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絨山羊胎兒期毛囊發(fā)育相關(guān)microRNA的篩選與鑒定

發(fā)布時間:2018-11-05 19:33
【摘要】:內(nèi)蒙古絨山羊具有優(yōu)良的產(chǎn)絨性狀,是寶貴的種質(zhì)遺傳資源,因此研究絨山羊的絨毛發(fā)育機理,探尋與絨毛生長相關(guān)的重要候選基因就顯得尤為重要。本研究采集了絨山羊10個不同時期的胎兒皮膚,根據(jù)前期研究結(jié)果對絨山羊胎兒皮膚毛囊啟動、生長發(fā)育3個關(guān)鍵時期45天、55天和65天的絨山羊胎兒的體側(cè)皮膚(相同時期的3個樣本當作生物學重復(fù))的RNA樣本,等量混合后進行高通量組測序,并對結(jié)果進行生物信息學分析及熒光定量PCR(qPCR)驗證。試驗結(jié)果顯示:1、運用高通量測序方法獲得絨山羊不同胎兒期皮膚毛囊microRNA和mRNA表達數(shù)據(jù)。oar-let-7和oar-miR-200家族的microRNA在妊娠55天和妊娠65天樣本中,都相對于妊娠45天顯著上調(diào),暗示其可能是毛囊發(fā)育中關(guān)鍵的microRNA。2、應(yīng)用生物信息學分析預(yù)測oar-let-7和oar-miR-200的靶基因為GLDC、GPM6A、LRP。3、試驗采用熒光定量PCR技術(shù)對絨山羊胎兒期皮膚毛囊測序結(jié)果中關(guān)鍵的microRNA進行驗證,結(jié)果顯示定量結(jié)果表達趨勢跟測序結(jié)果的基本一致。4、對預(yù)測的靶基因進行驗證,45天、55天、65天、75天、85天、95天、105天、115天、125天、135天十個時期預(yù)測的三個靶基因GLDC、GPM6A、LRP均有表達,在一定程度上說明了這些靶基因?qū)τ谡{(diào)控絨山羊胎兒期皮膚毛囊發(fā)育有明顯作用。
[Abstract]:Inner Mongolia cashmere goats are valuable germplasm genetic resources, so it is very important to study the mechanism of cashmere development and to search for important candidate genes related to the growth of cashmere in Inner Mongolia Cashmere Goat (Inner Mongolia Cashmere Goat). In this study, 10 fetal skin samples were collected from cashmere goats at different stages. According to the results of previous studies, the hair follicles of cashmere goats fetal skin were started, and the growth and development of fetal hair follicles were carried out for 45 days. RNA samples from the body side skin of the 55-day and 65-day cashmere goat fetuses (three samples from the same period as biological duplicates) were mixed in the same amount and sequenced in the high-throughput group. The results were analyzed by bioinformatics and verified by fluorescence quantitative PCR (qPCR). The results showed that: 1. The data of microRNA and mRNA expression in hair follicles of cashmere goats at different fetal stages were obtained by high-throughput sequencing. MicroRNA from oar-let-7 and oar-miR-200 families were collected on day 55 and day 65 of gestation. Both were significantly up-regulated relative to 45 days of pregnancy, implying that they may be key to hair follicle development by using bioinformatics analysis to predict the target bases of oar-let-7 and oar-miR-200 because of GLDC,GPM6A,LRP.3,. Fluorescence quantitative PCR technique was used to verify the key microRNA of hair follicle sequencing in fetal cashmere goat. The results showed that the trend of quantitative expression was basically the same as that of sequencing. 4. The predicted target gene was verified for 45 days. The three target genes GLDC,GPM6A,LRP were expressed in 55 days, 65 days, 75 days, 85 days, 95 days, 105 days, 115 days, 125 days and 135 days. To some extent, these target genes play an important role in regulating the development of hair follicles in cashmere goats.
【學位授予單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S827

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

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本文編號:2313152

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