharride factor,ALF)作為對蝦的一類重要的抗菌肽,在先天性免疫系統(tǒng)中起著重要作用。前期的研究表明,在中國對蝦體內(nèi)存在7種不同的ALF基因,其抗菌和抗WSSV活性存在著明顯差別,但是對于不同ALF的結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,以及抑菌和抗病毒的作用機(jī)理了解較少,亟待深入研究。另外,由于傳統(tǒng)抗生素導(dǎo)致的細(xì)菌耐藥性的問題日益引起大家的關(guān)注,尋找新型抗菌活性物質(zhì)來替代傳統(tǒng)抗生素的需求更加迫切。抗菌肽由于其抗菌機(jī)理與傳統(tǒng)抗生素存在明顯差別,不會引起細(xì)菌耐藥性的問題,被認(rèn)為是抗生素的理想替代物。本論文為解決未來可能的應(yīng)用問題,通過對ALF的結(jié)構(gòu)進(jìn)行改造,以提高ALF的抗菌活性;同時也通過利用合成生物學(xué),原核和真核重組表達(dá)等方法,獲得了具有較高生物學(xué)活性的抗菌肽重組蛋白。本研究為抗菌肽產(chǎn)品的研發(fā),實(shí)現(xiàn)其在醫(yī)藥或水產(chǎn)養(yǎng)殖中的應(yīng)用奠定了重要基礎(chǔ)。主要研究進(jìn)展如下:1.通過分析中國對蝦7種不同ALF的脂多糖結(jié)合結(jié)構(gòu)域(LPS binding domain,LBD)短肽的理化特征和功能活性的關(guān)系,推測LBD短肽中堿性氨基酸的數(shù)量以及親水和疏水氨基酸的空間排布共同決定著LBD短肽的抑菌活性。為證實(shí)此推斷,按照以上原則設(shè)計合成了一系列短肽,并對其最小抑菌濃度(MIC)和最小殺菌濃度(MBC)進(jìn)行了檢測,結(jié)果表明,有些結(jié)構(gòu)改造后的短肽殺菌能力明顯提高,在2-4μM的濃度下即可殺滅大腸桿菌,溶藻弧菌和哈維氏弧菌等,且對大部分革蘭氏陰性菌和革蘭氏陽性菌都具有一定的抑制效果。對這些改造后的LBD短肽的生物學(xué)活性和殺菌機(jī)理進(jìn)一步分析,結(jié)果表明,這些短肽具有很好的熱穩(wěn)定性,即使經(jīng)過了熱處理仍能在短時間內(nèi)殺滅細(xì)菌,其活性未發(fā)生明顯改變。通過對LBD短肽處理過的細(xì)菌進(jìn)行觀察,發(fā)現(xiàn)LBD短肽是通過破壞細(xì)菌的細(xì)胞外膜,導(dǎo)致胞質(zhì)外溢而殺滅細(xì)菌的。圓二相色譜分析的結(jié)果表明,LBD短肽呈典型的β-sheet結(jié)構(gòu)。以上研究結(jié)果為高活性抗菌肽的設(shè)計和改造提供了重要依據(jù)。2.針對中國對蝦7種ALFs中的一種類型—Fc ALF5,其對大腸桿菌無抑制活性,而對WSSV有抑制活性的特點(diǎn),利用原核重組表達(dá)系統(tǒng)成功獲得了具有明顯抗WSSV活性的重組蛋白,并進(jìn)一步探討了其抗WSSV的作用機(jī)理。以重組的Fc ALF5為誘餌蛋白,利用Far Western Blot獲得了與其存在相互作用的WSSV蛋白,經(jīng)過LC-MS/MS分析鑒定,發(fā)現(xiàn)該蛋白與WSSV的囊膜蛋白VP24具有最高的相似性。進(jìn)一步利用原核重組表達(dá)獲得了VP24重組蛋白,利用點(diǎn)雜交和Far Western Blot驗(yàn)證了Fc ALF5與WSSV的VP24存在相互作用,同時利用FcALF5的LBD短肽也證實(shí)了其與VP24的相互作用。由于VP24是WSSV入侵細(xì)胞的一種重要的囊膜蛋白,因此推斷Fc ALF5發(fā)揮抗WSSV作用主要是通過LBD結(jié)構(gòu)域和VP24的相互作用來實(shí)現(xiàn)的。3.對FcALF2的LBD進(jìn)行結(jié)構(gòu)改造,抗菌活性明顯提高的一種類型(LBDv),替換對蝦Fc ALF2基因原有的結(jié)構(gòu)功能域,并結(jié)合酵母系統(tǒng)密碼子的偏好性,利用生物合成的方法合成該基因,并對該基因在宿主菌畢赤酵母GS115進(jìn)行重組表達(dá),成功獲得了目的蛋白。對重組表達(dá)獲得的蛋白進(jìn)行抗菌活性分析,結(jié)果表明,該蛋白具有明顯的抗菌和抗WSSV活性。此系統(tǒng)的建立為利用體外真核表達(dá)系統(tǒng)獲得重組蛋白并在生產(chǎn)上應(yīng)用奠定了重要基礎(chǔ),也為抗菌肽藥物的開發(fā)和利用提供了重要參考。
【圖文】:

對蝦,產(chǎn)量統(tǒng)計,全球


第一章 文獻(xiàn)綜述1.1 前言對蝦屬于節(jié)肢動物門,甲殼動物亞門,是水產(chǎn)養(yǎng)殖的重要養(yǎng)殖品種,給水產(chǎn)業(yè)帶來了巨大的經(jīng)濟(jì)效益。對蝦的蛋白質(zhì)含量高,脂肪含量低,且含有多種維生素及微量元素,是優(yōu)質(zhì)水產(chǎn)品的代表之一,并深受人們喜愛。隨著生活水平的提升,對蝦需求量的日益增長,世界對蝦市場依然呈現(xiàn)供不應(yīng)求的局面。因此對蝦的人工養(yǎng)殖,在最近二十年間,有了突飛猛進(jìn)的增長。根據(jù)聯(lián)合國糧農(nóng)組織 FAO統(tǒng)計,全球?qū)ξr產(chǎn)量(包括人工養(yǎng)殖量和捕撈量)由 1970 年的 9000 噸左右,發(fā)展到 2006 年的 315 萬噸。最近幾年,全球?qū)ξr的產(chǎn)量也保持在 350 萬噸以上,具體統(tǒng)計數(shù)據(jù)見于圖 1.1 所示。隨著我國對蝦產(chǎn)量的逐年上升,在趕超泰國后,已經(jīng)成為對蝦養(yǎng)殖的第一大國。

對蝦,病害,產(chǎn)量,對蝦養(yǎng)殖


(Tsai et al., 1999)。該病主要是由對蝦白斑綜合癥病毒(white spot syndrome virus,WSSV)引起(Kanchanaphum et al., 1998)。WSSV 是一種含有囊膜的 DNA 病毒,,該病毒感染對蝦后,能夠造成對蝦在短時間內(nèi)大量死亡,給對蝦養(yǎng)殖帶來致命性的災(zāi)難。雖然大量的研究嘗試著解決這一難題,但是目前仍沒有有效的方法,主要以預(yù)防為主(Liu et al., 2009; Robalino et al., 2007)。此外還有黃頭病毒(yellowhead virus,YHV)導(dǎo)致的對蝦黃頭。╕HD)(Brown et al., 2012),偷死病毒(covertmortality nodavirus,CMNV)引起的偷死病(CMD)(Zhang et al., 2014),小孢蟲寄生蟲(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)引起的肝胰腺微孢子蟲病(HPM)(Chayaburakul et al., 2004; Tourtip et al., 2009),林查辛格病毒(Laem Singh virus,LSNV)導(dǎo)致的斑節(jié)對蝦慢大癥(Monodon slow growth syndrome,MSGS)(Pratoomthai et al., 2008)等。總之,各種蝦類病原體的出現(xiàn),給對蝦養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的發(fā)展帶來了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。因此為了有效地降低對蝦病害的爆發(fā),減少病害所帶來的損失,需要對對蝦的免疫系統(tǒng)和抗病機(jī)理進(jìn)行系統(tǒng)的研究。
【學(xué)位授予單位】:中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S917.4

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本文編號:2691232

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