分析食管基底細(xì)胞樣鱗癌(basaloid squamous cell carcinoma of the esophagus,BSCCE)的組織樣本基因表達(dá)情況,探討其病理學(xué)過程和腫瘤免疫逃逸機(jī)制,同時(shí)對(duì)BSCCE獨(dú)特的腫瘤微環(huán)境及潛在的臨床指標(biāo)在對(duì)其遠(yuǎn)期預(yù)后的病理基礎(chǔ)進(jìn)行討論,以期為臨床工作中更好的治療BSCCE提供一定的理論基礎(chǔ)。利用臨床術(shù)中獲取的組織樣本及其基因芯片數(shù)據(jù),進(jìn)一步獲取BSCCE組織樣本與同體正常組織樣本的基因差異表達(dá)情況(log|FC|≥2,p<0.05),其中BSCCE組織相對(duì)于正常組織的上調(diào)表達(dá)差異表達(dá)基因共489個(gè),下調(diào)差異表達(dá)基因922個(gè),利用DAVID在線分析系統(tǒng)對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行京都基因與基因組百科全書(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信號(hào)通路分析獲取對(duì)BSCCE組織病理情況相關(guān)的分析結(jié)果,進(jìn)一步利用STRING-OL工具對(duì)差異表達(dá)基因的可信度(可信度≥0.4)進(jìn)行篩選,獲取差異表達(dá)基因的蛋白質(zhì)相互作用分析(protein-protein interaction,PPI)結(jié)果,進(jìn)一步利用Cyt...

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圖3BSCCE下調(diào)差異基因通過STRINGonline工具構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)圖

圖4經(jīng)由Cytoscape構(gòu)建BSCCE上調(diào)差異基因的PPI分析Figure4Protein-proteininteractionnetworkgraphofdifferentialgenesconstructedviascreeningofup-regulatedgenesinBSCCEbycytoscape(2)

圖5經(jīng)由Cytoscape構(gòu)建BSCCE上調(diào)差異基因的PPI分析

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