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結(jié)球甘藍高密度遺傳圖譜構(gòu)建及耐裂球、球色、球形基因定位

發(fā)布時間:2019-05-15 01:56
【摘要】:葉球作為甘藍的商品和食用器官,類型豐富、形態(tài)多樣、營養(yǎng)價值高。近年來,市場上對其葉球的外觀商品品質(zhì)愈加重視,不僅要求甘藍球形美觀、球色綠、還要耐裂球、耐儲運。目前有關甘藍耐裂球、球色及球形相關性狀的研究尚處于起步階段,對其遺傳規(guī)律、相關基因定位研究及耐裂新品種選育亟待進行。 本研究在制定甘藍耐裂球評價方法的基礎上,比較不同耐裂球性甘藍細胞壁組分及相關酶代謝變化規(guī)律,初步探索外源噴施CaCl2和GA3對減緩裂球的影響;利用耐裂球、球色及球形存在顯著差異的親本配制F1,通過游離小孢子培養(yǎng)構(gòu)建DH群體;以DH群體為試材,揭示耐裂球、球色及球形相關性狀遺傳規(guī)律;同時構(gòu)建SSR, Indel圖譜和基于DH群體重測序構(gòu)建的超高密度SNP圖譜,結(jié)合兩年重復表型數(shù)據(jù)對相關性狀定位和基因預測。為深入研究葉球相關性狀遺傳機理及遺傳改良和相關基因的克隆奠定理論基礎。主要結(jié)果如下: 1.制定了甘藍耐裂球評價方法,通過對74份甘藍材料進行耐裂球鑒定,篩選獲得不同耐裂性種質(zhì)資源;不同耐裂球性甘藍葉球生長發(fā)育期細胞壁組分含量及相關酶活性變化規(guī)律不同,耐裂球甘藍整個生長發(fā)育期纖維素、原果膠含量顯著高于易裂球,而纖維素酶、果膠酶活性低于易裂球,且變化較緩和,這種差異在葉球成熟期表現(xiàn)最大;外源噴施CaCl2及GA3對易裂甘藍無影響,從結(jié)球初期至葉球成熟多次噴施,能夠減緩中耐材料的裂球率和裂球指數(shù)。 2.以耐裂球、球色及球形相關性狀存在顯著差異的4個高代自交系為親本配置2個F1,通過游離小孢子培養(yǎng)技術構(gòu)建了兩個永久DH群體,結(jié)合主基因/多基因混合遺傳分離分析及相關性分析,明確了甘藍耐裂球、球色及球形相關性狀的遺傳模式及重要農(nóng)藝性狀間相關關系。 3.以上述DH群體為作圖群體,構(gòu)建了2張SSR/Indel傳統(tǒng)遺傳圖譜。同時,通過對其中一個DH群體及雙親全基因組重測序,結(jié)合生物信息學分析,構(gòu)建了一張包含42901個SNP位點(1741個bins,平均每個bin包含24.8個SNP),總長度為798.8cM,平均圖距為0.46cM永久SNP遺傳圖譜,該圖譜是目前甘藍類蔬菜最飽和的一張參考圖譜,不僅可以用于甘藍重要性狀的精細定位、比較基因組學研究,還能夠輔助甘藍基因組序列的拼接、組裝及糾錯。 4.利用上述圖譜,結(jié)合兩年的表型數(shù)據(jù),共定位了33個與耐裂球、球色及球形相關的QTLs,分布于甘藍的9條染色體上,部分位點控制多個相關性狀。各相關性狀主效QTL位點不同年份、不同圖譜間均能被穩(wěn)定檢測到,不受環(huán)境條件的影響;部分微效位點由于受環(huán)境條件的影響,重復定位結(jié)果略有差異,不同年份及不同圖譜間定位結(jié)果互相補充。 5.針對高密度SNP圖譜中穩(wěn)定存在的主效位點結(jié)合甘藍基因組數(shù)據(jù)和基因注釋結(jié)果,篩選獲得3個與細胞壁組分合成、Ca2+通道蛋白相關的基因,這3個基因可能與甘藍耐裂球密切相關;篩選獲得4個與葉綠體形成,葉綠素合成或降解基因,這4個基因可能與甘藍球色密切相關。
[Abstract]:......
【學位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:S635.1

【參考文獻】

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本文編號:2477228

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