本文關(guān)鍵詞：牦牛馴化的基因組學(xué)證據(jù)

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【摘要】：動物的馴化為人類提供了穩(wěn)定可靠的食物來源,促進(jìn)了人口的增長,推動了人類生活方式由狩獵采集向放牧或農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的模式轉(zhuǎn)變,在人類社會變遷和歷史文化發(fā)展過程中起到了關(guān)鍵作用。牦牛(Bos grunniens)是中國西部高寒高海拔地區(qū)特有的家畜,也是青藏高原地區(qū)的關(guān)鍵物種,目前全世界擁有超過2200萬頭,其中95%分布在我國青藏高原地區(qū)。家養(yǎng)牦牛對高海拔地區(qū)嚴(yán)寒、缺氧、缺草等惡劣條件具有良好的適應(yīng)能力,能夠高效地利用高寒草地的牧草資源,不僅為當(dāng)?shù)啬撩裉峁┝松嫠璧氖澄�、衣物、燃料、畜力等各類生產(chǎn)和生活資源,更是藏傳佛教宗教習(xí)俗的重要組成部分。而家養(yǎng)牦牛的野生祖先野生牦�，F(xiàn)今依然存活,使得牦牛成為研究大型家養(yǎng)動物馴化的極佳模式物種。本文在已完成的牦�；蚪M和十幾年積累的大量野生和家養(yǎng)牦牛樣品的基礎(chǔ)上,從基因組水平對牦牛馴化的遺傳機制進(jìn)行了深入研究,并分析了人工選擇作用和氣候變遷對牦牛種群遺傳結(jié)構(gòu)和群體歷史的影響。通過利用第二代高通量測序技術(shù),我們完成了84頭野生和家養(yǎng)牦牛的全基因組測序工作,產(chǎn)生了2.16 Tb的原始數(shù)據(jù),測序總深度高達(dá)814.7×,平均覆蓋了全基因組98%以上的區(qū)域,構(gòu)建了超過1456萬個位點的牦牛全基因組遺傳變異圖譜。在此基礎(chǔ)上,詳細(xì)解析了野生和家養(yǎng)牦牛的遺傳變異、群體結(jié)構(gòu)信息以及人工選擇作用在家養(yǎng)牦�；蚪M上留下的印記。我們發(fā)現(xiàn)野生與家養(yǎng)牦牛具有相似的核苷酸多態(tài)性并且遺傳分化程度很小:野生與家養(yǎng)牦牛核苷酸多態(tài)性(π)分別為0.0013和0.0014,遺傳分化指數(shù)(FST)僅為0.058。我們進(jìn)一步從家養(yǎng)牦牛基因組中識別出182個受到了強烈人工選擇的區(qū)域,這些基因組區(qū)域共包含209個蛋白編碼基因,主要與溫順行為等相關(guān)。此外,我們還比較了天祝白牦牛和其他家養(yǎng)牦牛的基因組差異,識別出一些與毛色相關(guān)的區(qū)域,這些區(qū)域可能與近130年來對白牦牛的人工育種過程有關(guān)。通過重新構(gòu)建牦牛馴化的群體動態(tài)和群體分化歷史,我們發(fā)現(xiàn)牦牛馴化事件開始于約7300年前,并檢測到家養(yǎng)牦牛有效群體大小在3600年前增長了6倍。此前的人類考古學(xué)及遺傳學(xué)數(shù)據(jù)顯示,青藏高原史前人群分別在10000~7000年前和4000~3000年前經(jīng)歷過兩次大規(guī)模的增長,這一時間與我們推測的牦牛馴化時間及其馴化過程中的群體動態(tài)變化相吻合。青藏高原部分游牧人群至今仍依賴牦牛通過游牧的方式而長期生存和居住在高海拔地區(qū)。我們的結(jié)果顯示:牦牛的馴化為人類從季節(jié)性遷徙高原到以游牧方式永久定居青藏高原的生活方式轉(zhuǎn)變提供了生存基礎(chǔ);馴化牦牛群體的大規(guī)模擴(kuò)張還與該地區(qū)農(nóng)業(yè)技術(shù)的引入、依賴農(nóng)業(yè)生產(chǎn)技術(shù)手段的長期定居以及人類群體增長高度關(guān)聯(lián)。這些結(jié)果表明牦牛馴化對早期人類永久性地征服青藏高原地區(qū)和隨后的社會穩(wěn)定發(fā)展起到了至關(guān)重要的作用。
【學(xué)位授予單位】：蘭州大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S823.85

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1 ;Mechanical responses of osteoblastS in hard scaffold subjected direct compression during bone tissue engineering[A];第八屆全國生物力學(xué)學(xué)術(shù)會議論文集[C];2006年

2 Wang Qingbo;Guo Wei;Zhang Chunlei;Feng Guoying;Zhang Luping;Huang Fei;;Comparative study of different methods for preparing decellularized nerve scaffold[A];中國解剖學(xué)會2013年年會論文文摘匯編[C];2013年

3 Zhongjie Lu;Sheng Yan;Jun Pan;Shusen Zheng;;Decelluarized mouse liver scaffold can effeciently induce foxp3 espression in cd4+cd25-T cells[A];2013中國器官移植大會論文匯編[C];2013年

4 祝小雷;來魯華;;A Novel Method for Enzyme Design[A];第二屆全國“跨學(xué)科蛋白質(zhì)研究”學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2008年

5 Qiang-cheng Zeng;Yong Guo;;Cardiac tissue engineering scaffold of Small intestinal submucosa[A];第十屆全國生物力學(xué)學(xué)術(shù)會議暨第十二屆全國生物流變學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要匯編[C];2012年

6 Yong Zheng;Cunjie Zhang;Mohamed A.Soliman;Rick Bagshaw;Adrian Pasculescu;Lorne Taylor;Anna Y.Dai;Tony Pawson;;Regulation of protein signaling networks by the scaffold protein Shcl in time and space[A];第七屆全國醫(yī)學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)和第四屆全國臨床應(yīng)用生物化學(xué)與分子生物學(xué)聯(lián)合學(xué)術(shù)研討會暨醫(yī)學(xué)生化分會會員代表大會論文集[C];2011年

7 ;Determining the Molecular Basis for the pH-dependent Interaction between the PDZ of Human RGS12 and MEK2[A];華東六省一市生物化學(xué)與分子生物學(xué)會2008年學(xué)術(shù)交流會論文摘要匯編[C];2008年

8 David Chicheong Wan;;Novel acetylcholinesterase inhibitors S-aryl-6-(4-fluorobenzyl)-7H-thiazolo[3,2-b]-1,2,4-triazin-7-one derivatives:synthesis characterization and biological activity[A];2011年全國藥物化學(xué)學(xué)術(shù)會議——藥物的源頭創(chuàng)新論文摘要集[C];2011年

9 ;Fabrication and characterization of the gradient rib scaffold for tissue engineering[A];生物材料與再生醫(yī)學(xué)的現(xiàn)狀與未來——2010年第十屆上海地區(qū)醫(yī)用生物材料研討會論文摘要匯編[C];2010年

10 Maurice Garcia;Thomas Fandel;Alan Shindel;Ching-Shwun Lin;Tom F.Lue;;RePairing bladcler defect by adiPose tissue-derived stem cell[A];第十六屆全國泌尿外科學(xué)術(shù)會議論文集[C];2009年

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1 王理中;牦牛馴化的基因組學(xué)證據(jù)[D];蘭州大學(xué);2016年

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本文編號：1304735