發(fā)布時(shí)間：2024-02-24 09:15

　　目的基于GTEx、TCGA、GEO等公共數(shù)據(jù)庫明確MALAT1基因在胃癌中的表達(dá)情況,探討MALAT1在胃癌中的臨床意義,并探索干擾其表達(dá)水平后對(duì)胃癌細(xì)胞株BGC-823的增殖、侵襲、遷移及EMT進(jìn)程的影響。方法基于TCGA及GTEx數(shù)據(jù)庫探索MALAT1在206例正常胃黏膜組織樣本和375例胃癌組織樣本中的表達(dá)差異,明確胃癌組織中MALAT1的表達(dá)水平與患者臨床病例資料的關(guān)系。篩選差異基因并進(jìn)行GO分析及KEGG富集分析。應(yīng)用MEM數(shù)據(jù)庫篩選MALAT1共表達(dá)基因,并對(duì)其進(jìn)行GO分析及KEGG富集分析。應(yīng)用GEO數(shù)據(jù)庫及Kaplan-Meier Plotter在線分析工具分析MALAT1的表達(dá)水平與胃癌患者OS的關(guān)系。應(yīng)用RT-PCR技術(shù)檢測(cè)人胃癌細(xì)胞株MGC80-3、HGC-27、SGC-7901、BGC-823及人胃黏膜上皮細(xì)胞株GES-1的MALAT1表達(dá)水平。將人胃癌BGC-823細(xì)胞分為si-MALAT1組和陰性對(duì)照組即si-NC組。同時(shí)構(gòu)建MALAT1 siRNA和陰性對(duì)照siRNA,分別轉(zhuǎn)染至兩組BGC-823細(xì)胞中,干擾MALAT1基因的表達(dá)。應(yīng)用RT-PCR技術(shù)明確...

【文章頁數(shù)】：80 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
前言
一、基于公共數(shù)據(jù)庫探索MALAT1在胃癌及正常胃黏膜組織中的表達(dá)水平及臨床意義
    1.目的
    2.實(shí)驗(yàn)材料
    3.實(shí)驗(yàn)方法
        3.1 GTEx數(shù)據(jù)庫
        3.2 合并數(shù)據(jù)
        3.3 差異基因提取
        3.4 MALAT1表達(dá)水平及其與患者臨床病例資料的關(guān)系
        3.5 差異基因的GO分析和KEGG富集分析
        3.6 MALAT1共表達(dá)基因的篩選及其GO分析和KEGG富集分析
        3.7 MALAT1表達(dá)水平與患者預(yù)后的關(guān)系
    4.結(jié)果
        4.1 MALAT1在人體正常組織的表達(dá)水平及分布
        4.2 差異基因篩選
        4.3 胃癌中MALAT1的差異表達(dá)水平
        4.4 MALAT1與胃癌患者臨床病例資料的關(guān)系
        4.5 差異基因GO分析及KEGG分析
        4.6 MALAT1的共表達(dá)分析
        4.7 MALAT1生存分析
    5.小結(jié)
二、抑制MALAT1的表達(dá)水平對(duì)BGC-823細(xì)胞的影響及機(jī)制研究
    1.目的
    2.實(shí)驗(yàn)材料
        2.1 主要試劑
        2.2 儀器設(shè)備
        2.3 試劑配制
    3.實(shí)驗(yàn)方法
        3.1 細(xì)胞復(fù)蘇
        3.2 細(xì)胞培養(yǎng)
        3.3 細(xì)胞換液
        3.4 細(xì)胞傳代
        3.5 細(xì)胞收集及凍存
        3.6 細(xì)胞轉(zhuǎn)染
        3.7 細(xì)胞總RNA的提取
        3.8 RNA溶液的含量及濃度測(cè)定
        3.9 MALAT1cDNA第一鏈合成
        3.10 Real Time PCR
        3.11 CCK-8 細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)
        3.12 細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn)
        3.13 細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn)
        3.14 蛋白質(zhì)免疫印跡檢測(cè)
    4.實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        4.1 RT-PCR檢測(cè)MALAT1在各胃癌細(xì)胞株中的表達(dá)水平及各si-MALAT1的轉(zhuǎn)染效率
        4.2 CCK-8實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞增殖能力
        4.3 Transwell實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞的侵襲/遷移能力
        4.4 Western Blot實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞中EMT相關(guān)蛋白的表達(dá)水平
    5.小結(jié)
三、討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
在學(xué)期間研究成果



本文編號(hào)：3908765